Protein–RNA interactions for Protein: P18206

VCL, Vinculin, humanhuman

Predictions only

Length 1,134 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VCLP18206 AIFM2-201ENST00000307864 3243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
VCLP18206 PAX3-207ENST00000409551 1782 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
VCLP18206 TPD52L2-201ENST00000217121 2362 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
VCLP18206 MBD1-202ENST00000269471 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
VCLP18206 DNAJB9-201ENST00000249356 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
VCLP18206 GFOD2-201ENST00000268797 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
VCLP18206 EIF4G1-204ENST00000352767 5484 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
VCLP18206 CD1E-213ENST00000444681 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
VCLP18206 SMIM10-201ENST00000330288 1536 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
VCLP18206 WDTC1-202ENST00000361771 4275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
VCLP18206 JRK-209ENST00000612905 9124 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
VCLP18206 RBCK1-201ENST00000353660 2511 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
VCLP18206 RPS27A-201ENST00000272317 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
VCLP18206 CRYBA2-201ENST00000295728 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
VCLP18206 RPS17-201ENST00000330244 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
VCLP18206 TNNC2-202ENST00000372557 780 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
VCLP18206 RPS8P6-201ENST00000426177 609 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
VCLP18206 LINC01413-201ENST00000564843 772 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
VCLP18206 PRELID3A-208ENST00000590956 777 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
VCLP18206 GPR42-202ENST00000597214 1182 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
VCLP18206 AC099522.2-201ENST00000607001 744 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
VCLP18206 AGTPBP1-201ENST00000337006 4473 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
VCLP18206 PHLDB1-202ENST00000361417 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
VCLP18206 FGFR1OP2-201ENST00000229395 2924 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
VCLP18206 SEPT8-204ENST00000378699 2289 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
VCLP18206 NEDD4-202ENST00000435532 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
VCLP18206 DNASE2-201ENST00000222219 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
VCLP18206 TMEM25-202ENST00000354064 1965 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
VCLP18206 IMPA1-201ENST00000256108 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
VCLP18206 ENOSF1-202ENST00000340116 1658 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
VCLP18206 SLC9A5-201ENST00000299798 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
VCLP18206 CLU-215ENST00000523500 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
VCLP18206 GRM5-205ENST00000455756 7927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
VCLP18206 AL512652.2-201ENST00000625156 1716 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
VCLP18206 SLIT3-201ENST00000332966 4895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
VCLP18206 HDAC5-201ENST00000225983 5326 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
VCLP18206 AC010619.2-201ENST00000595815 1421 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
VCLP18206 TNFRSF13C-201ENST00000291232 3944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
VCLP18206 APOPT1-201ENST00000409074 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
VCLP18206 CYP46A1-201ENST00000261835 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
VCLP18206 IQCE-210ENST00000438376 2170 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
VCLP18206 DYRK1B-205ENST00000597639 1806 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
VCLP18206 TLE3-215ENST00000559048 2918 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
VCLP18206 RB1CC1-202ENST00000435644 6614 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
VCLP18206 HSD3B7-201ENST00000262520 2200 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
VCLP18206 TMEM19-201ENST00000266673 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
VCLP18206 F10-202ENST00000375559 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
VCLP18206 PEA15-202ENST00000368076 2694 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
VCLP18206 NAF1-201ENST00000274054 1907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
VCLP18206 NDUFV1-201ENST00000322776 1596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
VCLP18206 CCDC40-201ENST00000269318 1970 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
VCLP18206 KLHL42-201ENST00000381271 6703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
VCLP18206 GRAMD2B-201ENST00000285689 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
VCLP18206 DMTN-206ENST00000443491 2415 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
VCLP18206 GGT6-204ENST00000574154 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
VCLP18206 TIMM44-201ENST00000270538 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
VCLP18206 ARMC12-201ENST00000288065 1169 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
VCLP18206 TMEM205-201ENST00000354882 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
VCLP18206 GBGT1-201ENST00000372036 871 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
VCLP18206 ALKBH6-202ENST00000378875 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
VCLP18206 SUMO1-201ENST00000392244 831 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
VCLP18206 SUMO1-209ENST00000409712 761 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
VCLP18206 TFAMP1-201ENST00000412727 736 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
VCLP18206 TIMM8BP1-201ENST00000452384 211 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
VCLP18206 KRT18P34-201ENST00000488218 1270 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
VCLP18206 NDUFS7-216ENST00000546283 1060 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
VCLP18206 TMEM205-205ENST00000586590 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
VCLP18206 TMEM205-207ENST00000586956 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
VCLP18206 AP002449.1-201ENST00000588211 474 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
VCLP18206 EPS8-201ENST00000281172 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
VCLP18206 TBC1D22A-205ENST00000406733 2267 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
VCLP18206 PYCR1-201ENST00000329875 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
VCLP18206 RPS19-206ENST00000598742 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
VCLP18206 MAGEA2-207ENST00000620710 1947 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
VCLP18206 SYT1-201ENST00000261205 4808 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
VCLP18206 ME2P1-201ENST00000426028 1970 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
VCLP18206 CEP104-202ENST00000378230 6424 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
VCLP18206 WLS-202ENST00000354777 2037 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
VCLP18206 HLA-B-249ENST00000412585 1547 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
VCLP18206 PCDHGB2-202ENST00000622527 2588 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
VCLP18206 NECAP2-201ENST00000337132 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
VCLP18206 CNPPD1-202ENST00000409789 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
VCLP18206 NCOA1-205ENST00000406961 7289 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
VCLP18206 ZNF644-201ENST00000337393 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
VCLP18206 FUT2-201ENST00000391876 1593 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
VCLP18206 SLC9A7P1-201ENST00000554295 3311 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
VCLP18206 ZFAND5-205ENST00000376962 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
VCLP18206 GGT3P-204ENST00000453783 1664 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
VCLP18206 ACP5-212ENST00000592828 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
VCLP18206 PPP1R16B-201ENST00000299824 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
VCLP18206 GALNT9-202ENST00000397325 1727 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
VCLP18206 CHRD-201ENST00000204604 3521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
VCLP18206 JRK-210ENST00000614134 8932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
VCLP18206 EVPL-201ENST00000301607 6614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
VCLP18206 SHISA9-203ENST00000558583 6724 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
VCLP18206 POM121C-206ENST00000607367 3690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
VCLP18206 ZNF134-201ENST00000396161 4914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
VCLP18206 ZBTB10-203ENST00000430430 10132 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
VCLP18206 PDLIM7-201ENST00000355572 977 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
VCLP18206 TEX30-206ENST00000376032 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.2 ms