Protein–RNA interactions for Protein: P43681

CHRNA4, Neuronal acetylcholine receptor subunit alpha-4, humanhuman

Predictions only

Length 627 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNA4P43681 KIAA1147-202ENST00000536163 7296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CHRNA4P43681 MEGF6-201ENST00000294599 4501 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CHRNA4P43681 FDX1-201ENST00000260270 3206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CHRNA4P43681 SLC46A2-201ENST00000374228 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CHRNA4P43681 IER2-203ENST00000588173 2934 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CHRNA4P43681 AC068831.3-201ENST00000553321 1858 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CHRNA4P43681 NIPA2-204ENST00000398014 3130 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CHRNA4P43681 CDH15-201ENST00000289746 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CHRNA4P43681 KHK-202ENST00000260599 2411 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CHRNA4P43681 DLX4-201ENST00000240306 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CHRNA4P43681 C1QTNF6-202ENST00000397110 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CHRNA4P43681 CASZ1-202ENST00000377022 7936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CHRNA4P43681 SPATS2L-202ENST00000360760 2119 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CHRNA4P43681 KRT18P13-201ENST00000400056 1290 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
CHRNA4P43681 AL158071.2-201ENST00000423380 815 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CHRNA4P43681 KIAA0930-215ENST00000496226 589 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CHRNA4P43681 SERF1A-207ENST00000512649 846 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CHRNA4P43681 RNA5SP410-201ENST00000516285 106 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
CHRNA4P43681 FGD4-212ENST00000534526 2977 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CHRNA4P43681 CCND1-203ENST00000536559 553 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CHRNA4P43681 GALNT9-208ENST00000541995 1001 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CHRNA4P43681 AC068594.1-203ENST00000581153 695 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CHRNA4P43681 KF456478.1-201ENST00000585980 472 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CHRNA4P43681 AC084121.4-201ENST00000641598 221 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
CHRNA4P43681 AF228730.8-201ENST00000642140 221 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
CHRNA4P43681 KCNJ5-201ENST00000338350 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CHRNA4P43681 ACOXL-201ENST00000340561 2188 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CHRNA4P43681 AZI2-205ENST00000420543 1366 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CHRNA4P43681 MPPED1-202ENST00000417669 3657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CHRNA4P43681 SIGLEC6-205ENST00000425629 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CHRNA4P43681 IFT140-201ENST00000361339 2987 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CHRNA4P43681 ROR2-202ENST00000375715 2993 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CHRNA4P43681 MON2-203ENST00000546600 6130 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CHRNA4P43681 FGF11-201ENST00000293829 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CHRNA4P43681 TUBB4A-201ENST00000264071 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CHRNA4P43681 KDM4B-211ENST00000611640 5703 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CHRNA4P43681 VSTM2A-204ENST00000407838 3112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CHRNA4P43681 SLA2-202ENST00000360672 2171 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CHRNA4P43681 RAP2C-201ENST00000342983 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CHRNA4P43681 CFLAR-214ENST00000443227 1679 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CHRNA4P43681 APBB2-204ENST00000502841 1681 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CHRNA4P43681 KCNC2-209ENST00000550433 2931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CHRNA4P43681 UEVLD-203ENST00000379387 1848 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CHRNA4P43681 CBR1-202ENST00000399191 838 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CHRNA4P43681 HAUS4P1-201ENST00000406739 1145 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
CHRNA4P43681 AL627223.1-201ENST00000416693 442 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
CHRNA4P43681 TMEM91-205ENST00000436170 864 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CHRNA4P43681 ITPA-203ENST00000455664 729 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CHRNA4P43681 AHSA2-208ENST00000489653 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CHRNA4P43681 VASH2-211ENST00000517399 1068 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CHRNA4P43681 AP001107.2-202ENST00000528650 480 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CHRNA4P43681 NDUFS7-216ENST00000546283 1060 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CHRNA4P43681 COX14-202ENST00000548985 677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CHRNA4P43681 NDUFAB1-205ENST00000570319 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CHRNA4P43681 CU104787.1-201ENST00000624155 288 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CHRNA4P43681 LINC00466-208ENST00000635218 1217 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CHRNA4P43681 AC134684.3-201ENST00000641758 218 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
CHRNA4P43681 MYEF2-215ENST00000610570 2591 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CHRNA4P43681 RASA4-204ENST00000462172 2634 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CHRNA4P43681 DRG2-201ENST00000225729 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CHRNA4P43681 SEPT5-204ENST00000406395 1974 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CHRNA4P43681 NTRK2-206ENST00000376213 5560 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CHRNA4P43681 REPIN1-202ENST00000425389 2876 ntAPPRIS P3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CHRNA4P43681 KLHL36-204ENST00000564996 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CHRNA4P43681 PDLIM1-201ENST00000329399 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CHRNA4P43681 FLJ31104-201ENST00000500093 2289 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CHRNA4P43681 ACOX3-203ENST00000503233 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CHRNA4P43681 ZNF425-201ENST00000378061 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CHRNA4P43681 CD83-201ENST00000379153 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CHRNA4P43681 LGR6-205ENST00000439764 2487 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CHRNA4P43681 RGS20-201ENST00000276500 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CHRNA4P43681 QRFP-202ENST00000623824 1658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CHRNA4P43681 GLS2-217ENST00000623608 2518 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CHRNA4P43681 OCLN-202ENST00000396442 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
CHRNA4P43681 ARPC1B-211ENST00000451682 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
CHRNA4P43681 PKP4-AS1-203ENST00000629904 1951 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
CHRNA4P43681 NCAPH2-205ENST00000420993 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
CHRNA4P43681 LINC01529-205ENST00000637365 2000 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
CHRNA4P43681 TTLL3-213ENST00000430793 2097 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
CHRNA4P43681 CYP4F3-202ENST00000585846 2056 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
CHRNA4P43681 ARFGAP1-210ENST00000519273 3176 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
CHRNA4P43681 RAVER2-202ENST00000371072 4362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CHRNA4P43681 WDR81-204ENST00000419248 3315 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
CHRNA4P43681 ACE-203ENST00000413513 2237 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
CHRNA4P43681 ATP6AP2-217ENST00000636580 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CHRNA4P43681 ANKK1-201ENST00000303941 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CHRNA4P43681 C11orf88-201ENST00000332814 795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
CHRNA4P43681 ZNF593-202ENST00000374266 675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CHRNA4P43681 CACNB2-206ENST00000377328 1233 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CHRNA4P43681 FAM220BP-201ENST00000377689 816 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
CHRNA4P43681 PCDH1-203ENST00000394536 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CHRNA4P43681 KRT18P32-201ENST00000424695 1287 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
CHRNA4P43681 AL122058.1-202ENST00000426580 252 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
CHRNA4P43681 ZNF295-AS1-202ENST00000429739 783 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CHRNA4P43681 USP30-AS1-201ENST00000478808 656 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
CHRNA4P43681 RPL8-207ENST00000528957 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CHRNA4P43681 AC069503.2-201ENST00000546333 576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
CHRNA4P43681 AC008127.1-201ENST00000548424 499 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
CHRNA4P43681 HOPX-214ENST00000556614 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CHRNA4P43681 CIRBP-204ENST00000585630 870 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.2 ms