Protein–RNA interactions for Protein: O60260

PRKN, E3 ubiquitin-protein ligase parkin, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 465 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRKNO60260 BAD-202ENST00000394531 631 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
PRKNO60260 MIR943-201ENST00000401286 94 ntBASIC15.08■□□□□ 0
PRKNO60260 AC107890.1-201ENST00000422478 521 ntBASIC15.08■□□□□ 0
PRKNO60260 CDH23-AS1-201ENST00000428918 378 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
PRKNO60260 ST7-OT4-203ENST00000466018 894 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
PRKNO60260 TATDN3-212ENST00000530441 492 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
PRKNO60260 BAD-207ENST00000544785 525 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
PRKNO60260 RAB3D-202ENST00000589655 924 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
PRKNO60260 AC007967.4-201ENST00000614700 386 ntBASIC15.08■□□□□ 0
PRKNO60260 GAK-222ENST00000618573 1248 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PRKNO60260 HAUS2-211ENST00000639412 375 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
PRKNO60260 MINK1-202ENST00000355280 4961 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PRKNO60260 APH1A-203ENST00000369109 1713 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PRKNO60260 TOR4A-201ENST00000357503 4148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
PRKNO60260 AZI2-205ENST00000420543 1366 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
PRKNO60260 AADAT-208ENST00000515480 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PRKNO60260 TRIM27-202ENST00000377199 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PRKNO60260 C14orf93-202ENST00000341470 2221 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PRKNO60260 AMHR2-202ENST00000379791 1437 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PRKNO60260 ARHGEF40-201ENST00000298694 5919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
PRKNO60260 MRPS21-201ENST00000581066 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PRKNO60260 DGAT2-202ENST00000376262 2324 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PRKNO60260 DLG4-202ENST00000399506 3185 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
PRKNO60260 PLK2-215ENST00000617412 2792 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
PRKNO60260 MAGEA2B-201ENST00000331220 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
PRKNO60260 AL592424.1-201ENST00000563624 1536 ntBASIC15.07■□□□□ 0
PRKNO60260 LCMT2-202ENST00000567039 1545 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
PRKNO60260 WAPL-202ENST00000298767 6333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PRKNO60260 HSFX1-201ENST00000370416 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PRKNO60260 SEMA4C-201ENST00000305476 3545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PRKNO60260 TSC2-204ENST00000401874 5421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PRKNO60260 U73166.1-201ENST00000439898 2625 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PRKNO60260 BBS2-218ENST00000568104 2623 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
PRKNO60260 BX276092.9-202ENST00000636096 1722 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
PRKNO60260 SCP2-204ENST00000407246 2239 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
PRKNO60260 PCDHA1-201ENST00000378133 2726 ntBASIC15.07■□□□□ 0
PRKNO60260 CLPP-201ENST00000245816 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PRKNO60260 ERAS-201ENST00000338270 1266 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
PRKNO60260 MIR770-201ENST00000390219 98 ntBASIC15.07■□□□□ 0
PRKNO60260 RAB17-204ENST00000409822 1077 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
PRKNO60260 FOLR3-201ENST00000442948 805 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
PRKNO60260 PXN-AS1-201ENST00000535200 1170 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
PRKNO60260 PPP1R14B-203ENST00000542235 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PRKNO60260 MAX-210ENST00000555419 765 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
PRKNO60260 AC140878.1-201ENST00000565277 250 ntBASIC15.07■□□□□ 0
PRKNO60260 CLN3-246ENST00000636228 1224 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PRKNO60260 BRF1-203ENST00000379937 3314 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PRKNO60260 GIT2-202ENST00000354574 5387 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
PRKNO60260 CHID1-201ENST00000323578 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PRKNO60260 GTF2H2C-201ENST00000380729 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PRKNO60260 RCOR3-204ENST00000452621 1827 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
PRKNO60260 SHQ1-201ENST00000325599 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PRKNO60260 C8orf76-201ENST00000276704 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PRKNO60260 DHRS4L2-205ENST00000543805 1334 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
PRKNO60260 TEAD3-204ENST00000639578 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PRKNO60260 FAM46A-201ENST00000320172 5609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PRKNO60260 MPL-202ENST00000413998 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PRKNO60260 PSEN2-203ENST00000422240 1947 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
PRKNO60260 ZFP90-203ENST00000563169 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PRKNO60260 LATS1-202ENST00000392273 2567 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PRKNO60260 COQ8B-201ENST00000243583 2041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PRKNO60260 DNAJC7-201ENST00000316603 1468 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PRKNO60260 SIGLEC10-205ENST00000439889 2126 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PRKNO60260 STK17A-201ENST00000319357 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PRKNO60260 TUBGCP2-204ENST00000417178 4029 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
PRKNO60260 FAM83G-201ENST00000345041 2929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
PRKNO60260 CD14-202ENST00000401743 1648 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
PRKNO60260 CCDC181-206ENST00000491570 1652 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
PRKNO60260 AC025165.1-201ENST00000356672 2355 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
PRKNO60260 CXorf38-202ENST00000378421 2380 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
PRKNO60260 MAST3-201ENST00000262811 5896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PRKNO60260 KLC4-202ENST00000347162 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PRKNO60260 IL12RB2-205ENST00000541374 3849 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PRKNO60260 TM9SF1-201ENST00000261789 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PRKNO60260 DUSP13-210ENST00000491677 1770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PRKNO60260 PCDHA13-202ENST00000409494 4884 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PRKNO60260 TRPC3-202ENST00000379645 3548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PRKNO60260 SCAF1-201ENST00000360565 4306 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
PRKNO60260 AC100861.1-202ENST00000500853 1970 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
PRKNO60260 ARFGAP1-201ENST00000353546 2776 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PRKNO60260 DLX4-201ENST00000240306 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PRKNO60260 ADAMTSL4-204ENST00000369041 2908 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
PRKNO60260 GPHB5-201ENST00000314140 393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PRKNO60260 C6orf99-202ENST00000367073 769 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
PRKNO60260 TNNC2-201ENST00000372555 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PRKNO60260 CENPM-205ENST00000404067 905 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
PRKNO60260 AC062015.1-201ENST00000423838 1134 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PRKNO60260 AC092580.3-201ENST00000430932 139 ntBASIC15.06■□□□□ 0
PRKNO60260 LINC01983-203ENST00000444346 519 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
PRKNO60260 HEXIM2-206ENST00000591576 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PRKNO60260 COQ4-205ENST00000609948 956 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
PRKNO60260 AL355974.2-201ENST00000614099 556 ntTSL 4 BASIC15.06■□□□□ 0
PRKNO60260 AL355974.2-202ENST00000617298 936 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
PRKNO60260 DBI-212ENST00000627305 620 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PRKNO60260 PXK-204ENST00000383716 3035 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PRKNO60260 NTRK2-207ENST00000376214 5608 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
PRKNO60260 FUK-207ENST00000571514 3054 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
PRKNO60260 P4HA2-201ENST00000166534 2230 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PRKNO60260 SHISA5-208ENST00000442747 2250 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
PRKNO60260 SUFU-202ENST00000369902 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.2 ms