Protein–RNA interactions for Protein: P28340

POLD1, DNA polymerase delta catalytic subunit, humanhuman

Predictions only

Length 1,107 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLD1P28340 GUK1-206ENST00000366723 845 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
POLD1P28340 LINC01121-201ENST00000378479 1095 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
POLD1P28340 MIR769-201ENST00000390225 118 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
POLD1P28340 CD8A-204ENST00000409781 597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
POLD1P28340 AZGP1P1-201ENST00000411909 902 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
POLD1P28340 AC074338.1-201ENST00000416825 156 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
POLD1P28340 AL451065.1-201ENST00000428958 238 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
POLD1P28340 AC008267.1-201ENST00000474858 1069 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
POLD1P28340 AC005920.3-202ENST00000512717 789 ntTSL 3 BASIC19.97■□□□□ 0.79
POLD1P28340 LCN10-206ENST00000527229 615 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
POLD1P28340 ARL2-204ENST00000529384 830 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.97■□□□□ 0.79
POLD1P28340 TMBIM4-205ENST00000535812 766 ntTSL 4 BASIC19.97■□□□□ 0.79
POLD1P28340 AC125603.2-201ENST00000546835 876 ntTSL 3 BASIC19.97■□□□□ 0.79
POLD1P28340 TMBIM4-212ENST00000556010 610 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
POLD1P28340 AC025259.3-202ENST00000564363 687 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
POLD1P28340 AP000894.2-204ENST00000577358 473 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
POLD1P28340 EGLN2-209ENST00000594140 991 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
POLD1P28340 IFI27-206ENST00000612813 725 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC19.97■□□□□ 0.79
POLD1P28340 AL096828.3-201ENST00000615354 462 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
POLD1P28340 AC247036.4-201ENST00000632099 353 ntAPPRIS P1 BASIC19.97■□□□□ 0.79
POLD1P28340 AC233723.1-201ENST00000635921 386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
POLD1P28340 HPS3-202ENST00000460120 2745 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
POLD1P28340 TTLL12-201ENST00000216129 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
POLD1P28340 SLX1B-SULT1A4-201ENST00000344620 2424 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
POLD1P28340 NOMO3-202ENST00000399336 4356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
POLD1P28340 GRN-214ENST00000589265 1632 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
POLD1P28340 RAB38-201ENST00000243662 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
POLD1P28340 SLC26A5-202ENST00000339444 2474 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
POLD1P28340 BEX4-202ENST00000372695 1328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
POLD1P28340 DYRK1B-205ENST00000597639 1806 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
POLD1P28340 PACS2-205ENST00000547217 2809 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
POLD1P28340 DNAJB2-201ENST00000336576 3176 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
POLD1P28340 AL034417.2-201ENST00000445300 2044 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
POLD1P28340 HSFX2-201ENST00000598963 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
POLD1P28340 AL133373.2-201ENST00000623187 2828 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
POLD1P28340 UBE3A-201ENST00000232165 5051 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
POLD1P28340 NRBP1-203ENST00000379852 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
POLD1P28340 STMN1-201ENST00000357865 1137 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
POLD1P28340 TMEM254-204ENST00000372277 366 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
POLD1P28340 TARDBPP1-201ENST00000442013 1203 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
POLD1P28340 LEF1-AS1-204ENST00000508266 559 ntTSL 4 BASIC19.96■□□□□ 0.79
POLD1P28340 RAB26-202ENST00000541451 944 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
POLD1P28340 DMAC2-208ENST00000589970 979 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
POLD1P28340 NKG7-204ENST00000595217 816 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
POLD1P28340 DMAC2-215ENST00000597457 492 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
POLD1P28340 AL451050.2-201ENST00000606967 682 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
POLD1P28340 AL021997.3-201ENST00000621053 557 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.96■□□□□ 0.79
POLD1P28340 AL137026.1-201ENST00000624407 503 ntTSL 4 BASIC19.96■□□□□ 0.79
POLD1P28340 GPR137-212ENST00000539851 1843 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
POLD1P28340 PACS1-209ENST00000529757 1688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
POLD1P28340 HOTAIR-201ENST00000424518 2421 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
POLD1P28340 GOLGA2P2Y-202ENST00000423852 1506 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
POLD1P28340 ADAMTS8-201ENST00000257359 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
POLD1P28340 EIF2B3-210ENST00000620860 1923 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
POLD1P28340 PLA2G12A-201ENST00000243501 5226 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
POLD1P28340 SNN-201ENST00000329565 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
POLD1P28340 MECR-201ENST00000263702 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.79
POLD1P28340 PRSS54-204ENST00000567164 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
POLD1P28340 TMEM25-202ENST00000354064 1965 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
POLD1P28340 RNFT2-209ENST00000622220 2176 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
POLD1P28340 AL138752.2-201ENST00000540557 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
POLD1P28340 AFG3L1P-203ENST00000418696 2965 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
POLD1P28340 SEPHS1-206ENST00000545675 2988 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
POLD1P28340 DPEP3-201ENST00000268793 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
POLD1P28340 ZFP64-205ENST00000371518 1841 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
POLD1P28340 NEURL1B-201ENST00000369800 6424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
POLD1P28340 LETM2-201ENST00000297720 1693 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
POLD1P28340 C19orf48-202ENST00000391812 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
POLD1P28340 CBY1-201ENST00000216029 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
POLD1P28340 MRPL55-201ENST00000295008 632 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
POLD1P28340 KLK11-201ENST00000319720 1198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
POLD1P28340 PRSS55-201ENST00000328655 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
POLD1P28340 ARMC12-203ENST00000373869 1111 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
POLD1P28340 GOSR2-202ENST00000393456 788 ntTSL 3 BASIC19.95■□□□□ 0.78
POLD1P28340 STX1A-202ENST00000395154 1022 ntTSL 3 BASIC19.95■□□□□ 0.78
POLD1P28340 AC004987.2-201ENST00000395959 1148 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
POLD1P28340 DEF8-202ENST00000418391 852 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
POLD1P28340 CFLAR-208ENST00000423241 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
POLD1P28340 C4orf3-202ENST00000504110 667 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
POLD1P28340 MCPH1-AS1-203ENST00000525186 869 ntTSL 3 BASIC19.95■□□□□ 0.78
POLD1P28340 AC067930.5-201ENST00000531730 1173 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
POLD1P28340 RAB30-AS1-207ENST00000533708 825 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
POLD1P28340 RDM1-220ENST00000616596 1032 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
POLD1P28340 RDM1-228ENST00000620284 1177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
POLD1P28340 LINC01668-201ENST00000635001 513 ntTSL 4 BASIC19.95■□□□□ 0.78
POLD1P28340 ZFYVE19-203ENST00000355341 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
POLD1P28340 TTLL3-209ENST00000426895 2767 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
POLD1P28340 UNKL-204ENST00000389221 5116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
POLD1P28340 ADAM10-205ENST00000461408 1932 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
POLD1P28340 KCTD20-210ENST00000536244 5345 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
POLD1P28340 RGS12-203ENST00000344733 5469 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
POLD1P28340 RNF7-201ENST00000273480 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
POLD1P28340 EIF2B4-205ENST00000445933 1608 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
POLD1P28340 RIC8B-213ENST00000638198 1611 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
POLD1P28340 FAM118B-210ENST00000627851 1862 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
POLD1P28340 NPAS3-202ENST00000356141 2802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
POLD1P28340 NIPAL2-202ENST00000430223 4496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
POLD1P28340 MRPS30-202ENST00000507110 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
POLD1P28340 TFEB-206ENST00000403298 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
POLD1P28340 GTPBP2-202ENST00000307126 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33 ms