Protein–RNA interactions for Protein: P52657

GTF2A2, Transcription initiation factor IIA subunit 2, humanhuman

Predictions only

Length 109 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2A2P52657 HIST1H2AJ-201ENST00000333151 387 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
GTF2A2P52657 TREML1-201ENST00000373127 1194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
GTF2A2P52657 MASP2-202ENST00000400898 726 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
GTF2A2P52657 AL162742.1-201ENST00000434792 954 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
GTF2A2P52657 AC006033.1-201ENST00000440505 426 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
GTF2A2P52657 USP40-206ENST00000443711 628 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
GTF2A2P52657 AC106760.1-201ENST00000508690 800 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
GTF2A2P52657 AC012531.3-201ENST00000513209 777 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
GTF2A2P52657 KRT90P-201ENST00000549264 1064 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
GTF2A2P52657 ARL16-210ENST00000574938 751 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
GTF2A2P52657 MIR22HG-212ENST00000577164 931 ntTSL 4 BASIC18.47■□□□□ 0.55
GTF2A2P52657 AL121944.1-201ENST00000605945 686 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
GTF2A2P52657 AC247036.4-201ENST00000632099 353 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
GTF2A2P52657 CACNA1A-227ENST00000636549 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
GTF2A2P52657 NIPAL2-202ENST00000430223 4496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
GTF2A2P52657 NFASC-205ENST00000403080 2462 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
GTF2A2P52657 ISLR2-203ENST00000435464 4259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
GTF2A2P52657 KCNE3-201ENST00000310128 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
GTF2A2P52657 JMJD4-207ENST00000620518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
GTF2A2P52657 SGSM2-201ENST00000268989 4863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
GTF2A2P52657 PAK4-201ENST00000321944 2555 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
GTF2A2P52657 NAGPA-201ENST00000312251 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
GTF2A2P52657 POLI-207ENST00000579434 2705 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
GTF2A2P52657 MRPL11-201ENST00000310999 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
GTF2A2P52657 COQ6-201ENST00000334571 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
GTF2A2P52657 PCDHA8-201ENST00000378123 2616 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
GTF2A2P52657 UBAP1-203ENST00000379186 2524 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
GTF2A2P52657 PDZD3-202ENST00000355547 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
GTF2A2P52657 USE1-206ENST00000595101 1776 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
GTF2A2P52657 NPPC-201ENST00000295440 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
GTF2A2P52657 MRPL58-201ENST00000301585 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
GTF2A2P52657 SCGN-201ENST00000334979 704 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
GTF2A2P52657 PRDX5-203ENST00000352435 596 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
GTF2A2P52657 SPDYE7P-201ENST00000355920 1064 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
GTF2A2P52657 AGER-203ENST00000375065 665 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
GTF2A2P52657 TPO-206ENST00000382269 1155 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
GTF2A2P52657 GTF2A2-204ENST00000396063 970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
GTF2A2P52657 AL583835.2-202ENST00000421363 1104 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
GTF2A2P52657 LIMS3-201ENST00000437679 1220 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
GTF2A2P52657 BTNL8-205ENST00000505126 1294 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
GTF2A2P52657 AC080188.2-201ENST00000508985 552 ntTSL 4 BASIC18.46■□□□□ 0.55
GTF2A2P52657 PAFAH1B3-202ENST00000538771 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
GTF2A2P52657 LYSMD2-204ENST00000560491 1026 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
GTF2A2P52657 DBNDD1-206ENST00000568838 993 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
GTF2A2P52657 CRISPLD2-210ENST00000569090 808 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
GTF2A2P52657 AC005252.2-201ENST00000624630 1141 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
GTF2A2P52657 RETN-203ENST00000629642 400 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
GTF2A2P52657 PARVG-205ENST00000422871 3462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
GTF2A2P52657 AC026954.2-202ENST00000575474 2571 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
GTF2A2P52657 RAB4B-EGLN2-201ENST00000594136 2554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
GTF2A2P52657 LTBP4-205ENST00000396819 4764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
GTF2A2P52657 SLC25A2-201ENST00000239451 1417 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
GTF2A2P52657 MARCO-201ENST00000327097 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
GTF2A2P52657 SCARB1-208ENST00000544327 1812 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
GTF2A2P52657 XAF1-201ENST00000346752 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
GTF2A2P52657 MSTO2P-201ENST00000314835 1709 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
GTF2A2P52657 E2F2-201ENST00000361729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
GTF2A2P52657 CDHR1-201ENST00000332904 2694 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
GTF2A2P52657 TRMT1-203ENST00000437766 2263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
GTF2A2P52657 SSC5D-201ENST00000389623 4845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
GTF2A2P52657 APOBEC3A-202ENST00000402255 1478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.54
GTF2A2P52657 NDUFV1-223ENST00000532303 1493 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.54
GTF2A2P52657 AZIN1-201ENST00000337198 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
GTF2A2P52657 NDRG2-204ENST00000360463 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
GTF2A2P52657 STX3-201ENST00000337979 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
GTF2A2P52657 SEPT2-245ENST00000616972 3446 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
GTF2A2P52657 TSEN2-207ENST00000454502 1909 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
GTF2A2P52657 ADCY7-203ENST00000537579 2090 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
GTF2A2P52657 SNAI3-AS1-202ENST00000563475 2081 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
GTF2A2P52657 RGS6-218ENST00000556437 1689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
GTF2A2P52657 PRR36-202ENST00000618550 4456 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
GTF2A2P52657 POLR2I-201ENST00000221859 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
GTF2A2P52657 COX6A2-201ENST00000287490 440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
GTF2A2P52657 KLK1-201ENST00000301420 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
GTF2A2P52657 STMN1-201ENST00000357865 1137 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
GTF2A2P52657 NUDT19-201ENST00000397061 2967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
GTF2A2P52657 AL121983.1-201ENST00000424181 335 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
GTF2A2P52657 C2orf27AP3-201ENST00000434123 579 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
GTF2A2P52657 ZMYND10-AS1-201ENST00000440013 250 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
GTF2A2P52657 AC096536.1-201ENST00000443284 440 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
GTF2A2P52657 GLYCTK-203ENST00000461183 889 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
GTF2A2P52657 AC104596.1-201ENST00000507826 579 ntTSL 4 BASIC18.45■□□□□ 0.54
GTF2A2P52657 GTF2H2C-215ENST00000514162 610 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
GTF2A2P52657 RPL8-205ENST00000527914 551 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
GTF2A2P52657 SLC1A4-205ENST00000531327 1217 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
GTF2A2P52657 AIPL1-204ENST00000570466 1196 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
GTF2A2P52657 ZNF347-208ENST00000601804 496 ntTSL 4 BASIC18.45■□□□□ 0.54
GTF2A2P52657 RPL23AP53-203ENST00000606975 736 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
GTF2A2P52657 AL118558.3-201ENST00000607414 1079 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
GTF2A2P52657 APOBEC3H-206ENST00000613677 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
GTF2A2P52657 AL354718.3-201ENST00000616414 581 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
GTF2A2P52657 RDM1-220ENST00000616596 1032 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
GTF2A2P52657 RDM1-228ENST00000620284 1177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
GTF2A2P52657 CR382287.1-201ENST00000623954 586 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
GTF2A2P52657 KIAA0895-208ENST00000440378 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
GTF2A2P52657 RSPH6A-201ENST00000221538 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
GTF2A2P52657 OSTF1-201ENST00000346234 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
GTF2A2P52657 CRLF2-203ENST00000400841 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
GTF2A2P52657 HTR3E-201ENST00000335304 1912 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
GTF2A2P52657 VWA1-203ENST00000476993 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.3 ms