Protein–RNA interactions for Protein: P46100

ATRX, Transcriptional regulator ATRX, humanhuman

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Length 2,492 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATRXP46100 NDUFA3-214ENST00000485876 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
ATRXP46100 DIO3-201ENST00000510508 2102 ntAPPRIS P1 BASIC14.62□□□□□ -0.07
ATRXP46100 AC103808.3-201ENST00000579714 598 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
ATRXP46100 AC011447.3-204ENST00000585498 883 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
ATRXP46100 BRI3BPP1-201ENST00000594224 787 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
ATRXP46100 AL096828.3-201ENST00000615354 462 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
ATRXP46100 AC127024.7-201ENST00000625101 200 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
ATRXP46100 MRPS21-201ENST00000581066 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
ATRXP46100 CCDC120-206ENST00000603986 2379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
ATRXP46100 COMT-205ENST00000406520 1339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
ATRXP46100 AC134312.5-201ENST00000568031 1313 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
ATRXP46100 EIF1B-AS1-206ENST00000631175 1303 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
ATRXP46100 TMEM222-210ENST00000608611 1511 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
ATRXP46100 MAP6-201ENST00000304771 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
ATRXP46100 TUFM-201ENST00000313511 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
ATRXP46100 TMEM132A-201ENST00000005286 3480 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
ATRXP46100 HPS3-202ENST00000460120 2745 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
ATRXP46100 SH3BP4-202ENST00000392011 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
ATRXP46100 FBXL15-201ENST00000224862 2362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
ATRXP46100 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
ATRXP46100 NAT8-201ENST00000272425 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
ATRXP46100 KRTAP1-4-201ENST00000377747 408 ntAPPRIS P1 BASIC14.61□□□□□ -0.07
ATRXP46100 ITIH1-202ENST00000405128 1122 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
ATRXP46100 LINC01006-204ENST00000435354 545 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
ATRXP46100 FAM86KP-201ENST00000509817 987 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
ATRXP46100 MTX3-202ENST00000512528 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
ATRXP46100 RPS25-202ENST00000527673 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
ATRXP46100 AC012158.2-201ENST00000536546 354 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
ATRXP46100 AC004803.1-204ENST00000543290 512 ntTSL 4 BASIC14.61□□□□□ -0.07
ATRXP46100 GMFG-209ENST00000600322 622 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
ATRXP46100 HDAC10-205ENST00000448072 2133 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
ATRXP46100 LINC01097-201ENST00000627163 2122 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
ATRXP46100 RBFOX3-212ENST00000584778 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
ATRXP46100 BTBD11-205ENST00000490090 4614 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
ATRXP46100 PKP3-201ENST00000331563 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
ATRXP46100 MIIP-201ENST00000235332 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
ATRXP46100 LZTS2-202ENST00000370223 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
ATRXP46100 DYRK1B-205ENST00000597639 1806 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
ATRXP46100 ORAI2-204ENST00000473939 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
ATRXP46100 STIM2-202ENST00000465503 3613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
ATRXP46100 B3GNT2-201ENST00000301998 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
ATRXP46100 ALDH3A1-206ENST00000457500 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
ATRXP46100 ABHD11-201ENST00000222800 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
ATRXP46100 ECEL1-201ENST00000304546 2865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
ATRXP46100 ARCN1-203ENST00000392859 1709 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
ATRXP46100 CNST-202ENST00000366512 2422 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
ATRXP46100 CD276-203ENST00000537340 2439 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
ATRXP46100 AC092614.1-201ENST00000419640 909 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
ATRXP46100 FOXP4-AS1-203ENST00000439386 404 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
ATRXP46100 AL391069.2-202ENST00000447795 622 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
ATRXP46100 TIMM8B-201ENST00000504148 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
ATRXP46100 ALG1L13P-202ENST00000519320 584 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
ATRXP46100 TMBIM4-208ENST00000542724 770 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
ATRXP46100 BX537318.1-201ENST00000608290 1207 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
ATRXP46100 FO393412.1-201ENST00000619841 382 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
ATRXP46100 AC005252.2-201ENST00000624630 1141 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
ATRXP46100 TMUB2-209ENST00000587989 1969 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
ATRXP46100 YY1AP1-206ENST00000359205 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
ATRXP46100 CEP120-201ENST00000306467 4900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
ATRXP46100 RASA4B-201ENST00000306682 2589 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
ATRXP46100 BECN1-201ENST00000361523 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
ATRXP46100 HECTD2-203ENST00000371681 2175 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
ATRXP46100 FAM219B-204ENST00000563119 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
ATRXP46100 TOR4A-201ENST00000357503 4148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
ATRXP46100 ITGB2-AS1-202ENST00000441379 2282 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
ATRXP46100 B3GALT5-206ENST00000615480 2617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
ATRXP46100 FAM210A-201ENST00000322247 4340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
ATRXP46100 KANK1-204ENST00000382293 5249 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
ATRXP46100 BEX5-201ENST00000333643 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
ATRXP46100 CTSL-202ENST00000342020 933 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
ATRXP46100 LINC01433-201ENST00000419003 697 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
ATRXP46100 MSRA-203ENST00000441698 788 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
ATRXP46100 EFCAB10-201ENST00000460135 717 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
ATRXP46100 ZNF124-204ENST00000491356 956 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
ATRXP46100 NUP210P1-202ENST00000504322 710 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
ATRXP46100 AC024267.1-201ENST00000582320 895 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
ATRXP46100 POLR2E-204ENST00000586746 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
ATRXP46100 AC133539.2-201ENST00000604757 467 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
ATRXP46100 C18orf21-208ENST00000618334 856 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
ATRXP46100 AL805961.1-201ENST00000642026 753 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
ATRXP46100 FGFR1-238ENST00000532791 5590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
ATRXP46100 RNFT2-202ENST00000319176 2180 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
ATRXP46100 PTBP1-220ENST00000627714 2201 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
ATRXP46100 PICALM-219ENST00000532317 3474 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
ATRXP46100 RALGAPA1-219ENST00000637992 8512 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
ATRXP46100 IMP3-201ENST00000314852 2028 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
ATRXP46100 ACTRT3-201ENST00000330368 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
ATRXP46100 WT1-205ENST00000452863 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
ATRXP46100 GFOD2-201ENST00000268797 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
ATRXP46100 EGR2-203ENST00000439032 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
ATRXP46100 GTF3C4-201ENST00000372146 9043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
ATRXP46100 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
ATRXP46100 ACYP1-201ENST00000238618 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
ATRXP46100 PSMB5-202ENST00000361611 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
ATRXP46100 HDAC8-204ENST00000373560 819 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
ATRXP46100 KCNAB2-207ENST00000378111 822 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
ATRXP46100 MIR503HG-202ENST00000440570 760 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
ATRXP46100 AC069208.1-205ENST00000456299 576 ntTSL 4 BASIC14.6□□□□□ -0.07
ATRXP46100 LITAF-218ENST00000576036 603 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.6□□□□□ -0.07
ATRXP46100 AL133499.1-201ENST00000596207 608 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
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