Protein–RNA interactions for Protein: P29033

GJB2, Gap junction beta-2 protein, humanhuman

Predictions only

Length 226 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GJB2P29033 UEVLD-203ENST00000379387 1848 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
GJB2P29033 LINC00391-201ENST00000433569 1844 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
GJB2P29033 WIPF3-202ENST00000409123 3491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
GJB2P29033 NDUFB2-AS1-201ENST00000465466 1648 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
GJB2P29033 AC136621.1-201ENST00000624017 2304 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
GJB2P29033 ACTN2-207ENST00000546208 5103 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
GJB2P29033 ZNF385C-205ENST00000618554 2596 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
GJB2P29033 RSRC1-211ENST00000480820 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
GJB2P29033 NRBP1-201ENST00000233557 2887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
GJB2P29033 SEMA4F-201ENST00000339773 2177 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
GJB2P29033 ZXDC-202ENST00000389709 3405 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
GJB2P29033 TNRC18-202ENST00000399434 1459 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
GJB2P29033 TRPC4AP-201ENST00000252015 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
GJB2P29033 LMBR1-202ENST00000359422 4727 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
GJB2P29033 KLF11-201ENST00000305883 4030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
GJB2P29033 MRI1-202ENST00000319545 3027 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
GJB2P29033 NPL-204ENST00000367554 3027 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
GJB2P29033 NSUN5-203ENST00000428206 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
GJB2P29033 SSR4P1-203ENST00000599569 2260 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
GJB2P29033 HDAC5-201ENST00000225983 5326 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
GJB2P29033 PLPPR4-203ENST00000457765 4846 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
GJB2P29033 NCOA6-206ENST00000612493 4082 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
GJB2P29033 NPB-201ENST00000333383 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
GJB2P29033 ZNF593-202ENST00000374266 675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
GJB2P29033 AC245100.5-201ENST00000452108 331 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
GJB2P29033 AC012363.1-201ENST00000455707 575 ntTSL 4 BASIC18.92■□□□□ 0.62
GJB2P29033 GSTK1-207ENST00000479303 1185 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
GJB2P29033 TNFSF13-208ENST00000483039 959 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
GJB2P29033 AC009133.1-203ENST00000569039 589 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
GJB2P29033 IGFLR1-205ENST00000588992 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
GJB2P29033 FHL2-212ENST00000607522 759 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
GJB2P29033 IRF1-211ENST00000613424 821 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
GJB2P29033 AC092811.2-201ENST00000632561 559 ntTSL 4 BASIC18.92■□□□□ 0.62
GJB2P29033 ANKMY2-201ENST00000306999 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
GJB2P29033 NTRK3-202ENST00000355254 2938 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
GJB2P29033 RFK-201ENST00000376736 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
GJB2P29033 LINC01660-203ENST00000618517 1859 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
GJB2P29033 C1QTNF2-201ENST00000393975 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
GJB2P29033 AADAT-208ENST00000515480 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
GJB2P29033 EGLN3-201ENST00000250457 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
GJB2P29033 PPM1J-202ENST00000464951 2474 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
GJB2P29033 LCA10-201ENST00000618311 1392 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
GJB2P29033 NR4A1-204ENST00000394825 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
GJB2P29033 RNF32-204ENST00000392743 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
GJB2P29033 LGMN-211ENST00000555699 1728 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
GJB2P29033 DLX4-201ENST00000240306 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
GJB2P29033 FAM227B-201ENST00000299338 2008 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
GJB2P29033 PLVAP-201ENST00000252590 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
GJB2P29033 TSC2-207ENST00000439673 5287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
GJB2P29033 FHAD1-205ENST00000375997 1459 ntTSL 3 BASIC18.91■□□□□ 0.62
GJB2P29033 ILF3-210ENST00000588657 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
GJB2P29033 ARL8B-208ENST00000611208 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
GJB2P29033 PABPC4-202ENST00000372857 3048 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
GJB2P29033 TMEM139-205ENST00000410004 2114 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
GJB2P29033 SLC35F2-204ENST00000525815 3170 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
GJB2P29033 TSPY2-201ENST00000320701 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
GJB2P29033 GPRC5C-201ENST00000342648 1273 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
GJB2P29033 WWOX-201ENST00000355860 710 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
GJB2P29033 STK40-202ENST00000373129 3846 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
GJB2P29033 FAM19A5-204ENST00000406880 833 ntTSL 3 BASIC18.91■□□□□ 0.62
GJB2P29033 AC013270.1-201ENST00000425578 440 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
GJB2P29033 TSPY2-203ENST00000429039 779 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
GJB2P29033 BARX1-AS1-202ENST00000454594 307 ntTSL 3 BASIC18.91■□□□□ 0.62
GJB2P29033 TRPC2-202ENST00000526541 1189 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
GJB2P29033 MVB12A-211ENST00000529939 1091 ntTSL 3 BASIC18.91■□□□□ 0.62
GJB2P29033 AL133352.1-203ENST00000557395 1234 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
GJB2P29033 MIR4321-201ENST00000592276 80 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
GJB2P29033 LINC01197-204ENST00000611265 956 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
GJB2P29033 SBK3-202ENST00000612221 1270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
GJB2P29033 CFLAR-214ENST00000443227 1679 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
GJB2P29033 NARF-206ENST00000457415 1668 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
GJB2P29033 DNAJB9-201ENST00000249356 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
GJB2P29033 FAHD2B-202ENST00000414820 1388 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
GJB2P29033 MMADHC-203ENST00000428879 1726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
GJB2P29033 GRAMD4-203ENST00000408031 2834 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
GJB2P29033 PLCB1-201ENST00000338037 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
GJB2P29033 PGBD2-201ENST00000329291 2136 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
GJB2P29033 WASH6P-202ENST00000359512 1437 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
GJB2P29033 L2HGDH-202ENST00000267436 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
GJB2P29033 NEO1-207ENST00000560262 4315 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
GJB2P29033 MLKL-202ENST00000308807 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
GJB2P29033 C5orf24-204ENST00000504727 2923 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
GJB2P29033 ATP6V0E2-212ENST00000611515 2565 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
GJB2P29033 SERPINF2-203ENST00000450523 1462 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
GJB2P29033 MGEA5-203ENST00000370094 3314 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
GJB2P29033 TBC1D9B-202ENST00000356834 5173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
GJB2P29033 TVP23C-210ENST00000584811 2989 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
GJB2P29033 LONP1-213ENST00000590729 2626 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
GJB2P29033 NRSN2-210ENST00000621012 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
GJB2P29033 PABPC4-201ENST00000372856 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
GJB2P29033 KCNC2-207ENST00000548513 3026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
GJB2P29033 PAX3-206ENST00000392070 2258 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
GJB2P29033 F10-202ENST00000375559 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
GJB2P29033 ENDOV-213ENST00000520367 2680 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
GJB2P29033 MC1R-202ENST00000555147 3099 ntAPPRIS P1 BASIC18.9■□□□□ 0.62
GJB2P29033 C2orf54-202ENST00000388934 1911 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
GJB2P29033 PCBP4-201ENST00000322099 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
GJB2P29033 ZBTB7C-201ENST00000535628 4818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
GJB2P29033 SLC39A1-201ENST00000310483 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
GJB2P29033 COG5-203ENST00000393603 5418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29 ms