Protein–RNA interactions for Protein: P26640

VARS, Valine--tRNA ligase, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,264 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VARSP26640 RER1-209ENST00000605895 3044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
VARSP26640 AL669918.1-201ENST00000452392 2705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
VARSP26640 LINC00963-208ENST00000454968 1403 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
VARSP26640 TRIM27-202ENST00000377199 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
VARSP26640 TMC5-202ENST00000381414 4755 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
VARSP26640 NRSN1-203ENST00000378478 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
VARSP26640 ATP5F1-202ENST00000369722 3156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
VARSP26640 ARPC5-201ENST00000294742 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
VARSP26640 AC100830.1-201ENST00000560387 1609 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
VARSP26640 ATP6AP2-225ENST00000637482 1648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
VARSP26640 HNRNPU-205ENST00000444376 6827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
VARSP26640 GSPT2-201ENST00000340438 2802 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
VARSP26640 DAP-201ENST00000230895 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
VARSP26640 MAGEA2-201ENST00000595583 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
VARSP26640 SFN-201ENST00000339276 1320 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
VARSP26640 IL11-201ENST00000264563 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
VARSP26640 MIRLET7BHG-203ENST00000435439 2264 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
VARSP26640 DPM2-201ENST00000314392 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
VARSP26640 RAB31-207ENST00000578921 4055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
VARSP26640 THAP3-202ENST00000307896 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
VARSP26640 ANAPC11-201ENST00000344877 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
VARSP26640 FALEC-201ENST00000416894 566 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
VARSP26640 ACTG1P14-201ENST00000446382 1122 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
VARSP26640 FBXL21-206ENST00000495672 589 ntTSL 4 BASIC16.01■□□□□ 0.15
VARSP26640 LINC02123-201ENST00000514869 885 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
VARSP26640 EEF1D-223ENST00000528610 923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
VARSP26640 AF131215.3-201ENST00000532453 639 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
VARSP26640 NR2C2AP-204ENST00000538165 891 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
VARSP26640 AC130456.4-201ENST00000568635 665 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
VARSP26640 ANAPC11-213ENST00000577747 672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
VARSP26640 IFT20-215ENST00000585313 852 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
VARSP26640 AC011467.4-201ENST00000594891 528 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
VARSP26640 ORC5-208ENST00000626700 344 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
VARSP26640 PLEKHN1-203ENST00000379410 2404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
VARSP26640 AC092384.3-202ENST00000564646 2873 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
VARSP26640 MAPT-201ENST00000262410 6762 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
VARSP26640 ASTN2-201ENST00000288520 2356 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
VARSP26640 AC025165.1-201ENST00000356672 2355 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
VARSP26640 SLC29A2-207ENST00000619145 2380 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
VARSP26640 KCNC2-207ENST00000548513 3026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
VARSP26640 CAAP1-201ENST00000333916 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
VARSP26640 PKN1-202ENST00000342216 2960 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
VARSP26640 EPHA10-203ENST00000427468 3167 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
VARSP26640 TBL3-205ENST00000568546 6803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
VARSP26640 IER2-203ENST00000588173 2934 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
VARSP26640 UNC119B-201ENST00000344651 4404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
VARSP26640 ACE-204ENST00000428043 5120 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
VARSP26640 AGTPBP1-201ENST00000337006 4473 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
VARSP26640 AL596087.1-201ENST00000400979 1969 ntBASIC16■□□□□ 0.15
VARSP26640 DUSP18-206ENST00000407308 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
VARSP26640 AIFM2-202ENST00000373248 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
VARSP26640 MAPKAPK3-203ENST00000446044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
VARSP26640 CORO2B-201ENST00000261861 3569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
VARSP26640 CORO2B-204ENST00000566799 3566 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
VARSP26640 SERHL2-203ENST00000340239 1315 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
VARSP26640 RPS5-202ENST00000596046 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
VARSP26640 GFOD2-201ENST00000268797 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
VARSP26640 LILRP2-201ENST00000413439 2127 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
VARSP26640 AC141586.1-201ENST00000399702 2748 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
VARSP26640 DZIP1-203ENST00000361396 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
VARSP26640 HHATL-205ENST00000441594 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
VARSP26640 CMKLR1-204ENST00000550402 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
VARSP26640 LETM2-201ENST00000297720 1693 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
VARSP26640 ACP5-212ENST00000592828 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
VARSP26640 CLEC1B-201ENST00000298527 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
VARSP26640 CD99L2-202ENST00000355149 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
VARSP26640 GBGT1-201ENST00000372036 871 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
VARSP26640 MRPS18A-202ENST00000372133 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
VARSP26640 ADARB2-201ENST00000381305 703 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
VARSP26640 AL354836.1-201ENST00000414042 681 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
VARSP26640 AL109741.1-201ENST00000432195 403 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
VARSP26640 RGS1-203ENST00000469578 1034 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
VARSP26640 REEP2-206ENST00000506158 1021 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
VARSP26640 IL32-212ENST00000526464 1198 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
VARSP26640 IL32-217ENST00000530538 674 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
VARSP26640 BLOC1S1-201ENST00000547076 837 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
VARSP26640 TMEM220-AS1-206ENST00000583343 876 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
VARSP26640 AC024592.3-202ENST00000586349 506 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
VARSP26640 AC092865.6-201ENST00000642101 219 ntBASIC16■□□□□ 0.15
VARSP26640 CICP4-201ENST00000447359 2812 ntBASIC16■□□□□ 0.15
VARSP26640 MEX3A-202ENST00000532414 6124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
VARSP26640 KRT2-201ENST00000309680 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
VARSP26640 SLC12A5-201ENST00000243964 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
VARSP26640 TMEM139-201ENST00000359333 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
VARSP26640 ZNF131-214ENST00000509634 3340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
VARSP26640 F2RL1-201ENST00000296677 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
VARSP26640 UBAP1-201ENST00000297661 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
VARSP26640 COMMD6-203ENST00000377615 1793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
VARSP26640 RUNX1-201ENST00000300305 6222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
VARSP26640 NAA30-204ENST00000556492 7644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
VARSP26640 PCDHA12-201ENST00000398631 5233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
VARSP26640 KL-201ENST00000380099 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
VARSP26640 HS3ST3B1-201ENST00000360954 5367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
VARSP26640 SYNRG-223ENST00000616179 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
VARSP26640 TIMM44-201ENST00000270538 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
VARSP26640 ARHGEF1-204ENST00000378152 2986 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
VARSP26640 ACTN2-207ENST00000546208 5103 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
VARSP26640 PCGF3-213ENST00000620529 1899 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
VARSP26640 RNF157-202ENST00000319945 2937 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
VARSP26640 ZDHHC4-206ENST00000405731 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.1 ms