Protein–RNA interactions for Protein: P57773

GJA9, Gap junction alpha-9 protein, humanhuman

Predictions only

Length 515 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GJA9P57773 TUBB1P2-201ENST00000422712 1306 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
GJA9P57773 TUBB1P1-201ENST00000503144 1300 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
GJA9P57773 ZNF302-202ENST00000446502 2635 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
GJA9P57773 CD1E-213ENST00000444681 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
GJA9P57773 SPATC1L-201ENST00000291672 2303 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
GJA9P57773 NF2-208ENST00000403435 2568 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
GJA9P57773 KRTAP19-3-201ENST00000334063 522 ntAPPRIS P1 BASIC17.8■□□□□ 0.44
GJA9P57773 OR10H1-201ENST00000334920 1124 ntAPPRIS P1 BASIC17.8■□□□□ 0.44
GJA9P57773 PLAC9-201ENST00000372263 785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
GJA9P57773 ADAMTSL1-208ENST00000380570 931 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
GJA9P57773 MDP1-202ENST00000396833 582 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
GJA9P57773 USB1-202ENST00000423271 1217 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
GJA9P57773 AC134915.1-201ENST00000426461 574 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
GJA9P57773 MDM2-215ENST00000428863 1037 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
GJA9P57773 BCRP2-202ENST00000447763 634 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
GJA9P57773 CSF2RBP1-201ENST00000447905 391 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
GJA9P57773 CGB8-201ENST00000448456 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
GJA9P57773 FO681548.1-201ENST00000455617 1132 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
GJA9P57773 AC106886.2-201ENST00000483578 883 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
GJA9P57773 C4orf3-202ENST00000504110 667 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
GJA9P57773 BCRP6-201ENST00000510112 632 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
GJA9P57773 BCRP7-201ENST00000511549 544 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
GJA9P57773 RNA5SP412-201ENST00000516234 123 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
GJA9P57773 AC136475.5-202ENST00000524824 587 ntTSL 4 BASIC17.8■□□□□ 0.44
GJA9P57773 AL133153.2-201ENST00000557524 303 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
GJA9P57773 LINC01887-202ENST00000584734 860 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
GJA9P57773 AC005785.1-202ENST00000597164 237 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
GJA9P57773 DUSP13-212ENST00000605915 1015 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
GJA9P57773 IDH3B-201ENST00000380843 1545 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
GJA9P57773 TRMT1-203ENST00000437766 2263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
GJA9P57773 RGS3-210ENST00000462143 2759 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
GJA9P57773 SSC5D-202ENST00000587166 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
GJA9P57773 GAS2L3-201ENST00000266754 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
GJA9P57773 MPP5-201ENST00000261681 5552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
GJA9P57773 SLC18B1-201ENST00000275227 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
GJA9P57773 ISLR2-203ENST00000435464 4259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
GJA9P57773 CXorf38-201ENST00000327877 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
GJA9P57773 TLE6-202ENST00000452088 1883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
GJA9P57773 SDCBP-202ENST00000413219 2086 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
GJA9P57773 STX17-205ENST00000525640 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
GJA9P57773 DHPS-201ENST00000210060 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
GJA9P57773 RERG-209ENST00000546331 1383 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
GJA9P57773 PRKRIP1-208ENST00000496391 3430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
GJA9P57773 PIK3R2-201ENST00000222254 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
GJA9P57773 BEND4-203ENST00000611697 1348 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
GJA9P57773 AC012313.1-201ENST00000593393 3059 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
GJA9P57773 AADAT-208ENST00000515480 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
GJA9P57773 TCF4-201ENST00000354452 3482 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
GJA9P57773 SBSN-201ENST00000452271 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
GJA9P57773 CARTPT-201ENST00000296777 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
GJA9P57773 GOLIM4-201ENST00000309027 2100 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
GJA9P57773 RHCE-205ENST00000349438 1235 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
GJA9P57773 MGST3-203ENST00000367885 680 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
GJA9P57773 MORN2-204ENST00000409665 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
GJA9P57773 AC016683.1-202ENST00000438409 583 ntTSL 4 BASIC17.79■□□□□ 0.44
GJA9P57773 RPL7P3-201ENST00000441388 714 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
GJA9P57773 AC100810.1-201ENST00000518822 978 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
GJA9P57773 AP001889.1-201ENST00000525414 633 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
GJA9P57773 AC068587.3-201ENST00000526613 355 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
GJA9P57773 AP001360.1-202ENST00000526934 479 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
GJA9P57773 PTP4A1P2-201ENST00000546033 454 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
GJA9P57773 AC000032.1-201ENST00000562538 491 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
GJA9P57773 ZNF180-204ENST00000586637 1023 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
GJA9P57773 SCGB1C2-201ENST00000595228 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
GJA9P57773 AC011497.1-201ENST00000596781 561 ntTSL 4 BASIC17.79■□□□□ 0.44
GJA9P57773 LINC01663-201ENST00000614596 535 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
GJA9P57773 NTNG1-202ENST00000370065 1485 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
GJA9P57773 FBP1-203ENST00000415431 1487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
GJA9P57773 LRFN3-201ENST00000246529 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
GJA9P57773 EMILIN3-201ENST00000332312 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
GJA9P57773 DACH1-202ENST00000613252 5233 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
GJA9P57773 C6orf47-202ENST00000375911 2475 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
GJA9P57773 PEA15-202ENST00000368076 2694 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
GJA9P57773 CREB3L1-206ENST00000621158 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
GJA9P57773 CALHM2-202ENST00000369788 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
GJA9P57773 RCC1-202ENST00000373832 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
GJA9P57773 ADAMTS4-201ENST00000367995 1961 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
GJA9P57773 MEG3-206ENST00000423456 1771 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
GJA9P57773 PAQR6-214ENST00000613336 1599 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
GJA9P57773 ADCY3-201ENST00000260600 5050 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
GJA9P57773 VSIG10L2-202ENST00000638636 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
GJA9P57773 SEPT11-201ENST00000264893 5593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
GJA9P57773 AC006504.5-203ENST00000590628 1335 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
GJA9P57773 GGNBP2-212ENST00000613102 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
GJA9P57773 PLA2G2D-202ENST00000617227 1856 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
GJA9P57773 CDK13-201ENST00000181839 7298 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
GJA9P57773 TCP11L2-201ENST00000299045 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
GJA9P57773 AL163636.2-201ENST00000553909 1498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
GJA9P57773 AC090340.1-201ENST00000620778 4980 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
GJA9P57773 INTS4P2-202ENST00000614726 2019 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
GJA9P57773 AC009053.2-201ENST00000563701 2365 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
GJA9P57773 MIER1-206ENST00000371016 1802 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
GJA9P57773 AKIP1-202ENST00000309357 1232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
GJA9P57773 GSTO1-201ENST00000369710 900 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
GJA9P57773 SS18L1-202ENST00000370848 1238 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
GJA9P57773 ITIH1-202ENST00000405128 1122 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
GJA9P57773 RPL28-203ENST00000428193 573 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
GJA9P57773 RAB34-210ENST00000436730 863 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
GJA9P57773 KCNQ1-AS1-201ENST00000440887 1084 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
GJA9P57773 USP40-206ENST00000443711 628 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.8 ms