Protein–RNA interactions for Protein: P48742

LHX1, LIM/homeobox protein Lhx1, humanhuman

Predictions only

Length 406 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LHX1P48742 TVP23B-201ENST00000307767 2064 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
LHX1P48742 CYP4F3-202ENST00000585846 2056 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
LHX1P48742 ASS1-204ENST00000372394 1973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
LHX1P48742 CHAD-203ENST00000508540 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
LHX1P48742 BNIP3P1-202ENST00000550043 1585 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
LHX1P48742 ZBTB45P2-201ENST00000452245 1531 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
LHX1P48742 RBFOX3-212ENST00000584778 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
LHX1P48742 ZMIZ1-201ENST00000334512 7546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
LHX1P48742 SAP130-202ENST00000259235 4065 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
LHX1P48742 CCDC182-201ENST00000299415 832 ntAPPRIS P1 BASIC17.08■□□□□ 0.32
LHX1P48742 KLK8-202ENST00000320838 456 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
LHX1P48742 LCE5A-201ENST00000334269 819 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
LHX1P48742 AC236430.1-201ENST00000402231 743 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
LHX1P48742 FAM221A-202ENST00000409192 888 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
LHX1P48742 EFHD1-202ENST00000409613 1156 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
LHX1P48742 AL606760.1-201ENST00000458151 1181 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
LHX1P48742 PTK7-212ENST00000476760 902 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
LHX1P48742 CXCL6-203ENST00000515050 557 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
LHX1P48742 FAM92A-214ENST00000522324 1072 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
LHX1P48742 AC124067.4-202ENST00000522471 397 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
LHX1P48742 PTPRS-208ENST00000590509 893 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
LHX1P48742 MRNIP-225ENST00000610475 810 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
LHX1P48742 AC008761.3-201ENST00000624803 892 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
LHX1P48742 SMO-201ENST00000249373 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
LHX1P48742 SRRM2-201ENST00000301740 9353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
LHX1P48742 ZNF84-201ENST00000327668 7162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
LHX1P48742 PPP2R5B-201ENST00000164133 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
LHX1P48742 ZNF133-204ENST00000396026 2717 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
LHX1P48742 ZNF133-205ENST00000401790 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
LHX1P48742 ZNF133-206ENST00000402618 2622 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
LHX1P48742 TPPP-201ENST00000360578 6022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
LHX1P48742 MAST3-201ENST00000262811 5896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
LHX1P48742 SLC26A5-202ENST00000339444 2474 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
LHX1P48742 CYMP-AS1-201ENST00000457402 2351 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
LHX1P48742 STIM2-203ENST00000467011 3925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
LHX1P48742 C20orf166-AS1-201ENST00000412495 2302 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
LHX1P48742 ACOXL-201ENST00000340561 2188 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
LHX1P48742 PRKCSH-217ENST00000592741 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
LHX1P48742 PSMF1-201ENST00000246015 2042 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
LHX1P48742 SPAG9-205ENST00000505279 4659 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
LHX1P48742 AL596087.1-201ENST00000400979 1969 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
LHX1P48742 TMUB2-204ENST00000538716 1953 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
LHX1P48742 MAGEA2B-201ENST00000331220 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
LHX1P48742 LTBP2-205ENST00000556690 5614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
LHX1P48742 RNF187-201ENST00000305943 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
LHX1P48742 PCBP1-201ENST00000303577 1750 ntAPPRIS P1 BASIC17.07■□□□□ 0.32
LHX1P48742 TPBG-203ENST00000543496 2881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
LHX1P48742 PGAP3-201ENST00000300658 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
LHX1P48742 CBSL-202ENST00000617706 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
LHX1P48742 MDFIC-201ENST00000257724 4598 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
LHX1P48742 PARVB-210ENST00000619710 1530 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
LHX1P48742 GRAMD1A-202ENST00000411896 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
LHX1P48742 KIAA1324L-207ENST00000444627 3527 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
LHX1P48742 OTUB1-206ENST00000535715 1391 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
LHX1P48742 PES1-202ENST00000354694 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
LHX1P48742 OTUB1-202ENST00000422031 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
LHX1P48742 FP565260.3-204ENST00000623795 2238 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
LHX1P48742 ACY3-201ENST00000255082 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
LHX1P48742 USP13-201ENST00000263966 8323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
LHX1P48742 SEPT9-237ENST00000591198 2160 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
LHX1P48742 KIAA0319L-201ENST00000325722 4789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
LHX1P48742 ERCC1-201ENST00000013807 1278 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
LHX1P48742 PRDX5-202ENST00000347941 463 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
LHX1P48742 PNPO-202ENST00000434554 1196 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
LHX1P48742 HIST3H2BA-201ENST00000436555 524 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
LHX1P48742 AC006001.2-201ENST00000448096 393 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
LHX1P48742 IGFBP2-204ENST00000456764 846 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
LHX1P48742 TERF1P3-201ENST00000505638 1227 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
LHX1P48742 CPLX2-206ENST00000512824 518 ntTSL 4 BASIC17.07■□□□□ 0.32
LHX1P48742 SPSB2-204ENST00000523102 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
LHX1P48742 SPSB2-205ENST00000524270 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
LHX1P48742 STOM-203ENST00000538954 1257 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
LHX1P48742 ARL6IP1-202ENST00000546206 1107 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
LHX1P48742 AL161757.4-201ENST00000554149 621 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
LHX1P48742 SPIB-207ENST00000597855 564 ntTSL 4 BASIC17.07■□□□□ 0.32
LHX1P48742 AC008738.7-201ENST00000609744 511 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
LHX1P48742 SFT2D2-204ENST00000630869 1073 ntTSL 4 BASIC17.07■□□□□ 0.32
LHX1P48742 AC004233.2-201ENST00000573315 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
LHX1P48742 ATP6AP2-201ENST00000378438 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
LHX1P48742 TMEM5-205ENST00000537373 1966 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
LHX1P48742 PAK4-202ENST00000358301 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
LHX1P48742 FGFR3-208ENST00000481110 4217 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
LHX1P48742 ITM2C-201ENST00000326407 1888 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
LHX1P48742 ITGB1BP1-204ENST00000360635 4859 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
LHX1P48742 ORAI2-205ENST00000478730 5531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
LHX1P48742 ADGRB2-203ENST00000398538 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
LHX1P48742 IQCE-212ENST00000476665 2400 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
LHX1P48742 DAND5-202ENST00000585548 1731 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
LHX1P48742 HPN-201ENST00000262626 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
LHX1P48742 ARID1A-205ENST00000457599 6268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
LHX1P48742 GLIPR2-205ENST00000619700 1645 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
LHX1P48742 MFSD1-202ENST00000392813 2244 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
LHX1P48742 DYNC1I1-212ENST00000630942 2249 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
LHX1P48742 HCLS1-202ENST00000428394 1560 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
LHX1P48742 TPD52L2-209ENST00000611972 2197 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
LHX1P48742 SCRIB-202ENST00000356994 5218 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
LHX1P48742 PTGES3-202ENST00000414274 1547 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
LHX1P48742 TBC1D3D-201ENST00000616101 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
LHX1P48742 TBC1D3K-201ENST00000620247 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
LHX1P48742 CD276-213ENST00000561213 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.8 ms