Protein–RNA interactions for Protein: O15178

T, Brachyury protein, humanhuman

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Length 435 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TO15178 RPN1-201ENST00000296255 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
TO15178 BACE1-211ENST00000528053 4083 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
TO15178 AL035685.1-202ENST00000637341 1688 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
TO15178 KREMEN1-203ENST00000407188 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
TO15178 TMEM220-202ENST00000455996 1402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
TO15178 SLC22A12-205ENST00000473690 2522 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
TO15178 KLC1-212ENST00000553286 3135 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
TO15178 MTFR2-203ENST00000420702 1793 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
TO15178 AC105202.1-204ENST00000502167 1781 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
TO15178 BBS2-218ENST00000568104 2623 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
TO15178 KLK10-202ENST00000358789 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
TO15178 LRRN2-203ENST00000367177 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
TO15178 ADGRA1-AS1-201ENST00000366099 3236 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
TO15178 POP7-201ENST00000303151 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
TO15178 LCE1A-201ENST00000335123 422 ntAPPRIS P1 BASIC14.94□□□□□ -0.02
TO15178 AC099552.3-201ENST00000454149 367 ntTSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
TO15178 NECTIN3-AS1-204ENST00000476301 568 ntTSL 4 BASIC14.94□□□□□ -0.02
TO15178 CSRP2-202ENST00000546966 754 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
TO15178 TMEM263-206ENST00000550344 925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
TO15178 AC025678.2-201ENST00000562061 970 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
TO15178 AC018558.2-201ENST00000566562 480 ntTSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
TO15178 AC022167.4-201ENST00000570290 498 ntTSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
TO15178 MRPL34-202ENST00000594999 555 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
TO15178 AC026979.3-201ENST00000607315 403 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
TO15178 WNT1-202ENST00000613114 1278 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
TO15178 GRIFIN-202ENST00000614228 461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
TO15178 GTF2IRD2-205ENST00000614386 578 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
TO15178 LAMTOR5-208ENST00000614544 846 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
TO15178 AC244153.1-203ENST00000622796 419 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
TO15178 FAM92B-201ENST00000539556 1898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
TO15178 TAP2-202ENST00000374899 2497 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
TO15178 GADD45B-201ENST00000215631 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
TO15178 SART1-201ENST00000312397 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
TO15178 ARPC1B-211ENST00000451682 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
TO15178 IKZF4-206ENST00000547791 1712 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
TO15178 ATG2A-203ENST00000421419 1481 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
TO15178 TBC1D10A-203ENST00000403362 1833 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
TO15178 SLC25A45-201ENST00000294187 2196 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
TO15178 CD5L-201ENST00000368174 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
TO15178 RGL3-201ENST00000380456 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
TO15178 UBQLN1-201ENST00000257468 2299 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
TO15178 EWSR1-201ENST00000331029 2267 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
TO15178 ITSN1-209ENST00000399352 5408 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
TO15178 PARVB-203ENST00000404989 1591 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
TO15178 PARVB-204ENST00000406477 1569 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
TO15178 CPD-201ENST00000225719 9394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
TO15178 ATP6AP2-201ENST00000378438 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
TO15178 APBB2-204ENST00000502841 1681 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
TO15178 KRT18P28-201ENST00000453838 1332 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
TO15178 ADD1-205ENST00000398125 4079 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
TO15178 STXBP1-216ENST00000636962 2918 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
TO15178 DUSP13-210ENST00000491677 1770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
TO15178 MANSC1-201ENST00000396349 2220 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
TO15178 BEGAIN-201ENST00000355173 2674 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
TO15178 SIGLEC6-205ENST00000425629 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
TO15178 MEAF6-201ENST00000296214 1525 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
TO15178 PHKA1-205ENST00000541944 5944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
TO15178 ZNF324-203ENST00000536459 5653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
TO15178 PPP6R1-201ENST00000412770 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
TO15178 RALYL-208ENST00000522455 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
TO15178 CDC42BPG-201ENST00000342711 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
TO15178 KRT73-201ENST00000305748 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
TO15178 BANP-204ENST00000393208 2283 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
TO15178 PAGE5-201ENST00000289619 741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
TO15178 RPL21-203ENST00000319826 806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
TO15178 MRNIP-202ENST00000376931 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
TO15178 PABPN1L-201ENST00000411789 873 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
TO15178 PLAC9P1-202ENST00000433290 400 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
TO15178 NRSN2-AS1-202ENST00000442637 762 ntTSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
TO15178 AL359764.1-201ENST00000444330 504 ntTSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
TO15178 PTPRVP-202ENST00000490575 953 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
TO15178 PP7080-203ENST00000510604 859 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
TO15178 PPP1R14B-203ENST00000542235 920 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
TO15178 NAA38-207ENST00000576861 556 ntTSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
TO15178 MOB3A-209ENST00000592280 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
TO15178 AC244153.1-202ENST00000617855 482 ntTSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
TO15178 LINC00599-203ENST00000519461 2922 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
TO15178 MBD1-210ENST00000457839 2473 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
TO15178 ZNF786-201ENST00000316286 3144 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
TO15178 TBC1D2B-201ENST00000300584 6067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
TO15178 AL513523.2-202ENST00000427283 2040 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
TO15178 ARL15-201ENST00000502271 3248 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
TO15178 AP001282.1-201ENST00000531301 1499 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
TO15178 TBC1D28-201ENST00000345096 2789 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
TO15178 AC008677.1-201ENST00000519230 1561 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
TO15178 MOXD1-202ENST00000367963 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
TO15178 AC074117.1-201ENST00000447070 3060 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
TO15178 SMAP1-201ENST00000316999 2403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
TO15178 SHISA6-202ENST00000409168 7262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
TO15178 IL12RB2-205ENST00000541374 3849 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
TO15178 NAGK-208ENST00000455662 1778 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
TO15178 ADD1-201ENST00000264758 4045 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
TO15178 SLFNL1-201ENST00000302946 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
TO15178 RRBP1-208ENST00000470422 2070 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
TO15178 PPP1R21-206ENST00000449090 3049 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
TO15178 CNTNAP3B-201ENST00000276974 3240 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
TO15178 TIA1-206ENST00000445587 1440 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
TO15178 HNF1A-216ENST00000617366 2473 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
TO15178 FHL2-205ENST00000393353 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
TO15178 ITGB2-207ENST00000397854 2592 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
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