Protein–RNA interactions for Protein: P21941

MATN1, Cartilage matrix protein, humanhuman

Predictions only

Length 496 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MATN1P21941 RPS5-202ENST00000596046 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
MATN1P21941 EXOSC4-201ENST00000316052 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
MATN1P21941 CD99-202ENST00000381180 530 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
MATN1P21941 NDUFB2-209ENST00000472695 503 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
MATN1P21941 SUMO2P17-202ENST00000508743 738 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
MATN1P21941 RNA5SP419-201ENST00000515908 135 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
MATN1P21941 MRNIP-205ENST00000518235 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
MATN1P21941 L2HGDH-205ENST00000555423 841 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
MATN1P21941 OVCA2-201ENST00000572195 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
MATN1P21941 AC087645.4-201ENST00000638890 792 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
MATN1P21941 SCP2-201ENST00000371509 1889 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
MATN1P21941 REXO1L8P-201ENST00000604378 1897 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
MATN1P21941 CPT2-201ENST00000371486 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
MATN1P21941 ATP6AP2-225ENST00000637482 1648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
MATN1P21941 FP565260.3-204ENST00000623795 2238 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
MATN1P21941 GULP1-206ENST00000409830 1376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
MATN1P21941 NIM1K-201ENST00000326035 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
MATN1P21941 WDR45-239ENST00000634944 1745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
MATN1P21941 TMED7-TICAM2-202ENST00000333314 3453 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
MATN1P21941 FABP1-202ENST00000393750 1839 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
MATN1P21941 SP100-205ENST00000409824 1802 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
MATN1P21941 USP43-201ENST00000285199 4169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
MATN1P21941 FAM219A-206ENST00000379087 3573 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC15.45■□□□□ 0.06
MATN1P21941 CES4A-207ENST00000540947 2284 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
MATN1P21941 LONP1-213ENST00000590729 2626 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
MATN1P21941 KREMEN1-201ENST00000327813 2719 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
MATN1P21941 C7orf43-207ENST00000457641 2005 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
MATN1P21941 NT5DC3-201ENST00000392876 7207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
MATN1P21941 LDB3-208ENST00000623007 1664 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
MATN1P21941 BANK1-207ENST00000508653 2115 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
MATN1P21941 AL928970.1-201ENST00000422679 2923 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
MATN1P21941 CCDC187-205ENST00000638797 10126 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
MATN1P21941 CCNY-202ENST00000339497 4630 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
MATN1P21941 COL26A1-201ENST00000313669 3033 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
MATN1P21941 SLC4A2-214ENST00000485713 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
MATN1P21941 DAB2IP-201ENST00000259371 5469 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
MATN1P21941 ARHGEF28-201ENST00000296794 5246 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
MATN1P21941 DAAM2-211ENST00000633794 3871 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
MATN1P21941 PCYOX1-201ENST00000264441 2959 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
MATN1P21941 ARPC5-201ENST00000294742 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
MATN1P21941 EIF2B4-206ENST00000451130 1633 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
MATN1P21941 FXN-201ENST00000377270 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
MATN1P21941 LINC00917-207ENST00000601556 2618 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
MATN1P21941 CPEB2-201ENST00000259997 5612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
MATN1P21941 FLAD1-203ENST00000315144 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
MATN1P21941 NOTO-201ENST00000398468 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
MATN1P21941 EPOP-201ENST00000621654 3719 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
MATN1P21941 GALNT16-202ENST00000448469 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
MATN1P21941 RNU1-129P-201ENST00000384064 167 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
MATN1P21941 ICAM2-202ENST00000418105 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
MATN1P21941 TPM4P1-201ENST00000436100 807 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
MATN1P21941 TSPAN32-207ENST00000451520 1236 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
MATN1P21941 IGHV3-22-201ENST00000520721 359 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
MATN1P21941 CYB561D1-208ENST00000528785 1271 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
MATN1P21941 ICAM2-208ENST00000579788 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
MATN1P21941 U1.21-201ENST00000580816 167 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
MATN1P21941 SLC25A6P4-201ENST00000586535 553 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
MATN1P21941 HEXIM2-207ENST00000592695 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
MATN1P21941 AL031055.1-201ENST00000606362 631 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
MATN1P21941 AC021097.1-201ENST00000607902 574 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
MATN1P21941 PSMA6-216ENST00000627895 484 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
MATN1P21941 COL17A1-202ENST00000369733 5488 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
MATN1P21941 JAKMIP1-204ENST00000409831 2371 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
MATN1P21941 F2RL1-201ENST00000296677 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
MATN1P21941 VGLL4-211ENST00000430365 1377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
MATN1P21941 SHISA5-209ENST00000443308 1933 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
MATN1P21941 NAA50-209ENST00000497525 1385 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
MATN1P21941 ANKRD33B-201ENST00000296657 9188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
MATN1P21941 SLC22A23-210ENST00000490273 2043 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
MATN1P21941 ATG13-216ENST00000530500 2030 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
MATN1P21941 CHMP5-201ENST00000223500 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
MATN1P21941 CICP13-201ENST00000422015 2789 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
MATN1P21941 CD8A-201ENST00000283635 2873 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
MATN1P21941 PHF23-202ENST00000454255 1662 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
MATN1P21941 TRIM46-211ENST00000611379 3082 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
MATN1P21941 WDR81-202ENST00000409644 6733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
MATN1P21941 ADRA1A-202ENST00000354550 1765 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
MATN1P21941 KAT7-213ENST00000510819 1769 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
MATN1P21941 RAP1GDS1-203ENST00000380158 2085 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
MATN1P21941 FAM131A-207ENST00000450976 1335 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
MATN1P21941 ARHGAP45-212ENST00000590577 3218 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
MATN1P21941 TMEM184A-201ENST00000297477 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
MATN1P21941 JMJD1C-202ENST00000399262 8666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
MATN1P21941 LATS1-202ENST00000392273 2567 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
MATN1P21941 TLE3-202ENST00000440567 2657 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
MATN1P21941 EXOG-201ENST00000287675 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
MATN1P21941 BX276092.9-202ENST00000636096 1722 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
MATN1P21941 KRT85-201ENST00000257901 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
MATN1P21941 DMPK-202ENST00000343373 3227 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
MATN1P21941 PITPNC1-203ENST00000580974 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
MATN1P21941 GBGT1-201ENST00000372036 871 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
MATN1P21941 PMS2P4-201ENST00000412466 1052 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
MATN1P21941 HCG4B-203ENST00000450128 991 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
MATN1P21941 TMEM135-209ENST00000532959 1149 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
MATN1P21941 CD63-210ENST00000550776 870 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
MATN1P21941 AC005625.1-201ENST00000590304 472 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
MATN1P21941 SPSB2-203ENST00000519357 1496 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
MATN1P21941 ALDOA-226ENST00000569798 1499 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
MATN1P21941 HMOX2-204ENST00000414777 1752 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
MATN1P21941 DDOST-206ENST00000602624 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46 ms