Protein–RNA interactions for Protein: P02748

C9, Complement component C9, humanhuman

Predictions only

Length 559 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9P02748 FTSJ1-202ENST00000348411 1892 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
C9P02748 SURF4-209ENST00000618229 3200 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
C9P02748 NGFR-201ENST00000172229 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
C9P02748 PSMC3-201ENST00000298852 1544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
C9P02748 SIRT6-201ENST00000305232 1506 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
C9P02748 STC2-201ENST00000265087 5353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
C9P02748 HS3ST3B1-201ENST00000360954 5367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
C9P02748 KLHL42-201ENST00000381271 6703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
C9P02748 CCDC90B-203ENST00000525503 1919 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
C9P02748 AC007950.2-201ENST00000615045 2347 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
C9P02748 PRRT4-201ENST00000446477 3544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
C9P02748 ZFAND6-211ENST00000559157 1559 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
C9P02748 DUOXA2-201ENST00000323030 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
C9P02748 RBM4-204ENST00000408993 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
C9P02748 CLMAT3-201ENST00000510576 1973 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
C9P02748 SARAF-201ENST00000256255 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
C9P02748 REPS1-201ENST00000258062 3161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
C9P02748 SYTL2-215ENST00000527523 3049 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
C9P02748 TLE2-202ENST00000426948 2406 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
C9P02748 TTYH2-206ENST00000529107 2015 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
C9P02748 PSMC3IP-202ENST00000393795 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
C9P02748 SCAF1-201ENST00000360565 4306 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
C9P02748 WDR81-204ENST00000419248 3315 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
C9P02748 C10orf107-201ENST00000330194 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
C9P02748 PDAP1-201ENST00000350498 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
C9P02748 DYNLL1-201ENST00000242577 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
C9P02748 POP7-201ENST00000303151 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
C9P02748 DPM2-202ENST00000373110 738 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
C9P02748 C6orf52-202ENST00000379586 430 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
C9P02748 BASP1P1-201ENST00000430708 665 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
C9P02748 NDUFA4L2-202ENST00000554503 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
C9P02748 QPRT-203ENST00000562473 579 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
C9P02748 AC004771.3-201ENST00000574260 551 ntTSL 4 BASIC15.87■□□□□ 0.13
C9P02748 AC006116.8-201ENST00000587004 987 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
C9P02748 ZNF667-AS1-204ENST00000588158 921 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
C9P02748 AC018529.1-201ENST00000613063 361 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
C9P02748 DENND1A-202ENST00000373620 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
C9P02748 TMUB2-212ENST00000589785 1918 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
C9P02748 WDR45B-201ENST00000392325 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
C9P02748 CCDC187-205ENST00000638797 10126 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
C9P02748 PON2-201ENST00000222572 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
C9P02748 CDK2-204ENST00000553376 1725 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
C9P02748 KLC1-206ENST00000389744 3250 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
C9P02748 SLC44A1-203ENST00000374724 3088 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
C9P02748 TMC4-209ENST00000617472 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
C9P02748 HDAC11-214ENST00000446613 2875 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
C9P02748 LRRC59-201ENST00000225972 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
C9P02748 SLC9A7-201ENST00000328306 3838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
C9P02748 NPY4R-202ENST00000612632 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
C9P02748 NPY4R2-202ENST00000613306 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
C9P02748 EGLN1-201ENST00000366641 7097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
C9P02748 AASDHPPT-201ENST00000278618 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
C9P02748 ZNF672-201ENST00000306562 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
C9P02748 FO538757.1-201ENST00000623083 1397 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
C9P02748 NEO1-206ENST00000558964 4441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
C9P02748 SGO1-203ENST00000412997 2587 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
C9P02748 TPM1-219ENST00000559397 1655 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
C9P02748 CPSF6-203ENST00000456847 1915 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
C9P02748 IQSEC3-203ENST00000538872 7094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
C9P02748 FGD4-212ENST00000534526 2977 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
C9P02748 GLS2-217ENST00000623608 2518 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
C9P02748 DLGAP1-220ENST00000581699 2258 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
C9P02748 SIGLEC7-202ENST00000317643 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
C9P02748 FBLIM1-201ENST00000332305 1530 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
C9P02748 CABP5-201ENST00000293255 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
C9P02748 AURKAIP1-201ENST00000321751 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
C9P02748 PPP1R27-201ENST00000330261 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
C9P02748 CYTH4-203ENST00000405206 636 ntTSL 4 BASIC15.86■□□□□ 0.13
C9P02748 TREML5P-201ENST00000421694 576 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
C9P02748 AC069120.2-201ENST00000524091 540 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
C9P02748 AC018653.3-201ENST00000544657 749 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
C9P02748 AC090607.3-202ENST00000558971 383 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
C9P02748 HCFC1R1-203ENST00000572355 610 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
C9P02748 MIR4453-201ENST00000584019 89 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
C9P02748 AC011476.2-201ENST00000585492 1271 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
C9P02748 PGR-209ENST00000617858 2816 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
C9P02748 NUTM2F-201ENST00000253262 2561 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
C9P02748 SEPT8-205ENST00000378701 1817 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
C9P02748 FAM49B-202ENST00000517654 1817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
C9P02748 SLC43A3-203ENST00000395124 2617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
C9P02748 KLC4-202ENST00000347162 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
C9P02748 PNKD-202ENST00000258362 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
C9P02748 TVP23B-202ENST00000476139 2989 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
C9P02748 PLXNC1-201ENST00000258526 7346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
C9P02748 CYP11A1-201ENST00000268053 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
C9P02748 WT1-203ENST00000379079 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
C9P02748 GLUL-201ENST00000311223 4719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
C9P02748 FUK-207ENST00000571514 3054 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
C9P02748 UBQLN1-201ENST00000257468 2299 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
C9P02748 AP001189.5-201ENST00000637683 1413 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
C9P02748 BX088651.4-201ENST00000435586 2579 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
C9P02748 ELN-221ENST00000445912 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
C9P02748 SYBU-209ENST00000446070 2919 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
C9P02748 TRIM39-205ENST00000396551 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
C9P02748 FHL2-201ENST00000322142 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
C9P02748 DIDO1-201ENST00000266070 8574 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
C9P02748 TVP23C-201ENST00000225576 1527 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
C9P02748 NFYC-210ENST00000425457 1536 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
C9P02748 DDX42-208ENST00000578681 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
C9P02748 CDKN2B-AS1-208ENST00000580576 2175 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46 ms