Protein–RNA interactions for Protein: O43927

CXCL13, C-X-C motif chemokine 13, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CXCL13O43927 IQCC-202ENST00000537469 2252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
CXCL13O43927 PRSS16-201ENST00000230582 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
CXCL13O43927 MYO3A-206ENST00000543632 2203 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
CXCL13O43927 GIGYF1-201ENST00000275732 6530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
CXCL13O43927 PRKCSH-217ENST00000592741 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
CXCL13O43927 C1QTNF1-208ENST00000580474 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
CXCL13O43927 PCNX2-201ENST00000258229 7518 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
CXCL13O43927 RBPJL-201ENST00000343694 2489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
CXCL13O43927 SLK-201ENST00000335753 7673 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
CXCL13O43927 TRIM39-205ENST00000396551 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
CXCL13O43927 HNRNPLL-202ENST00000358367 2779 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
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CXCL13O43927 FHL1-207ENST00000394155 2706 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
CXCL13O43927 RAB40B-206ENST00000571995 3859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
CXCL13O43927 N4BP1-201ENST00000262384 7106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
CXCL13O43927 GPR152-201ENST00000312457 1429 ntAPPRIS P1 BASIC14.5□□□□□ -0.09
CXCL13O43927 PTPN11-201ENST00000351677 6101 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
CXCL13O43927 EPHA8-201ENST00000166244 4943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
CXCL13O43927 FO538757.1-201ENST00000623083 1397 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
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CXCL13O43927 HNF1A-216ENST00000617366 2473 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
CXCL13O43927 GLYCTK-207ENST00000477382 1304 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
CXCL13O43927 TVP23B-201ENST00000307767 2064 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
CXCL13O43927 LINC00200-201ENST00000425630 2434 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
CXCL13O43927 KCNC1-202ENST00000379472 7965 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
CXCL13O43927 TACC3-201ENST00000313288 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
CXCL13O43927 LLGL2-201ENST00000167462 3480 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
CXCL13O43927 FKBP2-201ENST00000309366 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
CXCL13O43927 HSD17B10-203ENST00000375304 916 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
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CXCL13O43927 AC007388.1-210ENST00000415640 458 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
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CXCL13O43927 TRIM11-201ENST00000284551 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
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CXCL13O43927 AC068831.1-204ENST00000501381 1621 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
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CXCL13O43927 MAP7-203ENST00000438100 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
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CXCL13O43927 CD1E-212ENST00000368167 1458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
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CXCL13O43927 RNLS-201ENST00000331772 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
CXCL13O43927 KREMEN1-203ENST00000407188 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
CXCL13O43927 EGLN1-201ENST00000366641 7097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
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CXCL13O43927 SIRT6-202ENST00000337491 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
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CXCL13O43927 WNT10B-203ENST00000407467 1802 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
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CXCL13O43927 HPN-201ENST00000262626 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
CXCL13O43927 SLC27A5-201ENST00000263093 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
CXCL13O43927 ITSN1-209ENST00000399352 5408 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
CXCL13O43927 SUSD4-202ENST00000343846 3480 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
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CXCL13O43927 MANBAL-205ENST00000397152 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
CXCL13O43927 AC006449.5-201ENST00000610658 2098 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
CXCL13O43927 KIF5C-201ENST00000435030 6931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
CXCL13O43927 COQ8B-201ENST00000243583 2041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
CXCL13O43927 AC107871.1-202ENST00000562767 3389 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
CXCL13O43927 F3-201ENST00000334047 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
CXCL13O43927 ACOX3-203ENST00000503233 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
CXCL13O43927 SULT1A2-204ENST00000533150 1991 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
CXCL13O43927 SYTL2-215ENST00000527523 3049 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
CXCL13O43927 AL121758.1-201ENST00000488788 2714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
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