Protein–RNA interactions for Protein: O15054

KDM6B, Lysine-specific demethylase 6B, humanhuman

Predictions only

Length 1,643 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KDM6BO15054 ADAM10-205ENST00000461408 1932 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
KDM6BO15054 PODNL1-202ENST00000339560 2165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
KDM6BO15054 LGI4-202ENST00000392225 2891 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
KDM6BO15054 MAGEA4-206ENST00000393921 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
KDM6BO15054 NFIC-203ENST00000443272 1716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
KDM6BO15054 AARSD1-202ENST00000427569 1322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
KDM6BO15054 TMEM161A-201ENST00000162044 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
KDM6BO15054 BIN3-201ENST00000276416 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
KDM6BO15054 PEA15-202ENST00000368076 2694 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
KDM6BO15054 SEMA3B-204ENST00000433753 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
KDM6BO15054 SLC39A13-202ENST00000362021 2296 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
KDM6BO15054 LHB-201ENST00000221421 514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
KDM6BO15054 TMEM40-201ENST00000264728 984 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
KDM6BO15054 LCN9-201ENST00000277526 531 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
KDM6BO15054 UFM1-202ENST00000379649 846 ntTSL 4 BASIC24.53■■□□□ 1.52
KDM6BO15054 CRYBA2-202ENST00000392096 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
KDM6BO15054 SPTLC1P5-201ENST00000450718 252 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
KDM6BO15054 NIP7-208ENST00000569637 1099 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
KDM6BO15054 LCN9-204ENST00000619315 528 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
KDM6BO15054 SERPINH1-201ENST00000358171 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
KDM6BO15054 ZGLP1-202ENST00000403903 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
KDM6BO15054 TP73-204ENST00000378280 2062 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
KDM6BO15054 KDM1A-202ENST00000400181 3059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
KDM6BO15054 AKIRIN1-202ENST00000432648 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
KDM6BO15054 ARL6IP6-201ENST00000326446 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
KDM6BO15054 ZNF581-203ENST00000587252 1324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
KDM6BO15054 USE1-206ENST00000595101 1776 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
KDM6BO15054 MAFK-201ENST00000343242 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
KDM6BO15054 AL589702.1-201ENST00000641229 1509 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
KDM6BO15054 HIPK1-207ENST00000369561 3777 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
KDM6BO15054 CHGA-201ENST00000216492 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
KDM6BO15054 PRKG1-AS1-201ENST00000420193 971 ntTSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
KDM6BO15054 AC016700.1-201ENST00000429424 312 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
KDM6BO15054 CXorf40A-211ENST00000450602 1204 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
KDM6BO15054 AC093433.1-201ENST00000458048 571 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
KDM6BO15054 PRSS30P-204ENST00000489864 650 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
KDM6BO15054 C14orf132-202ENST00000553782 536 ntTSL 4 BASIC24.52■■□□□ 1.52
KDM6BO15054 AP001063.1-201ENST00000568332 529 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
KDM6BO15054 INPP4A-205ENST00000409851 3365 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
KDM6BO15054 COTL1-201ENST00000262428 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
KDM6BO15054 RBBP7-204ENST00000404022 1904 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
KDM6BO15054 GOLGA6L2-204ENST00000567107 3030 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
KDM6BO15054 ETNK2-203ENST00000367202 2434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
KDM6BO15054 DARS-201ENST00000264161 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
KDM6BO15054 SDCBP2-202ENST00000360779 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
KDM6BO15054 NFIX-214ENST00000592199 1509 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
KDM6BO15054 MARCO-201ENST00000327097 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
KDM6BO15054 C9orf62-201ENST00000623103 1924 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
KDM6BO15054 SEPT12-202ENST00000396693 1156 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
KDM6BO15054 RBAK-RBAKDN-201ENST00000396904 766 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC24.51■■□□□ 1.51
KDM6BO15054 RBAK-RBAKDN-202ENST00000407184 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
KDM6BO15054 VMO1-203ENST00000416307 712 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
KDM6BO15054 AL133466.1-201ENST00000447582 150 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
KDM6BO15054 CENPM-208ENST00000472374 541 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
KDM6BO15054 SRD5A3-AS1-211ENST00000599135 737 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
KDM6BO15054 DYRK1B-208ENST00000601972 772 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
KDM6BO15054 RN7SL736P-201ENST00000613111 269 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
KDM6BO15054 MECR-201ENST00000263702 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
KDM6BO15054 XAF1-201ENST00000346752 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
KDM6BO15054 LINC01660-203ENST00000618517 1859 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
KDM6BO15054 DNM1-216ENST00000634267 2909 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
KDM6BO15054 DTX2-206ENST00000430490 2623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
KDM6BO15054 GCK-202ENST00000345378 2421 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
KDM6BO15054 CCDC112-205ENST00000506442 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
KDM6BO15054 AL512625.3-203ENST00000445604 1602 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
KDM6BO15054 NDUFV1-202ENST00000415352 1512 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
KDM6BO15054 ZNF264-202ENST00000536056 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
KDM6BO15054 RNF128-201ENST00000255499 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
KDM6BO15054 GGT3P-204ENST00000453783 1664 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
KDM6BO15054 METTL17-202ENST00000382985 1586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
KDM6BO15054 ZFAND6-211ENST00000559157 1559 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
KDM6BO15054 ACSM2A-213ENST00000575690 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
KDM6BO15054 CDH22-203ENST00000537909 3902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
KDM6BO15054 CDK2-202ENST00000354056 1260 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
KDM6BO15054 IGLJ3-201ENST00000390324 176 ntAPPRIS P1 BASIC24.5■■□□□ 1.51
KDM6BO15054 LINC01067-201ENST00000432575 664 ntTSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
KDM6BO15054 TREX1-201ENST00000433541 1105 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
KDM6BO15054 AL139246.4-201ENST00000442305 514 ntTSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
KDM6BO15054 HOMER2P2-201ENST00000451621 847 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
KDM6BO15054 RPL13AP25-201ENST00000484130 612 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
KDM6BO15054 AC022137.2-201ENST00000503482 481 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
KDM6BO15054 AC078819.1-201ENST00000547454 765 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
KDM6BO15054 AC012085.1-201ENST00000548270 765 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
KDM6BO15054 LYSMD2-204ENST00000560491 1026 ntTSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
KDM6BO15054 FXYD6-217ENST00000584394 669 ntTSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
KDM6BO15054 TBCB-211ENST00000589996 724 ntTSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
KDM6BO15054 NKG7-204ENST00000595217 816 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
KDM6BO15054 AC011510.1-201ENST00000598541 286 ntTSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
KDM6BO15054 AL137026.1-201ENST00000624407 503 ntTSL 4 BASIC24.5■■□□□ 1.51
KDM6BO15054 ZSCAN18-201ENST00000240727 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
KDM6BO15054 IL34-202ENST00000429149 1779 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
KDM6BO15054 CXXC4-201ENST00000394767 5565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
KDM6BO15054 BCAS4-201ENST00000358791 1378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
KDM6BO15054 PDCD7-201ENST00000204549 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
KDM6BO15054 PALM-201ENST00000264560 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC24.5■■□□□ 1.51
KDM6BO15054 MRPL13-201ENST00000306185 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
KDM6BO15054 FO393414.2-201ENST00000405153 598 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
KDM6BO15054 IFI35-203ENST00000415816 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
KDM6BO15054 PSMB5-203ENST00000425762 900 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
KDM6BO15054 PTPA-218ENST00000435132 618 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
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