Protein–RNA interactions for Protein: O15360

FANCA, Fanconi anemia group A protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,455 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FANCAO15360 ZC2HC1C-202ENST00000439583 1509 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
FANCAO15360 PPEF2-207ENST00000621010 1797 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
FANCAO15360 KRT27-201ENST00000301656 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
FANCAO15360 RGS3-210ENST00000462143 2759 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
FANCAO15360 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
FANCAO15360 DMRTA2-201ENST00000404795 3137 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
FANCAO15360 MAFK-201ENST00000343242 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
FANCAO15360 AC127496.1-202ENST00000573602 2091 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
FANCAO15360 GTPBP3-201ENST00000324894 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
FANCAO15360 USH1C-205ENST00000527020 2159 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
FANCAO15360 PPP1R16A-202ENST00000435887 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
FANCAO15360 CNN1-202ENST00000535659 1527 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
FANCAO15360 RAB41-201ENST00000276066 1071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
FANCAO15360 YIPF7-201ENST00000332990 937 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
FANCAO15360 RAB41-202ENST00000374473 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
FANCAO15360 TMEM107-203ENST00000431792 455 ntTSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
FANCAO15360 SIRPB2-203ENST00000444444 884 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
FANCAO15360 AL163636.1-201ENST00000554286 915 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
FANCAO15360 FBXL12-212ENST00000592067 879 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
FANCAO15360 ECM1P1-201ENST00000604092 1279 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
FANCAO15360 AC128714.1-201ENST00000637035 887 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
FANCAO15360 C16orf71-201ENST00000299320 2722 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
FANCAO15360 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
FANCAO15360 CAPRIN1-207ENST00000529307 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
FANCAO15360 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
FANCAO15360 TRMT6-201ENST00000203001 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
FANCAO15360 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
FANCAO15360 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
FANCAO15360 ACTBP8-201ENST00000403258 1108 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
FANCAO15360 AL451042.2-201ENST00000424774 904 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
FANCAO15360 LINC00642-202ENST00000442515 670 ntTSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
FANCAO15360 NME2-207ENST00000514264 850 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
FANCAO15360 LINC02449-203ENST00000536034 451 ntTSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
FANCAO15360 DIO3OS-203ENST00000554441 1068 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
FANCAO15360 AC106738.2-201ENST00000559802 557 ntTSL 4 BASIC23.93■■□□□ 1.42
FANCAO15360 AC097724.1-201ENST00000609581 426 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
FANCAO15360 AC132938.4-201ENST00000623835 848 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
FANCAO15360 TPRX1-201ENST00000322175 1924 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
FANCAO15360 RAPSN-202ENST00000352508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
FANCAO15360 LEF1-216ENST00000510624 1472 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
FANCAO15360 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
FANCAO15360 U2AF2-201ENST00000308924 1698 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
FANCAO15360 CCDC181-206ENST00000491570 1652 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
FANCAO15360 SQOR-208ENST00000568606 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
FANCAO15360 AC009292.1-201ENST00000502156 1986 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
FANCAO15360 ACOXL-201ENST00000340561 2188 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
FANCAO15360 SPOP-201ENST00000347630 2965 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
FANCAO15360 UEVLD-203ENST00000379387 1848 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
FANCAO15360 NPY4R-202ENST00000612632 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
FANCAO15360 NPY4R2-202ENST00000613306 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
FANCAO15360 DCST1-202ENST00000368419 2207 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
FANCAO15360 TBRG4-203ENST00000395655 2225 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
FANCAO15360 CPZ-203ENST00000382480 2538 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
FANCAO15360 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
FANCAO15360 IFFO1-212ENST00000619571 2724 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
FANCAO15360 RHCE-202ENST00000340849 1087 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
FANCAO15360 CSAG1-202ENST00000370287 875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
FANCAO15360 PPIE-203ENST00000372830 1198 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
FANCAO15360 POM121L10P-201ENST00000436994 1285 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
FANCAO15360 RN7SL769P-201ENST00000469386 295 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
FANCAO15360 AC078785.1-201ENST00000496389 734 ntTSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
FANCAO15360 AP001790.1-201ENST00000511947 570 ntTSL 4 BASIC23.92■■□□□ 1.42
FANCAO15360 TRAPPC2L-206ENST00000564365 1060 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
FANCAO15360 AC092634.5-202ENST00000587736 928 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
FANCAO15360 DMAC2-208ENST00000589970 979 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
FANCAO15360 DMAC2-215ENST00000597457 492 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
FANCAO15360 ZNF815P-201ENST00000421890 1352 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
FANCAO15360 FANCA-213ENST00000563673 1694 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
FANCAO15360 NFIC-202ENST00000395111 1755 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
FANCAO15360 ADSL-220ENST00000636714 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
FANCAO15360 RGR-201ENST00000358110 1349 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
FANCAO15360 PIF1-201ENST00000268043 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
FANCAO15360 TOM1L2-201ENST00000318094 2259 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
FANCAO15360 ZSCAN18-208ENST00000595944 1768 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
FANCAO15360 OS9-205ENST00000413095 1660 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
FANCAO15360 B9D1-202ENST00000268841 755 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
FANCAO15360 PAX4-201ENST00000338516 1085 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
FANCAO15360 AL133267.1-201ENST00000398220 340 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
FANCAO15360 CD8B2-202ENST00000417670 633 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
FANCAO15360 PTPA-218ENST00000435132 618 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
FANCAO15360 TPO-215ENST00000539820 1157 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
FANCAO15360 AC011474.2-201ENST00000579268 543 ntTSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
FANCAO15360 DPF2-205ENST00000528416 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
FANCAO15360 RCAN3-210ENST00000618490 2386 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
FANCAO15360 MOG-215ENST00000376888 1529 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
FANCAO15360 CNGA3-205ENST00000436404 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
FANCAO15360 ZNRD1ASP-217ENST00000437417 1497 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
FANCAO15360 RAB40C-203ENST00000535977 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
FANCAO15360 TAPBPL-201ENST00000266556 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
FANCAO15360 SPIRE2-201ENST00000378247 3235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
FANCAO15360 MUL1-201ENST00000264198 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
FANCAO15360 CD99P1-204ENST00000435581 2788 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
FANCAO15360 DBNDD2-201ENST00000357275 1036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
FANCAO15360 HIST2H2AA3-201ENST00000369159 549 ntAPPRIS P1 BASIC23.9■■□□□ 1.42
FANCAO15360 MIR33B-201ENST00000385104 96 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
FANCAO15360 PSTK-202ENST00000405485 1047 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
FANCAO15360 LINC01840-201ENST00000421870 571 ntTSL 4 BASIC23.9■■□□□ 1.42
FANCAO15360 ZNF789-204ENST00000448667 1055 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
FANCAO15360 LYRM4-206ENST00000468929 1168 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
FANCAO15360 HBS1L-208ENST00000525067 582 ntTSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.5 ms