Protein–RNA interactions for Protein: P43155

CRAT, Carnitine O-acetyltransferase, humanhuman

Predictions only

Length 626 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRATP43155 SPCS2-207ENST00000530257 612 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CRATP43155 POLD4-207ENST00000531239 584 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CRATP43155 MAP1LC3B-207ENST00000565788 625 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CRATP43155 OVCA2-201ENST00000572195 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CRATP43155 TCAP-202ENST00000578283 583 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CRATP43155 ICAM2-208ENST00000579788 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CRATP43155 CALM3-211ENST00000598871 561 ntTSL 4 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CRATP43155 PRKN-208ENST00000610470 531 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CRATP43155 PRKN-209ENST00000612485 225 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CRATP43155 AL773604.1-201ENST00000617417 272 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
CRATP43155 LIN28B-AS1-205ENST00000637414 879 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CRATP43155 KDM3A-201ENST00000312912 4886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CRATP43155 TRIM7-201ENST00000274773 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CRATP43155 COL4A3BP-204ENST00000405807 2843 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CRATP43155 PAK4-208ENST00000599386 5735 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CRATP43155 KRAS-202ENST00000311936 5765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CRATP43155 USP35-203ENST00000529308 4216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CRATP43155 KCP-208ENST00000620378 4515 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CRATP43155 GABRA5-202ENST00000355395 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CRATP43155 MGME1-202ENST00000377709 1936 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CRATP43155 FOXP3-206ENST00000557224 1371 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CRATP43155 PBX3-204ENST00000373489 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CRATP43155 UBXN2B-201ENST00000399598 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CRATP43155 RPS6KB1-203ENST00000406116 1982 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CRATP43155 FAF1-202ENST00000396153 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CRATP43155 BCL2L12-202ENST00000246785 1431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CRATP43155 C16orf89-202ENST00000472572 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CRATP43155 IL1RN-202ENST00000354115 1747 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CRATP43155 DCTN1-203ENST00000409240 4365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CRATP43155 PDLIM1-201ENST00000329399 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CRATP43155 SLC3A2-208ENST00000536981 1486 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CRATP43155 HMBOX1-212ENST00000558662 1765 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CRATP43155 GINS2-201ENST00000253462 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CRATP43155 RBM47-202ENST00000381793 4816 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CRATP43155 AC005064.1-201ENST00000422488 2725 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CRATP43155 AC019205.2-202ENST00000441363 2403 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CRATP43155 LTBP2-201ENST00000261978 8567 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CRATP43155 SRD5A2-201ENST00000622030 4648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CRATP43155 ZNF114-204ENST00000595607 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CRATP43155 EPS8L2-201ENST00000318562 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CRATP43155 GNRHR2-201ENST00000312753 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CRATP43155 PLGRKT-201ENST00000223864 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CRATP43155 NDUFS7-201ENST00000233627 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CRATP43155 AC004870.1-201ENST00000315132 882 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
CRATP43155 MAL-203ENST00000353004 873 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CRATP43155 MRPL9-202ENST00000368830 1296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CRATP43155 SDR39U1-201ENST00000399395 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CRATP43155 CRYGEP-201ENST00000412192 528 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
CRATP43155 AC098831.1-202ENST00000438821 336 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
CRATP43155 VN2R19P-201ENST00000442399 1052 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
CRATP43155 FTCD-AS1-201ENST00000446649 500 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CRATP43155 HYAL1-206ENST00000447605 666 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CRATP43155 PLA2G12A-202ENST00000502283 1189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CRATP43155 SMN1-203ENST00000503079 1219 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CRATP43155 ARSK-202ENST00000504763 1088 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CRATP43155 AL356056.2-201ENST00000506914 669 ntTSL 4 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CRATP43155 CYB561D1-208ENST00000528785 1271 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CRATP43155 GPHA2-202ENST00000532246 466 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CRATP43155 AL162171.1-201ENST00000556328 718 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CRATP43155 UBE2Q2P1-205ENST00000559871 534 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CRATP43155 FBF1-204ENST00000586631 621 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CRATP43155 AL049840.3-201ENST00000602669 611 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
CRATP43155 AC097376.2-204ENST00000609359 627 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CRATP43155 AL691432.3-201ENST00000621860 400 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
CRATP43155 CCP110-201ENST00000381396 5446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CRATP43155 SEMA3G-201ENST00000231721 4899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CRATP43155 HEY1-208ENST00000523976 1325 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CRATP43155 FES-204ENST00000414248 2327 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CRATP43155 CCT7-216ENST00000540468 1674 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CRATP43155 HTR1B-201ENST00000369947 2021 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CRATP43155 SEC63-201ENST00000369002 6411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CRATP43155 CHRNG-201ENST00000389492 1398 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CRATP43155 SLC22A5-203ENST00000435065 1746 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CRATP43155 DUSP13-210ENST00000491677 1770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CRATP43155 NR4A3-201ENST00000330847 4982 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CRATP43155 ARFIP2-203ENST00000423813 1430 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CRATP43155 SLC43A2-204ENST00000571650 3261 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CRATP43155 ATG9A-205ENST00000409618 4025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
CRATP43155 B3GAT1-201ENST00000312527 3652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
CRATP43155 ROR2-202ENST00000375715 2993 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
CRATP43155 BPTF-202ENST00000321892 11292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
CRATP43155 C19orf48-201ENST00000345523 1503 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
CRATP43155 OGFOD2-202ENST00000397389 2308 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
CRATP43155 SOX30-202ENST00000311371 2716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
CRATP43155 CCAR2-202ENST00000389279 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CRATP43155 MARK4-202ENST00000300843 5209 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CRATP43155 ACOT7-204ENST00000377855 1614 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CRATP43155 AP002360.1-202ENST00000530460 2462 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CRATP43155 C14orf79-205ENST00000549240 2503 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CRATP43155 WARS-232ENST00000556645 2508 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CRATP43155 PTH2-201ENST00000270631 459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CRATP43155 NDUFB9-201ENST00000276689 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CRATP43155 TSPEAR-202ENST00000397916 2114 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CRATP43155 UBE2C-206ENST00000405520 641 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CRATP43155 AL031284.1-201ENST00000419297 478 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
CRATP43155 ODF3B-205ENST00000428989 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CRATP43155 IL32-212ENST00000526464 1198 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CRATP43155 IL32-217ENST00000530538 674 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CRATP43155 CD63-210ENST00000550776 870 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CRATP43155 RN7SL510P-201ENST00000581311 263 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.9 ms