Protein–RNA interactions for Protein: P55291

CDH15, Cadherin-15, humanhuman

Predictions only

Length 814 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDH15P55291 TRIM60-203ENST00000508504 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CDH15P55291 CCT7-216ENST00000540468 1674 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CDH15P55291 UBC-205ENST00000536769 3745 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CDH15P55291 PSEN2-203ENST00000422240 1947 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CDH15P55291 TVP23C-203ENST00000428082 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CDH15P55291 RPRD1A-209ENST00000590898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CDH15P55291 C6orf15-201ENST00000259870 1140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CDH15P55291 CD320-201ENST00000301458 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CDH15P55291 RESP18-201ENST00000333527 795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CDH15P55291 ZNF688-207ENST00000567855 540 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CDH15P55291 AC138894.3-201ENST00000603787 634 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
CDH15P55291 AL031008.1-201ENST00000619963 541 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
CDH15P55291 ABCB9-216ENST00000542678 6051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CDH15P55291 STAT6-225ENST00000640254 2037 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CDH15P55291 ANKRD46-205ENST00000520311 3270 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CDH15P55291 BSG-202ENST00000346916 1605 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CDH15P55291 SPATA7-203ENST00000393545 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CDH15P55291 PACSIN2-201ENST00000263246 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CDH15P55291 GOLGA5-201ENST00000163416 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CDH15P55291 AC091951.1-201ENST00000512854 2465 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
CDH15P55291 ARHGEF5-201ENST00000056217 5544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CDH15P55291 TUSC3-201ENST00000382020 3683 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CDH15P55291 PPP3CA-207ENST00000512215 4007 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CDH15P55291 GRM5-205ENST00000455756 7927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CDH15P55291 UHRF1-204ENST00000616255 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CDH15P55291 NFKB2-203ENST00000369966 3101 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CDH15P55291 TPD52L2-202ENST00000346249 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CDH15P55291 AC112484.1-201ENST00000508239 2291 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CDH15P55291 MRPS5-201ENST00000272418 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CDH15P55291 WDR45-202ENST00000356463 1688 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CDH15P55291 RALGDS-201ENST00000372047 3598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CDH15P55291 FAM151A-201ENST00000302250 2005 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CDH15P55291 IL9R-202ENST00000369423 2032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CDH15P55291 API5-202ENST00000420461 2009 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CDH15P55291 AC005253.1-201ENST00000597411 2001 ntTSL 4 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CDH15P55291 BCL11A-201ENST00000335712 5942 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CDH15P55291 CXCL14-202ENST00000512158 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CDH15P55291 ARMC6-206ENST00000535612 2488 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CDH15P55291 SSFA2-205ENST00000431877 5150 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CDH15P55291 SAE1-202ENST00000392776 1851 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CDH15P55291 TLE6-202ENST00000452088 1883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CDH15P55291 TNKS1BP1-207ENST00000532437 5952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CDH15P55291 AC023024.1-201ENST00000558838 2590 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CDH15P55291 CHD4-210ENST00000544040 6514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CDH15P55291 TMEM189-203ENST00000371656 1973 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CDH15P55291 C1orf43-201ENST00000350592 1610 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CDH15P55291 TPM1-203ENST00000317516 738 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CDH15P55291 TCEAL2-201ENST00000329035 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CDH15P55291 INPP5F-203ENST00000369081 874 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CDH15P55291 RPL36-202ENST00000394580 556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CDH15P55291 EXOSC3-202ENST00000396521 768 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CDH15P55291 SAPCD2-201ENST00000409687 3848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CDH15P55291 AC093459.1-201ENST00000444567 481 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CDH15P55291 AL611929.1-201ENST00000457340 449 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CDH15P55291 SLC2A1-204ENST00000460369 541 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CDH15P55291 AC080075.1-201ENST00000469747 427 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CDH15P55291 AC079848.1-202ENST00000507924 444 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CDH15P55291 CCNG1-208ENST00000510664 994 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CDH15P55291 AC021066.1-201ENST00000549788 647 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CDH15P55291 AL157871.1-202ENST00000556458 478 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CDH15P55291 TPM1-218ENST00000559281 851 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CDH15P55291 CARHSP1-205ENST00000562843 843 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CDH15P55291 AC092338.2-202ENST00000567158 611 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CDH15P55291 C19orf25-204ENST00000586564 1265 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CDH15P55291 AC099336.1-202ENST00000602961 463 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
CDH15P55291 HNF4A-208ENST00000609795 1192 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CDH15P55291 AC124864.1-201ENST00000623408 392 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
CDH15P55291 CEACAM3-208ENST00000630848 1110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CDH15P55291 C1QTNF2-201ENST00000393975 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CDH15P55291 SLC25A45-214ENST00000534028 2432 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CDH15P55291 GRK6P1-201ENST00000400595 1711 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
CDH15P55291 UBAP1-202ENST00000359544 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CDH15P55291 ABHD14B-204ENST00000461108 1397 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CDH15P55291 TBRG4-215ENST00000494076 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CDH15P55291 TCP10-210ENST00000617120 2182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CDH15P55291 NUDT16-203ENST00000537561 5943 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CDH15P55291 FOS-208ENST00000555686 1496 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CDH15P55291 RAB37-208ENST00000402449 1560 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CDH15P55291 PDXP-202ENST00000403251 1571 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CDH15P55291 OR4D1-202ENST00000641449 4925 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CDH15P55291 RAB37-206ENST00000392615 2655 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CDH15P55291 AC117489.1-201ENST00000625169 3217 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
CDH15P55291 PAK6-202ENST00000455577 4215 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CDH15P55291 RIMS1-216ENST00000521978 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CDH15P55291 CFAP53-201ENST00000398545 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CDH15P55291 CBX7-201ENST00000216133 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CDH15P55291 ZNF365-205ENST00000395254 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CDH15P55291 FUS-201ENST00000254108 5119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CDH15P55291 TJP3-202ENST00000541714 3350 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CDH15P55291 BUD13-201ENST00000260210 2196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CDH15P55291 NSUN5-202ENST00000310326 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CDH15P55291 NCKIPSD-204ENST00000416649 2925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CDH15P55291 AC015656.1-201ENST00000624209 3578 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
CDH15P55291 STPG3-AS1-201ENST00000612170 1701 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CDH15P55291 AL512652.2-201ENST00000625156 1716 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
CDH15P55291 LZTR1-201ENST00000215739 4572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CDH15P55291 GML-201ENST00000220940 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CDH15P55291 CCDC134-201ENST00000255784 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CDH15P55291 NUDT6-201ENST00000304430 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CDH15P55291 MRPL43-203ENST00000318364 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.6 ms