Protein–RNA interactions for Protein: O43497

CACNA1G, Voltage-dependent T-type calcium channel subunit alpha-1G, humanhuman

Predictions only

Length 2,377 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNA1GO43497 BSG-203ENST00000353555 1616 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
CACNA1GO43497 PLPPR2-208ENST00000591608 2552 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.02□□□□□ -0.01
CACNA1GO43497 VAV2-202ENST00000371851 5101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
CACNA1GO43497 TNK2-AS1-201ENST00000458180 2096 ntTSL 2 BASIC15.02□□□□□ -0.01
CACNA1GO43497 AC127496.1-202ENST00000573602 2091 ntTSL 2 BASIC15.02□□□□□ -0.01
CACNA1GO43497 THOC6-201ENST00000253952 1246 ntTSL 2 BASIC15.02□□□□□ -0.01
CACNA1GO43497 AC134698.3-201ENST00000523880 214 ntBASIC15.02□□□□□ -0.01
CACNA1GO43497 CLEC11A-202ENST00000599973 1026 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
CACNA1GO43497 FHL2-212ENST00000607522 759 ntTSL 2 BASIC15.02□□□□□ -0.01
CACNA1GO43497 RWDD4-205ENST00000510968 1551 ntTSL 4 BASIC15.02□□□□□ -0.01
CACNA1GO43497 DVL2-209ENST00000575458 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
CACNA1GO43497 USP4-201ENST00000265560 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
CACNA1GO43497 GPS1-208ENST00000578552 1874 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
CACNA1GO43497 REPS1-202ENST00000367663 2607 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
CACNA1GO43497 AMT-232ENST00000636199 1546 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
CACNA1GO43497 TC2N-201ENST00000340892 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
CACNA1GO43497 KCTD14-201ENST00000353172 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
CACNA1GO43497 FGFR1-206ENST00000397091 5702 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
CACNA1GO43497 GCGR-201ENST00000400723 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
CACNA1GO43497 KTN1-AS1-201ENST00000335142 1465 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
CACNA1GO43497 RNF144A-201ENST00000320892 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
CACNA1GO43497 B3GNT9-201ENST00000449549 2917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
CACNA1GO43497 CDK3-202ENST00000448471 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
CACNA1GO43497 APAF1-210ENST00000551964 5444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
CACNA1GO43497 AC104809.2-201ENST00000418218 2274 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
CACNA1GO43497 HEBP1-201ENST00000014930 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
CACNA1GO43497 TPO-206ENST00000382269 1155 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
CACNA1GO43497 PEMT-203ENST00000395782 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
CACNA1GO43497 SPDYE17-201ENST00000412399 783 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
CACNA1GO43497 EHMT2-AS1-201ENST00000434689 373 ntTSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
CACNA1GO43497 AC126768.2-201ENST00000511693 718 ntTSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
CACNA1GO43497 TUBB6-203ENST00000586653 788 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
CACNA1GO43497 C19orf38-203ENST00000592854 1060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
CACNA1GO43497 AC020914.3-201ENST00000594712 304 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
CACNA1GO43497 AC091812.3-201ENST00000621362 345 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
CACNA1GO43497 AP001273.2-201ENST00000638767 2993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
CACNA1GO43497 GOLGA2P7-201ENST00000316967 2525 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
CACNA1GO43497 AC012313.1-201ENST00000593393 3059 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
CACNA1GO43497 FADS2-202ENST00000278840 3630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
CACNA1GO43497 FOXD4L4-201ENST00000377413 2230 ntAPPRIS P1 BASIC15.01□□□□□ -0.01
CACNA1GO43497 SPATS1-201ENST00000288390 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
CACNA1GO43497 CLEC18C-201ENST00000314151 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
CACNA1GO43497 CLEC18A-208ENST00000568461 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
CACNA1GO43497 CASKIN2-201ENST00000321617 5015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
CACNA1GO43497 STOX1-201ENST00000298596 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
CACNA1GO43497 ADAMTSL1-202ENST00000327883 1864 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
CACNA1GO43497 HLA-DQB1-204ENST00000399084 1734 ntAPPRIS P1 BASIC15.01□□□□□ -0.01
CACNA1GO43497 LUC7L2-202ENST00000354926 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
CACNA1GO43497 NECAB2-203ENST00000565691 2064 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
CACNA1GO43497 AMFR-201ENST00000290649 3600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
CACNA1GO43497 GCK-202ENST00000345378 2421 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
CACNA1GO43497 HNRNPA1P32-201ENST00000396326 963 ntBASIC15□□□□□ -0.01
CACNA1GO43497 SAPCD1-209ENST00000425424 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
CACNA1GO43497 TDH-203ENST00000531764 1110 ntBASIC15□□□□□ -0.01
CACNA1GO43497 IL32-231ENST00000551513 791 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
CACNA1GO43497 NAA38-207ENST00000576861 556 ntTSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
CACNA1GO43497 HTT-AS1_1.1-201ENST00000612914 230 ntBASIC15□□□□□ -0.01
CACNA1GO43497 AC005695.3-201ENST00000614522 232 ntBASIC15□□□□□ -0.01
CACNA1GO43497 LINC02351-201ENST00000614728 289 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
CACNA1GO43497 AC244452.3-201ENST00000636814 210 ntBASIC15□□□□□ -0.01
CACNA1GO43497 RNF7-201ENST00000273480 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CACNA1GO43497 PCCA-203ENST00000376286 2481 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
CACNA1GO43497 GFOD2-203ENST00000602377 1991 ntTSL 4 BASIC15□□□□□ -0.01
CACNA1GO43497 CDK2-204ENST00000553376 1725 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
CACNA1GO43497 GGT6-203ENST00000573591 1730 ntTSL 4 BASIC15□□□□□ -0.01
CACNA1GO43497 ZNRD1ASP-217ENST00000437417 1497 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CACNA1GO43497 IGSF9-206ENST00000611023 2663 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CACNA1GO43497 FAM124A-202ENST00000322475 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CACNA1GO43497 KIAA0319L-201ENST00000325722 4789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CACNA1GO43497 TNFRSF13C-201ENST00000291232 3944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CACNA1GO43497 ZCWPW1-202ENST00000398027 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CACNA1GO43497 ZNF414-202ENST00000393927 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CACNA1GO43497 ETV3L-201ENST00000454449 1976 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
CACNA1GO43497 TNFSF11-201ENST00000239849 911 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
CACNA1GO43497 AGRP-201ENST00000290953 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CACNA1GO43497 LSM10-201ENST00000315732 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CACNA1GO43497 KCNK7-201ENST00000340313 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CACNA1GO43497 TNNT2-206ENST00000367320 1007 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CACNA1GO43497 SERPINE3-201ENST00000400389 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CACNA1GO43497 BAALC-AS2-201ENST00000436771 496 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CACNA1GO43497 SERBP1P2-201ENST00000436888 1164 ntBASIC15□□□□□ -0.01
CACNA1GO43497 AC245884.6-201ENST00000515672 1067 ntBASIC15□□□□□ -0.01
CACNA1GO43497 RAB40B-202ENST00000538809 704 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
CACNA1GO43497 BX927359.1-201ENST00000556073 543 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
CACNA1GO43497 LINC02299-201ENST00000556669 430 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
CACNA1GO43497 COMMD4-217ENST00000567195 677 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
CACNA1GO43497 EIF5AP2-201ENST00000585668 1047 ntBASIC15□□□□□ -0.01
CACNA1GO43497 FMNL3-202ENST00000352151 4006 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
CACNA1GO43497 FAM49B-224ENST00000522941 1700 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
CACNA1GO43497 CRCP-201ENST00000338592 1393 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CACNA1GO43497 RCC2-202ENST00000375436 4087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CACNA1GO43497 KCNC1-201ENST00000265969 4295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
CACNA1GO43497 PODXL-201ENST00000322985 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CACNA1GO43497 RDH10-201ENST00000240285 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CACNA1GO43497 RPH3A-203ENST00000543106 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
CACNA1GO43497 KDM5C-203ENST00000375383 5122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
CACNA1GO43497 EIF4ENIF1-206ENST00000397525 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CACNA1GO43497 P4HA2-201ENST00000166534 2230 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CACNA1GO43497 ASB16-AS1-201ENST00000585457 2213 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
CACNA1GO43497 CROCCP2-202ENST00000412962 2773 ntBASIC15□□□□□ -0.01
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