Protein–RNA interactions for Protein: P35716

SOX11, Transcription factor SOX-11, humanhuman

Predictions only

Length 441 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SOX11P35716 TMEM97-201ENST00000226230 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SOX11P35716 C14orf93-202ENST00000341470 2221 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SOX11P35716 RAB5A-203ENST00000422242 1443 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SOX11P35716 AC092850.2-201ENST00000623821 2697 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
SOX11P35716 ELL-203ENST00000596124 1852 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SOX11P35716 KRAS-202ENST00000311936 5765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SOX11P35716 AP004609.1-201ENST00000498872 1646 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SOX11P35716 GCFC2-201ENST00000321027 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SOX11P35716 NBEA-203ENST00000379939 10738 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SOX11P35716 RESP18-201ENST00000333527 795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SOX11P35716 PNRC2-202ENST00000374468 814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SOX11P35716 DHRS12-203ENST00000444610 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SOX11P35716 EHMT1-216ENST00000493484 1182 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SOX11P35716 AC105202.1-202ENST00000522060 834 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SOX11P35716 MVB12A-211ENST00000529939 1091 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SOX11P35716 AC018845.2-201ENST00000568326 409 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
SOX11P35716 OR7E47P-204ENST00000575924 449 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
SOX11P35716 AC092865.6-201ENST00000642101 219 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
SOX11P35716 GPAT2-204ENST00000453542 2466 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SOX11P35716 GPER1-206ENST00000617001 1900 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SOX11P35716 ISPD-202ENST00000407010 5524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SOX11P35716 MAP1S-201ENST00000324096 3419 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SOX11P35716 BANP-217ENST00000479780 1551 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SOX11P35716 GALE-216ENST00000617979 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SOX11P35716 MARCKS-201ENST00000612661 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SOX11P35716 HNRNPRP1-201ENST00000453465 1695 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
SOX11P35716 SLC24A3-201ENST00000328041 3929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SOX11P35716 RASAL1-207ENST00000548055 2502 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SOX11P35716 PODNL1-201ENST00000254320 1859 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SOX11P35716 WBP2-204ENST00000585462 1895 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SOX11P35716 TMED7-TICAM2-202ENST00000333314 3453 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SOX11P35716 CAPRIN1-207ENST00000529307 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SOX11P35716 IQCC-202ENST00000537469 2252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SOX11P35716 SNTG2-202ENST00000407292 1436 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SOX11P35716 ITSN1-205ENST00000381291 5437 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SOX11P35716 RASL11A-201ENST00000241463 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SOX11P35716 PCMTD1-206ENST00000521344 1712 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SOX11P35716 CLCN2-202ENST00000344937 3187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SOX11P35716 CDK1-204ENST00000448257 1948 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SOX11P35716 GRIN2A-201ENST00000330684 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SOX11P35716 KCNQ4-201ENST00000347132 4099 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SOX11P35716 CTBP1-209ENST00000510568 4250 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SOX11P35716 FAM222B-202ENST00000452648 2836 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SOX11P35716 TLE3-223ENST00000560939 3021 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SOX11P35716 PCDHA4-203ENST00000530339 5251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SOX11P35716 C19orf70-201ENST00000309324 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SOX11P35716 HCCS-203ENST00000380763 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SOX11P35716 AP1S3-203ENST00000396654 830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SOX11P35716 THAP7-202ENST00000399133 1144 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SOX11P35716 AL049612.1-201ENST00000427017 694 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SOX11P35716 SNHG17-206ENST00000436764 973 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SOX11P35716 POLD4-207ENST00000531239 584 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SOX11P35716 MAL2-202ENST00000531508 892 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SOX11P35716 LHX5-AS1-201ENST00000551357 522 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SOX11P35716 LYRM1-209ENST00000568663 857 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SOX11P35716 CROCCP3-203ENST00000589964 255 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SOX11P35716 HIST1H2AK-201ENST00000618958 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SOX11P35716 AC134684.3-201ENST00000641758 218 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
SOX11P35716 DHFR-201ENST00000439211 3917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SOX11P35716 CD9-203ENST00000382518 1556 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SOX11P35716 NOX4-207ENST00000525196 1555 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SOX11P35716 KCTD14-201ENST00000353172 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SOX11P35716 PTHLH-202ENST00000395868 1674 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SOX11P35716 DNAH14-206ENST00000400952 1984 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SOX11P35716 SFTPA2-201ENST00000372325 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SOX11P35716 CAAP1-201ENST00000333916 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SOX11P35716 MIR600HG-201ENST00000449175 5984 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
SOX11P35716 MAGI1-201ENST00000330909 7415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SOX11P35716 KCTD15-201ENST00000284006 4918 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SOX11P35716 MFRP-205ENST00000619721 3917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SOX11P35716 AL354813.1-201ENST00000526566 2437 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SOX11P35716 ZP3-204ENST00000416245 1846 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SOX11P35716 RIMS1-216ENST00000521978 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SOX11P35716 SNX19-207ENST00000528555 1506 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SOX11P35716 DFFA-201ENST00000377036 1403 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SOX11P35716 AL590787.1-201ENST00000568856 1315 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
SOX11P35716 CDKN1A-203ENST00000405375 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SOX11P35716 C12orf65-201ENST00000253233 2073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SOX11P35716 AC005920.1-201ENST00000501718 2054 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SOX11P35716 RASD2-201ENST00000216127 3412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SOX11P35716 AL596087.1-201ENST00000400979 1969 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
SOX11P35716 MGME1-201ENST00000377704 1781 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SOX11P35716 EIF2B4-212ENST00000622434 1771 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SOX11P35716 AC006538.1-201ENST00000567905 1585 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
SOX11P35716 ALOX15-205ENST00000574640 2422 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SOX11P35716 AL671710.1-201ENST00000610245 2349 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
SOX11P35716 FAM160B1-202ENST00000369248 5810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SOX11P35716 MANSC1-201ENST00000396349 2220 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SOX11P35716 FGF11-201ENST00000293829 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SOX11P35716 JMJD7-203ENST00000408047 1192 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SOX11P35716 YIPF7-202ENST00000415895 1196 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SOX11P35716 YBX1P5-201ENST00000509441 847 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
SOX11P35716 CD63-210ENST00000550776 870 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SOX11P35716 DUX4L17-201ENST00000557360 1267 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
SOX11P35716 AC096734.2-201ENST00000562054 433 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
SOX11P35716 AC092131.1-201ENST00000564046 548 ntTSL 4 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SOX11P35716 KLK6-204ENST00000594641 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SOX11P35716 TVP23A-210ENST00000612195 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SOX11P35716 AL513190.1-201ENST00000621254 727 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
SOX11P35716 AC010507.1-201ENST00000633895 436 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 94 ms