Protein–RNA interactions for Protein: P48163

ME1, NADP-dependent malic enzyme, humanhuman

Predictions only

Length 572 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ME1P48163 MFNG-201ENST00000356998 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
ME1P48163 RFPL2-203ENST00000400237 2407 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
ME1P48163 CAMTA1-201ENST00000303635 8444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
ME1P48163 AC091100.1-201ENST00000558424 2354 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
ME1P48163 ZRSR2-201ENST00000307771 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
ME1P48163 ARHGEF6-202ENST00000370620 4764 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
ME1P48163 FBXO28-201ENST00000366862 5451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
ME1P48163 ALOX15B-205ENST00000573359 1809 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
ME1P48163 AC103702.1-201ENST00000548801 2630 ntBASIC18.58■□□□□ 0.57
ME1P48163 SYNCRIP-202ENST00000369622 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
ME1P48163 AC009237.3-202ENST00000608013 3042 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
ME1P48163 SYNRG-222ENST00000614941 3406 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
ME1P48163 ZNF7-207ENST00000528372 2905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
ME1P48163 CHMP1A-201ENST00000397901 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
ME1P48163 SLC1A7-204ENST00000611397 2499 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
ME1P48163 ABCB9-216ENST00000542678 6051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
ME1P48163 TBC1D7-201ENST00000343141 1027 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
ME1P48163 CD1E-209ENST00000368164 869 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
ME1P48163 CTRC-202ENST00000375949 898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
ME1P48163 RAB24-204ENST00000393611 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
ME1P48163 FALEC-201ENST00000416894 566 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
ME1P48163 NDUFB2-209ENST00000472695 503 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
ME1P48163 CFL1-202ENST00000524553 860 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
ME1P48163 AC023141.13-201ENST00000604991 943 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
ME1P48163 AL078644.1-201ENST00000609881 752 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
ME1P48163 SCN5A-214ENST00000612060 714 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
ME1P48163 SUN2-203ENST00000406622 2725 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
ME1P48163 PDE9A-205ENST00000349112 1616 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
ME1P48163 LUC7L3-202ENST00000393227 2284 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
ME1P48163 GRB2-202ENST00000316804 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
ME1P48163 C6orf106-203ENST00000374026 4232 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
ME1P48163 BCAR3-201ENST00000260502 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
ME1P48163 PHB-201ENST00000300408 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
ME1P48163 CKAP4-201ENST00000378026 3093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
ME1P48163 MYOC-201ENST00000037502 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
ME1P48163 GFRA2-208ENST00000524240 4921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ME1P48163 HOXD3-202ENST00000410016 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
ME1P48163 B3GALNT1-203ENST00000392781 3606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ME1P48163 SNAPC1-201ENST00000216294 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ME1P48163 AC100861.1-202ENST00000500853 1970 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
ME1P48163 PSMD2-201ENST00000310118 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ME1P48163 FOXP3-201ENST00000376197 1326 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
ME1P48163 B3GAT1-201ENST00000312527 3652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ME1P48163 CLCN7-202ENST00000382745 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ME1P48163 NR4A2-210ENST00000429376 1571 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
ME1P48163 AHCY-201ENST00000217426 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ME1P48163 TFF3-201ENST00000291525 407 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
ME1P48163 MYL6-202ENST00000348108 722 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
ME1P48163 CKLF-204ENST00000362093 412 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ME1P48163 HAUS4P1-201ENST00000406739 1145 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
ME1P48163 WWOX-204ENST00000408984 1227 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ME1P48163 COPS7B-207ENST00000410024 1103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
ME1P48163 AL049612.1-201ENST00000427017 694 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
ME1P48163 PRSS42-201ENST00000429665 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ME1P48163 TSPY3-202ENST00000440483 414 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
ME1P48163 AL732437.1-201ENST00000442008 595 ntTSL 4 BASIC18.57■□□□□ 0.56
ME1P48163 PQLC2L-205ENST00000461040 563 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
ME1P48163 AC019257.1-202ENST00000521498 445 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
ME1P48163 FLYWCH2-203ENST00000572006 754 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
ME1P48163 RASA1-201ENST00000274376 3752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ME1P48163 EPS8L2-231ENST00000614442 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
ME1P48163 PITPNM2-208ENST00000542749 6660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ME1P48163 FAM151A-201ENST00000302250 2005 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ME1P48163 CLDN14-201ENST00000342108 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ME1P48163 LINC02167-203ENST00000566900 1489 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
ME1P48163 SAMD4A-204ENST00000554335 3003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
ME1P48163 ZNF713-202ENST00000429591 4339 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
ME1P48163 ARVCF-201ENST00000263207 4041 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ME1P48163 ADAM15-205ENST00000360674 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ME1P48163 SSH3-203ENST00000376757 2990 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
ME1P48163 ZNF302-207ENST00000505365 2955 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
ME1P48163 NELFA-203ENST00000411638 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ME1P48163 GULP1-206ENST00000409830 1376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
ME1P48163 FAM228B-210ENST00000615575 1357 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
ME1P48163 ARHGAP9-203ENST00000424809 2569 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
ME1P48163 FOXS1-201ENST00000375978 1319 ntAPPRIS P1 BASIC18.56■□□□□ 0.56
ME1P48163 TRPV4-204ENST00000536838 2514 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
ME1P48163 WIPF3-202ENST00000409123 3491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
ME1P48163 IFRD1-202ENST00000403825 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
ME1P48163 CCDC136-212ENST00000487361 2268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
ME1P48163 SLC6A2-204ENST00000561820 2268 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
ME1P48163 CLPTM1L-216ENST00000630539 2032 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
ME1P48163 TBC1D10C-203ENST00000526387 1520 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
ME1P48163 CD99L2-202ENST00000355149 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
ME1P48163 SELENOH-201ENST00000388857 833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
ME1P48163 AC092474.2-201ENST00000424288 719 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
ME1P48163 SPDYE2-202ENST00000432940 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
ME1P48163 SPDYE2B-201ENST00000436228 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
ME1P48163 SPDYE5-201ENST00000455862 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
ME1P48163 NMU-203ENST00000507338 658 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
ME1P48163 AC106791.1-202ENST00000508281 1148 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
ME1P48163 SMCO4-204ENST00000527149 472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
ME1P48163 LDLRAD2-203ENST00000543870 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
ME1P48163 QPRT-203ENST00000562473 579 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
ME1P48163 TMEM88-202ENST00000574668 510 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
ME1P48163 AC007064.4-201ENST00000637740 555 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
ME1P48163 FOXRED2-204ENST00000397224 4967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
ME1P48163 AL354813.1-201ENST00000526566 2437 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
ME1P48163 TACR2-202ENST00000373307 1740 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
ME1P48163 OCLN-202ENST00000396442 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.6 ms