Protein–RNA interactions for Protein: O75323

NIPSNAP2, Protein NipSnap homolog 2, humanhuman

Predictions only

Length 286 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NIPSNAP2O75323 ADAMTS13-206ENST00000371929 4934 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
NIPSNAP2O75323 SLC46A2-201ENST00000374228 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
NIPSNAP2O75323 TLE2-203ENST00000443826 2238 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
NIPSNAP2O75323 SALL4-203ENST00000395997 1918 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
NIPSNAP2O75323 FAM184B-201ENST00000265018 6622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
NIPSNAP2O75323 TMPO-AS1-202ENST00000548760 3357 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
NIPSNAP2O75323 SLC2A13-202ENST00000380858 3082 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
NIPSNAP2O75323 AADAT-208ENST00000515480 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
NIPSNAP2O75323 BFSP2-201ENST00000302334 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
NIPSNAP2O75323 KHK-202ENST00000260599 2411 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
NIPSNAP2O75323 NMRK2-201ENST00000168977 1126 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
NIPSNAP2O75323 CCNL1-201ENST00000295925 549 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
NIPSNAP2O75323 AC062015.1-201ENST00000423838 1134 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
NIPSNAP2O75323 GPX1P2-201ENST00000429271 606 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
NIPSNAP2O75323 AC005281.1-201ENST00000433040 911 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
NIPSNAP2O75323 MEIS1-AS2-201ENST00000439433 690 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
NIPSNAP2O75323 AC018730.1-201ENST00000454183 327 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
NIPSNAP2O75323 SLC50A1-209ENST00000484157 886 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
NIPSNAP2O75323 AC069335.1-201ENST00000489972 472 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
NIPSNAP2O75323 RPS3A-212ENST00000514682 985 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
NIPSNAP2O75323 IGHV3-62-201ENST00000520057 340 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
NIPSNAP2O75323 GMDS-AS1-205ENST00000529893 900 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
NIPSNAP2O75323 ASXL1-206ENST00000542461 1068 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
NIPSNAP2O75323 AC090515.4-201ENST00000558042 450 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
NIPSNAP2O75323 MIR4469-201ENST00000583919 79 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
NIPSNAP2O75323 LINC01842-201ENST00000588275 768 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
NIPSNAP2O75323 AC010503.2-201ENST00000599292 296 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
NIPSNAP2O75323 NMRK2-205ENST00000616156 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
NIPSNAP2O75323 MCCC2-209ENST00000629193 1128 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
NIPSNAP2O75323 TMEM222-210ENST00000608611 1511 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
NIPSNAP2O75323 REPIN1-202ENST00000425389 2876 ntAPPRIS P3 BASIC16.02■□□□□ 0.15
NIPSNAP2O75323 L2HGDH-202ENST00000267436 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
NIPSNAP2O75323 NLE1-202ENST00000442241 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
NIPSNAP2O75323 TSPAN5-201ENST00000305798 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
NIPSNAP2O75323 POC1B-202ENST00000393179 3096 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
NIPSNAP2O75323 AC131160.1-201ENST00000639401 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
NIPSNAP2O75323 SCARB1-202ENST00000339570 3329 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
NIPSNAP2O75323 FP565260.3-204ENST00000623795 2238 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
NIPSNAP2O75323 PAPLN-202ENST00000340738 5834 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
NIPSNAP2O75323 GMPPB-201ENST00000308375 3217 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
NIPSNAP2O75323 ADGRA1-AS1-201ENST00000366099 3236 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
NIPSNAP2O75323 HS6ST2-201ENST00000370833 1938 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
NIPSNAP2O75323 MPL-201ENST00000372470 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
NIPSNAP2O75323 MPPED1-202ENST00000417669 3657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
NIPSNAP2O75323 SMIM13-202ENST00000416247 4688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
NIPSNAP2O75323 KDM6A-212ENST00000543216 5655 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
NIPSNAP2O75323 H2BFM-201ENST00000355016 1882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
NIPSNAP2O75323 NIPA2-204ENST00000398014 3130 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
NIPSNAP2O75323 LSS-205ENST00000457828 4390 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
NIPSNAP2O75323 ZNF398-203ENST00000483892 2121 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
NIPSNAP2O75323 MPP2-208ENST00000520305 2111 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
NIPSNAP2O75323 MYEF2-215ENST00000610570 2591 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
NIPSNAP2O75323 AC046158.3-201ENST00000624947 2558 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
NIPSNAP2O75323 ANKFY1-202ENST00000570535 6458 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
NIPSNAP2O75323 PIEZO1-201ENST00000301015 8072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
NIPSNAP2O75323 GLS2-217ENST00000623608 2518 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
NIPSNAP2O75323 XPO5-201ENST00000265351 5364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
NIPSNAP2O75323 FAM227B-201ENST00000299338 2008 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
NIPSNAP2O75323 ATG13-216ENST00000530500 2030 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
NIPSNAP2O75323 SALL3-206ENST00000616649 2958 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
NIPSNAP2O75323 GPX3-210ENST00000622181 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
NIPSNAP2O75323 SMAD3-201ENST00000327367 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
NIPSNAP2O75323 UXT-AS1-201ENST00000590504 1525 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
NIPSNAP2O75323 KCNC2-209ENST00000550433 2931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
NIPSNAP2O75323 PKP4-AS1-203ENST00000629904 1951 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
NIPSNAP2O75323 PFN4-201ENST00000313213 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
NIPSNAP2O75323 CD37-201ENST00000323906 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
NIPSNAP2O75323 MIR346-201ENST00000362234 95 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
NIPSNAP2O75323 PP14571-201ENST00000404327 934 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
NIPSNAP2O75323 APCDD1L-AS1-201ENST00000420279 555 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
NIPSNAP2O75323 AL592309.1-201ENST00000443127 649 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
NIPSNAP2O75323 TWIST2-201ENST00000448943 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
NIPSNAP2O75323 AC245100.5-201ENST00000452108 331 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
NIPSNAP2O75323 MRPL20-203ENST00000482352 1049 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
NIPSNAP2O75323 AGGF1-204ENST00000506806 1142 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
NIPSNAP2O75323 AP001107.2-202ENST00000528650 480 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
NIPSNAP2O75323 SLC25A3P1-206ENST00000569142 925 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
NIPSNAP2O75323 GNAO1-210ENST00000569295 930 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
NIPSNAP2O75323 AC104971.3-201ENST00000589794 335 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
NIPSNAP2O75323 SSH2-211ENST00000590153 570 ntTSL 4 BASIC16.01■□□□□ 0.15
NIPSNAP2O75323 AC007193.2-201ENST00000596807 472 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
NIPSNAP2O75323 AC022145.2-201ENST00000598203 171 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
NIPSNAP2O75323 AC010624.2-201ENST00000600998 575 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
NIPSNAP2O75323 TEX264-216ENST00000614067 1174 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
NIPSNAP2O75323 SRPK3-201ENST00000370100 1717 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
NIPSNAP2O75323 OCLN-202ENST00000396442 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
NIPSNAP2O75323 TUBGCP2-204ENST00000417178 4029 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
NIPSNAP2O75323 APBB1-202ENST00000311051 2619 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
NIPSNAP2O75323 SLC39A1-203ENST00000368621 2398 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
NIPSNAP2O75323 RGS20-201ENST00000276500 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
NIPSNAP2O75323 KL-201ENST00000380099 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
NIPSNAP2O75323 CFLAR-214ENST00000443227 1679 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
NIPSNAP2O75323 AC006063.2-201ENST00000640161 1696 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
NIPSNAP2O75323 CADPS2-204ENST00000412584 4308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
NIPSNAP2O75323 PSMD9-201ENST00000261817 2307 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
NIPSNAP2O75323 ROR2-202ENST00000375715 2993 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
NIPSNAP2O75323 MCF2L2-208ENST00000473233 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
NIPSNAP2O75323 ARFGAP1-210ENST00000519273 3176 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
NIPSNAP2O75323 BECN1-213ENST00000590099 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
NIPSNAP2O75323 KCND3-202ENST00000315987 2716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 73.7 ms