Protein–RNA interactions for Protein: P98161

PKD1, Polycystin-1, humanhuman

Predictions only

Length 4,303 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKD1P98161 AL355310.3-201ENST00000526411 582 ntTSL 3 BASIC10.22□□□□□ -0.77
PKD1P98161 FKBP11-212ENST00000552878 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.22□□□□□ -0.77
PKD1P98161 NAT9-212ENST00000581136 1011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.22□□□□□ -0.77
PKD1P98161 MAPKAPK3-201ENST00000357955 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
PKD1P98161 MEIS3-206ENST00000559524 1828 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.22□□□□□ -0.77
PKD1P98161 APMAP-201ENST00000217456 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
PKD1P98161 TSC22D4-201ENST00000300181 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
PKD1P98161 CCDC142-201ENST00000290418 2835 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.22□□□□□ -0.77
PKD1P98161 TLE6-202ENST00000452088 1883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
PKD1P98161 CCDC144A-210ENST00000456009 2306 ntTSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
PKD1P98161 AC105020.1-201ENST00000435356 2205 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
PKD1P98161 AP000487.1-202ENST00000500185 2602 ntTSL 2 BASIC10.22□□□□□ -0.77
PKD1P98161 TESMIN-201ENST00000255087 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
PKD1P98161 SPATS2L-202ENST00000360760 2119 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
PKD1P98161 RAB1A-201ENST00000398529 1198 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
PKD1P98161 AC093433.1-201ENST00000458048 571 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
PKD1P98161 LYRM9-204ENST00000503642 432 ntTSL 3 BASIC10.21□□□□□ -0.77
PKD1P98161 NUP210P1-202ENST00000504322 710 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
PKD1P98161 ARL2-204ENST00000529384 830 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.21□□□□□ -0.77
PKD1P98161 RERG-205ENST00000537647 935 ntTSL 2 BASIC10.21□□□□□ -0.77
PKD1P98161 PRKXP1-201ENST00000561423 1122 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
PKD1P98161 APOBEC3H-206ENST00000613677 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
PKD1P98161 AP003419.4-201ENST00000616071 517 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
PKD1P98161 LINC01668-201ENST00000635001 513 ntTSL 4 BASIC10.21□□□□□ -0.77
PKD1P98161 NOS2P2-202ENST00000639528 1659 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
PKD1P98161 ZFAND6-211ENST00000559157 1559 ntTSL 2 BASIC10.21□□□□□ -0.77
PKD1P98161 LINGO1-204ENST00000561030 2677 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
PKD1P98161 CNBP-208ENST00000504813 1549 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC10.21□□□□□ -0.77
PKD1P98161 FAM49B-223ENST00000522746 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
PKD1P98161 DMAC2-210ENST00000592922 1622 ntTSL 2 BASIC10.21□□□□□ -0.77
PKD1P98161 COL5A1-AS1-201ENST00000371813 336 ntTSL 2 BASIC10.21□□□□□ -0.77
PKD1P98161 AIMP2-202ENST00000395236 860 ntTSL 2 BASIC10.21□□□□□ -0.77
PKD1P98161 AC069218.1-201ENST00000435269 762 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
PKD1P98161 CNN2P10-201ENST00000443067 918 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
PKD1P98161 USP40-206ENST00000443711 628 ntTSL 2 BASIC10.21□□□□□ -0.77
PKD1P98161 RN7SL11P-201ENST00000471305 293 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
PKD1P98161 AC090502.1-202ENST00000515416 966 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
PKD1P98161 ACR-203ENST00000529621 708 ntTSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
PKD1P98161 EEF1DP1-201ENST00000585891 896 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
PKD1P98161 PRCD-204ENST00000586148 630 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
PKD1P98161 PRCD-210ENST00000592014 462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
PKD1P98161 NFIX-214ENST00000592199 1509 ntTSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
PKD1P98161 RDM1-224ENST00000619262 1535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
PKD1P98161 RCOR3-204ENST00000452621 1827 ntTSL 2 BASIC10.21□□□□□ -0.77
PKD1P98161 AC092171.3-201ENST00000610122 2651 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
PKD1P98161 ATP6V0E2-212ENST00000611515 2565 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
PKD1P98161 PNMA6E-202ENST00000633844 2596 ntTSL 3 BASIC10.21□□□□□ -0.77
PKD1P98161 CNGA3-205ENST00000436404 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
PKD1P98161 KRT27-201ENST00000301656 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
PKD1P98161 KIFC3-201ENST00000379655 3427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
PKD1P98161 PKLR-201ENST00000342741 2083 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
PKD1P98161 ACSM2A-213ENST00000575690 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.21□□□□□ -0.78
PKD1P98161 KLK1-201ENST00000301420 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
PKD1P98161 PNRC1-203ENST00000369472 816 ntTSL 2 BASIC10.21□□□□□ -0.78
PKD1P98161 GAD1-203ENST00000375272 1252 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
PKD1P98161 RNA5SP486-201ENST00000515961 83 ntBASIC10.21□□□□□ -0.78
PKD1P98161 AP003171.2-201ENST00000528208 925 ntBASIC10.21□□□□□ -0.78
PKD1P98161 TNNT1-203ENST00000536926 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.78
PKD1P98161 AC107373.2-201ENST00000607735 490 ntBASIC10.21□□□□□ -0.78
PKD1P98161 AC247036.4-201ENST00000632099 353 ntAPPRIS P1 BASIC10.21□□□□□ -0.78
PKD1P98161 ZBTB45P2-201ENST00000452245 1531 ntBASIC10.21□□□□□ -0.78
PKD1P98161 TMEM222-210ENST00000608611 1511 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
PKD1P98161 FLAD1-203ENST00000315144 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
PKD1P98161 ZNF232-201ENST00000250076 2179 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.78
PKD1P98161 RAP1GAP-204ENST00000374761 3318 ntTSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.78
PKD1P98161 AL691432.1-201ENST00000596308 1422 ntBASIC10.21□□□□□ -0.78
PKD1P98161 RCAN3-210ENST00000618490 2386 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
PKD1P98161 AMT-233ENST00000636522 1620 ntTSL 2 BASIC10.21□□□□□ -0.78
PKD1P98161 CLDND1-215ENST00000507874 1380 ntTSL 3 BASIC10.21□□□□□ -0.78
PKD1P98161 TVP23C-201ENST00000225576 1527 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
PKD1P98161 BEX2-201ENST00000372674 668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.21□□□□□ -0.78
PKD1P98161 HLA-DQB2-229ENST00000411527 1059 ntBASIC10.21□□□□□ -0.78
PKD1P98161 MAGI2-AS3-208ENST00000446159 670 ntTSL 3 BASIC10.21□□□□□ -0.78
PKD1P98161 LINC00336-201ENST00000477984 2107 ntTSL 2 BASIC10.21□□□□□ -0.78
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PKD1P98161 YIF1B-215ENST00000592246 936 ntTSL 3 BASIC10.21□□□□□ -0.78
PKD1P98161 MALAT1-213ENST00000618227 593 ntTSL 3 BASIC10.21□□□□□ -0.78
PKD1P98161 MEI1-215ENST00000540833 2326 ntTSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.78
PKD1P98161 LFNG-207ENST00000614382 1969 ntTSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
PKD1P98161 ANKRD24-201ENST00000262970 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
PKD1P98161 ZNF618-203ENST00000374126 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
PKD1P98161 LHCGR-204ENST00000405626 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
PKD1P98161 IDH3G-203ENST00000370093 1662 ntTSL 2 BASIC10.2□□□□□ -0.78
PKD1P98161 AKIP1-201ENST00000299576 1247 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
PKD1P98161 NOL4L-202ENST00000326071 701 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
PKD1P98161 PSME1-202ENST00000382708 1136 ntTSL 2 BASIC10.2□□□□□ -0.78
PKD1P98161 AL590617.2-201ENST00000432673 917 ntTSL 3 BASIC10.2□□□□□ -0.78
PKD1P98161 LINC02028-203ENST00000443776 453 ntTSL 3 BASIC10.2□□□□□ -0.78
PKD1P98161 AC005920.3-202ENST00000512717 789 ntTSL 3 BASIC10.2□□□□□ -0.78
PKD1P98161 HYAL3-206ENST00000513170 636 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
PKD1P98161 LINC00928-204ENST00000561201 1123 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
PKD1P98161 LINC01229-204ENST00000568751 720 ntTSL 3 BASIC10.2□□□□□ -0.78
PKD1P98161 AC100861.1-202ENST00000500853 1970 ntTSL 2 BASIC10.2□□□□□ -0.78
PKD1P98161 TEAD4-203ENST00000397122 1396 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
PKD1P98161 ATP6V0E2-203ENST00000456496 2722 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
PKD1P98161 ATP6V0E2-213ENST00000615196 2727 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
PKD1P98161 TMEM263-204ENST00000548125 3349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.2□□□□□ -0.78
PKD1P98161 SEMA6D-205ENST00000389425 2318 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
PKD1P98161 PLPPR2-208ENST00000591608 2552 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.2□□□□□ -0.78
PKD1P98161 FAM24B-202ENST00000368898 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
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