Protein–RNA interactions for Protein: P55211

CASP9, Caspase-9, humanhuman

Predictions only

Length 416 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASP9P55211 MIEN1-205ENST00000577810 806 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CASP9P55211 METTL23-202ENST00000586200 465 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CASP9P55211 METTL23-212ENST00000590964 1006 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CASP9P55211 DEF8-228ENST00000610455 816 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CASP9P55211 SCN5A-214ENST00000612060 714 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CASP9P55211 KIAA1211-203ENST00000504228 4628 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CASP9P55211 HSP90B1-201ENST00000299767 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CASP9P55211 BDP1-202ENST00000380675 2861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CASP9P55211 TMUB2-212ENST00000589785 1918 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CASP9P55211 AGPS-201ENST00000264167 7764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CASP9P55211 SYNRG-223ENST00000616179 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CASP9P55211 ASS1-204ENST00000372394 1973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CASP9P55211 KCNMA1-219ENST00000480683 2963 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CASP9P55211 JRK-209ENST00000612905 9124 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CASP9P55211 AC012313.3-202ENST00000599109 3322 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CASP9P55211 MBD4-206ENST00000507208 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CASP9P55211 PURB-201ENST00000395699 9069 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CASP9P55211 HLA-DQB2-231ENST00000435145 2026 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
CASP9P55211 AL592424.1-201ENST00000563624 1536 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
CASP9P55211 TOMM70-201ENST00000284320 4409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CASP9P55211 ARID4B-202ENST00000349213 5811 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CASP9P55211 KIAA1755-206ENST00000496900 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CASP9P55211 TLE3-215ENST00000559048 2918 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CASP9P55211 NDRG2-211ENST00000397858 2054 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CASP9P55211 PDE1C-202ENST00000396182 2420 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CASP9P55211 HDAC5-202ENST00000336057 5040 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CASP9P55211 GNRHR2-201ENST00000312753 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CASP9P55211 PPP3CA-207ENST00000512215 4007 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CASP9P55211 PRR5-218ENST00000624862 1900 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CASP9P55211 CC2D1B-202ENST00000371586 5642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CASP9P55211 CCDC59-201ENST00000256151 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CASP9P55211 GUCD1-203ENST00000404664 1606 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CASP9P55211 CTSG-201ENST00000216336 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CASP9P55211 TFF3-201ENST00000291525 407 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CASP9P55211 YBEY-201ENST00000329319 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CASP9P55211 RPP38-203ENST00000378202 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CASP9P55211 YBEY-206ENST00000397701 744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CASP9P55211 MECP2-203ENST00000407218 1174 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CASP9P55211 AC007967.2-201ENST00000432613 625 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
CASP9P55211 PIGBOS1-201ENST00000436697 866 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CASP9P55211 CMPK1-205ENST00000471289 816 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CASP9P55211 ADAM10-217ENST00000561288 583 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CASP9P55211 GIPC1-213ENST00000591349 1068 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CASP9P55211 AC021097.1-201ENST00000607902 574 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
CASP9P55211 LINC01197-204ENST00000611265 956 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CASP9P55211 CLEC11A-203ENST00000617718 1128 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CASP9P55211 AL645728.2-201ENST00000641974 660 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
CASP9P55211 ANKS6-202ENST00000375019 2586 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CASP9P55211 IQCF5-AS1-201ENST00000440723 2000 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CASP9P55211 RGR-202ENST00000359452 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CASP9P55211 ACE-203ENST00000413513 2237 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CASP9P55211 RELA-227ENST00000615805 2236 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CASP9P55211 SPOCK2-202ENST00000373109 5445 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CASP9P55211 SNX6-202ENST00000396526 3398 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CASP9P55211 CMKLR1-206ENST00000552995 1890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CASP9P55211 LONP1-213ENST00000590729 2626 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CASP9P55211 RAP1GDS1-203ENST00000380158 2085 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CASP9P55211 FOXS1-201ENST00000375978 1319 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CASP9P55211 HLA-B-249ENST00000412585 1547 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CASP9P55211 TLE3-202ENST00000440567 2657 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CASP9P55211 AP005117.1-202ENST00000581724 1908 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
CASP9P55211 RNF182-206ENST00000537388 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CASP9P55211 CLDN6-201ENST00000328796 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CASP9P55211 IQCE-210ENST00000438376 2170 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CASP9P55211 MARK3-204ENST00000416682 2969 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CASP9P55211 TMEM51-202ENST00000376014 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CASP9P55211 DYNC1LI1-204ENST00000432458 1827 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CASP9P55211 C1QTNF1-208ENST00000580474 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CASP9P55211 AC104109.2-201ENST00000602919 1418 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
CASP9P55211 DNM1-201ENST00000341179 3254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CASP9P55211 NIN-203ENST00000382041 6496 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CASP9P55211 SLC25A36-203ENST00000446041 4638 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CASP9P55211 CD99L2-202ENST00000355149 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CASP9P55211 AL354836.1-201ENST00000414042 681 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CASP9P55211 LINC01786-201ENST00000434139 268 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CASP9P55211 TSPY3-202ENST00000440483 414 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CASP9P55211 REEP2-206ENST00000506158 1021 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CASP9P55211 CNOT8-225ENST00000524105 904 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CASP9P55211 IGLL5-201ENST00000526893 1050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CASP9P55211 IGLL5-202ENST00000531372 882 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CASP9P55211 AL662844.1-201ENST00000546340 181 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
CASP9P55211 RPL28-209ENST00000560055 670 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CASP9P55211 CD7-202ENST00000578509 925 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CASP9P55211 FBF1-204ENST00000586631 621 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CASP9P55211 AC002398.2-201ENST00000587767 660 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CASP9P55211 IZUMO4-213ENST00000620263 947 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CASP9P55211 PSMA6-216ENST00000627895 484 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CASP9P55211 SBSN-201ENST00000452271 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CASP9P55211 UHRF2-201ENST00000276893 3452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CASP9P55211 ZMIZ1-205ENST00000611351 2196 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CASP9P55211 WIPI2-211ENST00000484262 1504 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CASP9P55211 DRG2-201ENST00000225729 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CASP9P55211 RUSC1-203ENST00000368349 1968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CASP9P55211 CCAR2-202ENST00000389279 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CASP9P55211 PCBP1-201ENST00000303577 1750 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CASP9P55211 DUSP13-210ENST00000491677 1770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CASP9P55211 AP005329.2-201ENST00000580139 1771 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CASP9P55211 IRX6-201ENST00000290552 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CASP9P55211 HTR1B-201ENST00000369947 2021 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CASP9P55211 INPP5J-204ENST00000402238 1564 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67.6 ms