Protein–RNA interactions for Protein: P37235

HPCAL1, Hippocalcin-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 193 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HPCAL1P37235 PM20D2-201ENST00000275072 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
HPCAL1P37235 AC020659.1-201ENST00000309874 2900 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
HPCAL1P37235 SPATA20-201ENST00000006658 2719 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
HPCAL1P37235 SLC5A7-201ENST00000264047 5152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
HPCAL1P37235 PCDHGB2-202ENST00000622527 2588 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
HPCAL1P37235 ZNF804B-201ENST00000333190 4659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
HPCAL1P37235 ADRA1A-202ENST00000354550 1765 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
HPCAL1P37235 ZMYND12-201ENST00000372565 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
HPCAL1P37235 CXCL14-202ENST00000512158 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
HPCAL1P37235 ZSCAN18-208ENST00000595944 1768 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
HPCAL1P37235 PARVB-203ENST00000404989 1591 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
HPCAL1P37235 PARVB-204ENST00000406477 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
HPCAL1P37235 GTPBP8-208ENST00000619116 1378 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
HPCAL1P37235 SLC29A1-205ENST00000371740 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
HPCAL1P37235 CNGB1-201ENST00000251102 5641 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
HPCAL1P37235 MAP4K1-208ENST00000589130 2654 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
HPCAL1P37235 NFATC4-204ENST00000424781 5488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
HPCAL1P37235 CNPPD1-202ENST00000409789 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
HPCAL1P37235 XPO1-201ENST00000401558 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
HPCAL1P37235 TRIM67-202ENST00000444294 9320 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
HPCAL1P37235 NPM2-203ENST00000397940 1874 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
HPCAL1P37235 AIFM2-204ENST00000613322 3247 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
HPCAL1P37235 GTF3C4-201ENST00000372146 9043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
HPCAL1P37235 CASR-202ENST00000498619 5009 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
HPCAL1P37235 IRF5-215ENST00000619830 1652 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
HPCAL1P37235 SLC29A2-207ENST00000619145 2380 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
HPCAL1P37235 REEP4-202ENST00000334530 1476 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
HPCAL1P37235 TFF3-201ENST00000291525 407 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
HPCAL1P37235 ICOSLG-201ENST00000344330 1009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
HPCAL1P37235 LINC00421-201ENST00000413833 1054 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
HPCAL1P37235 AC009947.1-201ENST00000444350 727 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
HPCAL1P37235 IL32-212ENST00000526464 1198 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
HPCAL1P37235 UNC93B6-202ENST00000528242 690 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
HPCAL1P37235 CYB561D1-208ENST00000528785 1271 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
HPCAL1P37235 IL32-217ENST00000530538 674 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
HPCAL1P37235 AP001005.1-201ENST00000571755 1248 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
HPCAL1P37235 LITAF-211ENST00000572255 516 ntTSL 4 BASIC15.61■□□□□ 0.09
HPCAL1P37235 LITAF-215ENST00000574763 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
HPCAL1P37235 AC008878.2-201ENST00000601870 942 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.61■□□□□ 0.09
HPCAL1P37235 NUP58-201ENST00000381718 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
HPCAL1P37235 ITFG1-201ENST00000320640 3400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
HPCAL1P37235 NAGK-208ENST00000455662 1778 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
HPCAL1P37235 MAP7D1-203ENST00000373150 3238 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
HPCAL1P37235 INPP5J-204ENST00000402238 1564 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
HPCAL1P37235 BPTF-202ENST00000321892 11292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
HPCAL1P37235 LRRC57-202ENST00000397130 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
HPCAL1P37235 AC093627.6-201ENST00000478759 1365 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
HPCAL1P37235 PRKD2-216ENST00000601806 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
HPCAL1P37235 RHOC-201ENST00000285735 2199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
HPCAL1P37235 GPR89B-201ENST00000314163 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
HPCAL1P37235 MCM3AP-AS1-202ENST00000420074 1947 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
HPCAL1P37235 ERP29-203ENST00000546477 1698 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
HPCAL1P37235 CCNA1-203ENST00000625767 1699 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
HPCAL1P37235 CRYZL1-202ENST00000361534 2224 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
HPCAL1P37235 TMEM143-202ENST00000377431 1960 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
HPCAL1P37235 AC010491.1-201ENST00000563101 2797 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
HPCAL1P37235 ZNF84-202ENST00000392319 7020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
HPCAL1P37235 SLC22A5-203ENST00000435065 1746 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
HPCAL1P37235 ZRSR2-201ENST00000307771 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
HPCAL1P37235 GLG1-202ENST00000422840 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
HPCAL1P37235 AC005253.1-201ENST00000597411 2001 ntTSL 4 BASIC15.6■□□□□ 0.09
HPCAL1P37235 TAS1R1-201ENST00000333172 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
HPCAL1P37235 TRIM13-204ENST00000420995 2607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
HPCAL1P37235 WDR45-234ENST00000634838 1545 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
HPCAL1P37235 TBC1D7-201ENST00000343141 1027 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
HPCAL1P37235 SUMO1-201ENST00000392244 831 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
HPCAL1P37235 RAB24-204ENST00000393611 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
HPCAL1P37235 MCFD2-203ENST00000409147 671 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
HPCAL1P37235 SUMO1-209ENST00000409712 761 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
HPCAL1P37235 IGLL3P-201ENST00000412472 434 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
HPCAL1P37235 AL354836.1-201ENST00000414042 681 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
HPCAL1P37235 PRSS42-201ENST00000429665 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
HPCAL1P37235 LINC02447-202ENST00000501888 2146 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
HPCAL1P37235 NPM2-204ENST00000518119 1190 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
HPCAL1P37235 MRNIP-205ENST00000518235 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
HPCAL1P37235 NUBP2-214ENST00000568706 913 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
HPCAL1P37235 AC002398.2-201ENST00000587767 660 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
HPCAL1P37235 AC008738.3-201ENST00000589932 659 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
HPCAL1P37235 AC116407.3-201ENST00000623905 1129 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
HPCAL1P37235 PSMA6-216ENST00000627895 484 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
HPCAL1P37235 KIFC1-211ENST00000428849 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
HPCAL1P37235 BCL2L11-219ENST00000619294 5132 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
HPCAL1P37235 FAM131A-207ENST00000450976 1335 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
HPCAL1P37235 GLIPR2-205ENST00000619700 1645 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
HPCAL1P37235 CABP1-201ENST00000288616 1369 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
HPCAL1P37235 PPIL6-207ENST00000521072 4128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
HPCAL1P37235 ZNF574-202ENST00000359044 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
HPCAL1P37235 CRK-201ENST00000300574 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
HPCAL1P37235 SFRP2-201ENST00000274063 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
HPCAL1P37235 CDC14C-201ENST00000428251 1719 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
HPCAL1P37235 TLE3-223ENST00000560939 3021 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
HPCAL1P37235 BICD2-202ENST00000375512 4636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
HPCAL1P37235 ANKMY1-203ENST00000373318 2449 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
HPCAL1P37235 SUPT20HL2-201ENST00000486479 2409 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
HPCAL1P37235 EXT2-210ENST00000533608 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
HPCAL1P37235 CALHM2-202ENST00000369788 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
HPCAL1P37235 TMEM237-202ENST00000409444 5592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
HPCAL1P37235 LOH12CR2-201ENST00000381800 1540 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
HPCAL1P37235 ROBO3-201ENST00000397801 4569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
HPCAL1P37235 ROBO3-220ENST00000538940 4551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.5 ms