Protein–RNA interactions for Protein: P63208

SKP1, S-phase kinase-associated protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 163 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SKP1P63208 AIFM3-207ENST00000440238 2368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SKP1P63208 CD300LG-204ENST00000539718 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SKP1P63208 CANX-201ENST00000247461 4260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SKP1P63208 SNAI2-201ENST00000020945 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SKP1P63208 NPM1-201ENST00000296930 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SKP1P63208 THSD1-202ENST00000349258 3189 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SKP1P63208 ABLIM3-206ENST00000506113 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SKP1P63208 TECR-201ENST00000215567 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SKP1P63208 C6orf52-202ENST00000379586 430 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SKP1P63208 GPS2P2-201ENST00000430745 888 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
SKP1P63208 AC022201.2-201ENST00000445084 287 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SKP1P63208 AL391845.1-202ENST00000449154 437 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SKP1P63208 IQSEC2-204ENST00000485377 835 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SKP1P63208 AC021744.1-201ENST00000518354 453 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SKP1P63208 TRAF3IP2-AS1-208ENST00000525151 609 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SKP1P63208 TMEM258-204ENST00000537328 575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SKP1P63208 AC090607.3-202ENST00000558971 383 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SKP1P63208 AC061975.2-201ENST00000581722 295 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
SKP1P63208 AC098484.3-202ENST00000603943 1011 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SKP1P63208 AC007967.4-201ENST00000614700 386 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
SKP1P63208 AL157832.3-201ENST00000635764 1005 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SKP1P63208 F7-201ENST00000346342 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SKP1P63208 CERK-201ENST00000216264 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SKP1P63208 BX088651.4-201ENST00000435586 2579 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SKP1P63208 TPM1-201ENST00000267996 1670 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SKP1P63208 NFE2-201ENST00000312156 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SKP1P63208 SYT12-203ENST00000525457 1678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SKP1P63208 TOM1L2-209ENST00000540946 1420 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SKP1P63208 SERINC2-205ENST00000536384 2062 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SKP1P63208 FNDC5-201ENST00000373471 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SKP1P63208 GSKIP-205ENST00000555181 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SKP1P63208 OLIG2-201ENST00000333337 3262 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SKP1P63208 DOK5-201ENST00000262593 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SKP1P63208 DDOST-206ENST00000602624 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SKP1P63208 TACC3-201ENST00000313288 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SKP1P63208 RNF157-202ENST00000319945 2937 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SKP1P63208 LDLRAP1-201ENST00000374338 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SKP1P63208 NYNRIN-201ENST00000382554 7857 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SKP1P63208 PEA15-202ENST00000368076 2694 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SKP1P63208 WBP2-204ENST00000585462 1895 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SKP1P63208 AFTPH-202ENST00000238856 4040 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SKP1P63208 C12orf66-204ENST00000544871 2441 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SKP1P63208 RIC8B-213ENST00000638198 1611 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SKP1P63208 MPP1-205ENST00000413259 2195 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SKP1P63208 SLC25A23-202ENST00000301454 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SKP1P63208 SHISA5-209ENST00000443308 1933 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SKP1P63208 CCDC116-203ENST00000607942 1913 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SKP1P63208 EIF2B3-210ENST00000620860 1923 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SKP1P63208 ZMYM3-202ENST00000373978 1511 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SKP1P63208 FHL2-205ENST00000393353 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SKP1P63208 C18orf25-206ENST00000619301 5264 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SKP1P63208 PICALM-219ENST00000532317 3474 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SKP1P63208 CCDC181-206ENST00000491570 1652 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SKP1P63208 POP7-201ENST00000303151 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SKP1P63208 MIR648-201ENST00000385046 94 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
SKP1P63208 CLTA-203ENST00000396603 1090 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SKP1P63208 SLC25A36-204ENST00000453248 1040 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SKP1P63208 AL139010.1-201ENST00000454878 894 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
SKP1P63208 CD28-203ENST00000458610 705 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SKP1P63208 TMEM176A-202ENST00000461345 635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SKP1P63208 NDUFAF5-203ENST00000463598 991 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SKP1P63208 VPS29-207ENST00000549970 818 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SKP1P63208 TMEM263-206ENST00000550344 925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SKP1P63208 NDUFAB1-205ENST00000570319 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SKP1P63208 PFN1-203ENST00000574872 1173 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SKP1P63208 PAM16-215ENST00000577031 548 ntTSL 4 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SKP1P63208 AC003101.2-201ENST00000612557 442 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
SKP1P63208 RAB34-224ENST00000636513 888 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SKP1P63208 WDR45-201ENST00000322995 1444 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SKP1P63208 OTOL1-201ENST00000327928 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SKP1P63208 MATN3-202ENST00000421259 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SKP1P63208 ADAM8-205ENST00000485491 2441 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SKP1P63208 ELN-206ENST00000380553 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SKP1P63208 SGPP1-201ENST00000247225 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SKP1P63208 WT1-203ENST00000379079 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SKP1P63208 AC007326.2-201ENST00000624224 7579 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
SKP1P63208 PDE4C-207ENST00000594617 4655 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SKP1P63208 KIF21A-202ENST00000361961 6601 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SKP1P63208 EIF1B-AS1-206ENST00000631175 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SKP1P63208 ALDOA-226ENST00000569798 1499 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SKP1P63208 NAPA-AS1-201ENST00000593284 1753 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SKP1P63208 ANTXRL-205ENST00000620264 2206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SKP1P63208 ADAM11-203ENST00000535346 2529 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SKP1P63208 LRP8-207ENST00000465675 2670 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SKP1P63208 MUL1-201ENST00000264198 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SKP1P63208 TRABD-202ENST00000380909 2272 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SKP1P63208 TBC1D2-202ENST00000375063 2100 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SKP1P63208 HSFX1-201ENST00000370416 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SKP1P63208 ANKEF1-201ENST00000378380 5303 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SKP1P63208 TMEM222-210ENST00000608611 1511 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SKP1P63208 GADD45B-201ENST00000215631 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SKP1P63208 KLHL24-201ENST00000242810 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SKP1P63208 ANXA8-203ENST00000583874 1860 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SKP1P63208 HMBS-209ENST00000537841 1559 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SKP1P63208 TSC22D4-201ENST00000300181 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SKP1P63208 DIXDC1-201ENST00000440460 5897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SKP1P63208 FKBP2-201ENST00000309366 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SKP1P63208 AL645939.2-201ENST00000427340 991 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
SKP1P63208 INS-205ENST00000512523 297 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SKP1P63208 AC012617.1-203ENST00000590845 439 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.3 ms