Protein–RNA interactions for Protein: P28358

HOXD10, Homeobox protein Hox-D10, humanhuman

Predictions only

Length 340 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD10P28358 TEKT4-201ENST00000295201 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
HOXD10P28358 ABCA1-203ENST00000423487 1540 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
HOXD10P28358 ASB13-201ENST00000357700 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
HOXD10P28358 IP6K2-202ENST00000340879 1185 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
HOXD10P28358 TREM2-203ENST00000373122 1012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
HOXD10P28358 TMEM52-203ENST00000378602 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
HOXD10P28358 BLCAP-204ENST00000397135 685 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.05■□□□□ 0.48
HOXD10P28358 U82695.1-202ENST00000428676 700 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
HOXD10P28358 AC078785.1-203ENST00000467342 573 ntTSL 4 BASIC18.05■□□□□ 0.48
HOXD10P28358 AC093904.3-201ENST00000492300 368 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
HOXD10P28358 SCARNA20.5-201ENST00000516991 142 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
HOXD10P28358 LINC02109-201ENST00000565798 869 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
HOXD10P28358 AL160412.1-202ENST00000616819 663 ntTSL 4 BASIC18.05■□□□□ 0.48
HOXD10P28358 MIR6727-201ENST00000620702 65 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
HOXD10P28358 SH3BP4-202ENST00000392011 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
HOXD10P28358 NEK10-202ENST00000341435 2638 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
HOXD10P28358 RAB38-201ENST00000243662 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
HOXD10P28358 KLHDC3-203ENST00000332245 1494 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
HOXD10P28358 C12orf65-202ENST00000366329 1901 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
HOXD10P28358 AC139530.2-201ENST00000571730 1922 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
HOXD10P28358 MINDY2-202ENST00000450403 4820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
HOXD10P28358 TMEM155-201ENST00000337677 2313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
HOXD10P28358 FO681492.1-201ENST00000623662 5321 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
HOXD10P28358 ARL13B-203ENST00000394222 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
HOXD10P28358 CYB5R3-204ENST00000407332 1849 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
HOXD10P28358 NEU1-206ENST00000375631 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
HOXD10P28358 DAGLB-202ENST00000425398 2044 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
HOXD10P28358 ZSCAN30-212ENST00000639929 1305 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
HOXD10P28358 PPP2R1B-203ENST00000393055 1525 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
HOXD10P28358 IKZF4-206ENST00000547791 1712 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
HOXD10P28358 RRN3-205ENST00000563559 2128 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
HOXD10P28358 FAM219B-204ENST00000563119 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
HOXD10P28358 MARCH1-203ENST00000503008 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
HOXD10P28358 LINGO1-204ENST00000561030 2677 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
HOXD10P28358 TRABD-202ENST00000380909 2272 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
HOXD10P28358 ARHGEF5-202ENST00000471847 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
HOXD10P28358 AL691459.1-201ENST00000438589 407 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
HOXD10P28358 AC004898.1-201ENST00000451057 766 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
HOXD10P28358 TMEM14B-204ENST00000461342 559 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
HOXD10P28358 CHIA-209ENST00000483391 1188 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
HOXD10P28358 PFN2-215ENST00000497148 743 ntTSL 4 BASIC18.04■□□□□ 0.48
HOXD10P28358 SLC45A2-204ENST00000509381 1040 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
HOXD10P28358 LCN10-206ENST00000527229 615 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
HOXD10P28358 CATSPERZ-203ENST00000539943 917 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
HOXD10P28358 PRCD-204ENST00000586148 630 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
HOXD10P28358 PRCD-210ENST00000592014 462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
HOXD10P28358 KLK3-211ENST00000597483 810 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
HOXD10P28358 HCG18-245ENST00000602550 559 ntTSL 4 BASIC18.04■□□□□ 0.48
HOXD10P28358 GPS1-226ENST00000623691 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
HOXD10P28358 NFATC4-231ENST00000557451 5613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
HOXD10P28358 PRR30-202ENST00000432962 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
HOXD10P28358 HAPLN3-201ENST00000359595 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
HOXD10P28358 DUSP13-203ENST00000372702 1778 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
HOXD10P28358 MSMO1-202ENST00000393766 1789 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
HOXD10P28358 ARRB2-204ENST00000412477 1779 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
HOXD10P28358 CAP2-208ENST00000611958 2686 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
HOXD10P28358 AC087289.5-201ENST00000586076 3175 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
HOXD10P28358 TPST2-201ENST00000338754 5697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
HOXD10P28358 KAT8-201ENST00000219797 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
HOXD10P28358 ZNF746-202ENST00000458143 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
HOXD10P28358 ZNF668-208ENST00000538906 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
HOXD10P28358 TTC24-202ENST00000368237 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
HOXD10P28358 AC006001.1-201ENST00000325130 474 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
HOXD10P28358 NOSIP-201ENST00000339093 1000 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
HOXD10P28358 RHCE-202ENST00000340849 1087 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
HOXD10P28358 THEG-202ENST00000346878 1211 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
HOXD10P28358 HIST3H3-201ENST00000366696 481 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
HOXD10P28358 UNC5D-204ENST00000420357 2966 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
HOXD10P28358 AL591846.1-201ENST00000451736 433 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
HOXD10P28358 AC245100.5-201ENST00000452108 331 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
HOXD10P28358 SLED1-202ENST00000512051 380 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
HOXD10P28358 AC012645.3-203ENST00000567153 520 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
HOXD10P28358 NAT9-222ENST00000583476 583 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
HOXD10P28358 RDM1-220ENST00000616596 1032 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
HOXD10P28358 RDM1-228ENST00000620284 1177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
HOXD10P28358 CCNA1-204ENST00000630422 1751 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
HOXD10P28358 CCDC92-201ENST00000238156 2787 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
HOXD10P28358 CCDC120-203ENST00000536628 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
HOXD10P28358 CLDND1-215ENST00000507874 1380 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
HOXD10P28358 CHRNA4-201ENST00000370263 5577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
HOXD10P28358 SLCO4A1-201ENST00000217159 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
HOXD10P28358 GBGT1-203ENST00000372040 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
HOXD10P28358 EIF2AK3-201ENST00000303236 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
HOXD10P28358 DAPK1-202ENST00000408954 5892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
HOXD10P28358 PPP1R3E-201ENST00000452015 4773 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
HOXD10P28358 ATOH1-201ENST00000306011 2212 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.48
HOXD10P28358 RNF114-201ENST00000244061 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
HOXD10P28358 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
HOXD10P28358 BST2-201ENST00000252593 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
HOXD10P28358 EMC3-AS1-202ENST00000366264 559 ntTSL 4 BASIC18.02■□□□□ 0.48
HOXD10P28358 APH1A-203ENST00000369109 1713 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
HOXD10P28358 TCEAL1-203ENST00000372626 721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
HOXD10P28358 OR5C1-201ENST00000373680 963 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.48
HOXD10P28358 HSPC324-201ENST00000411904 557 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
HOXD10P28358 IL17RC-206ENST00000416074 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
HOXD10P28358 EPDR1-203ENST00000425345 947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
HOXD10P28358 AC091804.1-201ENST00000486888 567 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
HOXD10P28358 PGBD5-202ENST00000525115 1569 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
HOXD10P28358 NAALADL1-208ENST00000528884 973 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
HOXD10P28358 ARL2-204ENST00000529384 830 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.5 ms