Protein–RNA interactions for Protein: P53602

MVD, Diphosphomevalonate decarboxylase, humanhuman

Predictions only

Length 400 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MVDP53602 AC087276.3-201ENST00000526220 787 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
MVDP53602 TPD52L1-211ENST00000532429 1022 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
MVDP53602 SPINT1-AS1-202ENST00000564302 643 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
MVDP53602 HEXA-210ENST00000567213 1000 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
MVDP53602 AC061975.2-201ENST00000581722 295 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
MVDP53602 AC092865.6-201ENST00000642101 219 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
MVDP53602 NOX4-215ENST00000534731 2156 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
MVDP53602 SCLT1-205ENST00000503401 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
MVDP53602 MLXIP-201ENST00000319080 8427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
MVDP53602 ANKRD33-201ENST00000301190 1935 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
MVDP53602 CDC42-203ENST00000400259 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
MVDP53602 C21orf33-201ENST00000291577 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
MVDP53602 AZI2-205ENST00000420543 1366 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
MVDP53602 TRPC6-206ENST00000532133 2648 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
MVDP53602 AK5-203ENST00000354567 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
MVDP53602 TRA2B-205ENST00000453386 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
MVDP53602 NTNG1-203ENST00000370066 1443 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
MVDP53602 PGR-210ENST00000619228 3038 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
MVDP53602 PLPPR4-202ENST00000370185 5369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
MVDP53602 TSPAN3-201ENST00000267970 6467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
MVDP53602 MFSD2B-202ENST00000406420 1528 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
MVDP53602 TMEM132E-201ENST00000321639 5631 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
MVDP53602 USH1C-202ENST00000318024 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
MVDP53602 TRA2A-202ENST00000392502 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
MVDP53602 MBD1-222ENST00000590208 2913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
MVDP53602 CACNA2D3-201ENST00000288197 3671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
MVDP53602 CACNA2D3-206ENST00000474759 3675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
MVDP53602 FBXL12-208ENST00000589626 1920 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
MVDP53602 PPP1CB-202ENST00000358506 4771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
MVDP53602 ARHGEF1-219ENST00000599846 3393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
MVDP53602 MRI1-202ENST00000319545 3027 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
MVDP53602 KLHDC2-206ENST00000554589 1641 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
MVDP53602 PRLH-201ENST00000165524 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
MVDP53602 TMEM89-201ENST00000330862 662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
MVDP53602 CXCL1-201ENST00000395761 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
MVDP53602 C6orf226-201ENST00000408925 552 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
MVDP53602 LINC00398-201ENST00000414407 906 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
MVDP53602 HNRNPA1P28-201ENST00000424481 961 ntBASIC15.08■□□□□ 0
MVDP53602 TPM4P1-201ENST00000436100 807 ntBASIC15.08■□□□□ 0
MVDP53602 SNCA-209ENST00000506244 570 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
MVDP53602 AP001107.2-202ENST00000528650 480 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
MVDP53602 FAM177A1-207ENST00000554052 540 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
MVDP53602 BEAN1-203ENST00000561796 1078 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
MVDP53602 MARVELD3-206ENST00000567566 850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
MVDP53602 INO80E-210ENST00000567705 880 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
MVDP53602 SPATA33-208ENST00000568929 1264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
MVDP53602 AC006116.8-201ENST00000587004 987 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
MVDP53602 DEF8-228ENST00000610455 816 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
MVDP53602 RAP2C-201ENST00000342983 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
MVDP53602 NECAP2-201ENST00000337132 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
MVDP53602 NDRG2-206ENST00000397844 2096 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
MVDP53602 RASGEF1C-206ENST00000522500 2055 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
MVDP53602 IL9RP2-201ENST00000423948 1312 ntBASIC15.08■□□□□ 0
MVDP53602 ELMO3-201ENST00000360833 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
MVDP53602 PHRF1-201ENST00000264555 5523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
MVDP53602 PAQR6-204ENST00000356983 2143 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
MVDP53602 PTGES3L-AARSD1-201ENST00000360221 1790 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
MVDP53602 AC006486.2-201ENST00000624246 2199 ntBASIC15.08■□□□□ 0
MVDP53602 EFCAB14-201ENST00000371933 5767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
MVDP53602 WDR45-201ENST00000322995 1444 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
MVDP53602 CBLC-202ENST00000341505 1441 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
MVDP53602 AC090616.6-203ENST00000579186 1945 ntBASIC15.07■□□□□ 0
MVDP53602 RAB33B-201ENST00000305626 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
MVDP53602 SLC18A1-207ENST00000519026 1980 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
MVDP53602 NR2E3-204ENST00000621736 2032 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
MVDP53602 AC023157.3-201ENST00000619086 2088 ntBASIC15.07■□□□□ 0
MVDP53602 FUT7-201ENST00000314412 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
MVDP53602 UVSSA-206ENST00000507531 2597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
MVDP53602 ZBTB7C-221ENST00000590800 4947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
MVDP53602 PHKA1-205ENST00000541944 5944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
MVDP53602 LYNX1-206ENST00000621401 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
MVDP53602 MST1L-201ENST00000442552 2185 ntBASIC15.07■□□□□ 0
MVDP53602 LIMS2-217ENST00000545738 1730 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
MVDP53602 KRT8-205ENST00000546897 1755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
MVDP53602 ATP23-201ENST00000300145 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
MVDP53602 VSTM1-201ENST00000338372 1023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
MVDP53602 GSTO1-202ENST00000369713 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
MVDP53602 ALKBH6-202ENST00000378875 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
MVDP53602 AC002056.1-201ENST00000395613 760 ntBASIC15.07■□□□□ 0
MVDP53602 CCNG1-208ENST00000510664 994 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
MVDP53602 AC135050.2-203ENST00000529564 725 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.07■□□□□ 0
MVDP53602 C17orf49-203ENST00000546760 764 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
MVDP53602 AL359317.2-203ENST00000557409 538 ntTSL 4 BASIC15.07■□□□□ 0
MVDP53602 AC005606.1-201ENST00000567515 504 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
MVDP53602 C19orf33-202ENST00000588605 520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
MVDP53602 AC090241.2-202ENST00000602333 633 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
MVDP53602 TFAP2C-201ENST00000201031 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
MVDP53602 MCF2L-208ENST00000397030 6580 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
MVDP53602 JAKMIP1-204ENST00000409831 2371 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
MVDP53602 ETV2-205ENST00000479824 1342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
MVDP53602 AC023824.1-201ENST00000562945 2975 ntBASIC15.07■□□□□ 0
MVDP53602 CALB2-202ENST00000349553 1373 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
MVDP53602 CGREF1-205ENST00000404694 1376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
MVDP53602 COBL-201ENST00000265136 5291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
MVDP53602 NOL4L-211ENST00000621426 6577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
MVDP53602 BRSK2-204ENST00000526678 2091 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
MVDP53602 GRK5-202ENST00000392870 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
MVDP53602 LRFN1-201ENST00000248668 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
MVDP53602 HNRNPF-201ENST00000337970 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
MVDP53602 MAGEF1-201ENST00000317897 1636 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.4 ms