Protein–RNA interactions for Protein: J3QRK9

Uncharacterized protein (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 145 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
J3QRK9 SH3BP5L-201ENST00000366472 3861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
J3QRK9 RAB37-208ENST00000402449 1560 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
J3QRK9 DGCR9-201ENST00000609630 2415 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
J3QRK9 MIR4300HG-201ENST00000500502 1397 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
J3QRK9 SLC52A3-202ENST00000381944 3060 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
J3QRK9 MYD88-203ENST00000417037 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
J3QRK9 SEMA4D-204ENST00000420101 1837 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
J3QRK9 KIAA0895L-201ENST00000290881 3550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
J3QRK9 TNFRSF11A-205ENST00000616710 3809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
J3QRK9 CLASP2-203ENST00000359576 7141 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
J3QRK9 TRIM73-205ENST00000450434 1425 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
J3QRK9 ZW10-201ENST00000200135 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
J3QRK9 C9orf139-202ENST00000623196 4990 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
J3QRK9 FCHO1-206ENST00000594202 3214 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
J3QRK9 PDE3B-202ENST00000455098 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
J3QRK9 FKBP3-201ENST00000216330 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
J3QRK9 LGALS12-201ENST00000255684 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
J3QRK9 AL135999.2-201ENST00000622438 1686 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
J3QRK9 TJP2-208ENST00000535702 3984 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
J3QRK9 RUSC1-209ENST00000471876 1749 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
J3QRK9 CDH20-202ENST00000536675 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
J3QRK9 DGUOK-201ENST00000264093 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
J3QRK9 DGUOK-202ENST00000348222 880 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
J3QRK9 CALML5-201ENST00000380332 859 ntAPPRIS P1 BASIC14.59□□□□□ -0.07
J3QRK9 DMKN-208ENST00000424570 1293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
J3QRK9 SLC25A48-204ENST00000433282 1111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
J3QRK9 HMGB3P22-201ENST00000442010 597 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
J3QRK9 SLC25A3P1-201ENST00000443844 931 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
J3QRK9 MNX1-AS1-201ENST00000480284 1041 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
J3QRK9 DUX4L17-201ENST00000557360 1267 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
J3QRK9 SLF2-205ENST00000609386 891 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
J3QRK9 ST20-MTHFS-203ENST00000615374 679 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
J3QRK9 LRRC23-215ENST00000622489 1061 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
J3QRK9 AC092902.2-222ENST00000626312 568 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
J3QRK9 DGUOK-208ENST00000629438 1029 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
J3QRK9 CNDP1-201ENST00000358821 2215 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
J3QRK9 PIR-202ENST00000380421 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
J3QRK9 WNT8A-204ENST00000506684 1543 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
J3QRK9 PITRM1-206ENST00000451104 3183 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
J3QRK9 CTD-3080P12.3-203ENST00000514376 1757 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
J3QRK9 FGR-203ENST00000374005 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
J3QRK9 SCYL1-205ENST00000524944 2715 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
J3QRK9 UBXN11-206ENST00000374222 2043 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
J3QRK9 FLI1-201ENST00000281428 4151 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
J3QRK9 PRKCZ-202ENST00000400921 2294 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
J3QRK9 MCC-202ENST00000408903 3476 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
J3QRK9 HAGHL-203ENST00000389703 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
J3QRK9 SIT1-204ENST00000618781 1317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
J3QRK9 LRRFIP1-203ENST00000308482 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
J3QRK9 MTG1-201ENST00000317502 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
J3QRK9 AMZ1-201ENST00000312371 5516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
J3QRK9 CARHSP1-220ENST00000619881 2849 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
J3QRK9 FAM219A-203ENST00000379080 3591 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
J3QRK9 ZDHHC20-201ENST00000320220 1351 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
J3QRK9 AEN-201ENST00000332810 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
J3QRK9 PLD3-204ENST00000409281 2115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
J3QRK9 AC016757.1-205ENST00000470346 1888 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
J3QRK9 NDRG4-217ENST00000562999 2931 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
J3QRK9 DENND4C-209ENST00000602925 6831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
J3QRK9 RNASEH2B-202ENST00000422660 4830 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
J3QRK9 TNIP1-214ENST00000522226 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.07
J3QRK9 CHEK2-204ENST00000382580 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
J3QRK9 CRYBG2-210ENST00000527815 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.07
J3QRK9 CCDC136-212ENST00000487361 2268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
J3QRK9 CABP4-201ENST00000325656 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
J3QRK9 HTR1A-201ENST00000323865 1778 ntAPPRIS P1 BASIC14.58□□□□□ -0.08
J3QRK9 PDCD5-203ENST00000419343 1799 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
J3QRK9 MKRN3-201ENST00000314520 2337 ntAPPRIS P1 BASIC14.58□□□□□ -0.08
J3QRK9 PDE8A-201ENST00000310298 3984 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
J3QRK9 B3GNT7-201ENST00000287590 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
J3QRK9 TRPC6-203ENST00000360497 2631 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
J3QRK9 CLDN7-201ENST00000360325 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
J3QRK9 CEP70-213ENST00000489254 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
J3QRK9 RNF123-202ENST00000432042 2670 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
J3QRK9 KRAS-202ENST00000311936 5765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
J3QRK9 FRMD8-202ENST00000355991 3514 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
J3QRK9 PLEKHG3-202ENST00000394691 4397 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
J3QRK9 PFDN6-201ENST00000374606 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
J3QRK9 ACP1-205ENST00000407983 703 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
J3QRK9 DARS-AS1-202ENST00000419808 772 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
J3QRK9 RPL39L-203ENST00000455270 653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
J3QRK9 MDH2-205ENST00000461263 648 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
J3QRK9 CNP-204ENST00000472031 1019 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
J3QRK9 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
J3QRK9 CNTD2-203ENST00000513948 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
J3QRK9 ANK1-211ENST00000522231 1060 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
J3QRK9 ANK1-212ENST00000522543 1160 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
J3QRK9 CD81-212ENST00000526072 1172 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
J3QRK9 CADM1-222ENST00000616271 1246 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
J3QRK9 CD24-206ENST00000620405 586 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
J3QRK9 NDUFAB1-201ENST00000007516 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
J3QRK9 HNRNPDL-208ENST00000621267 4139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
J3QRK9 SLC22A6-203ENST00000421062 1560 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
J3QRK9 TLE6-202ENST00000452088 1883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
J3QRK9 FGD5P1-202ENST00000614866 2498 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
J3QRK9 KRT18P22-201ENST00000402024 1347 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
J3QRK9 NSUN5-202ENST00000310326 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
J3QRK9 CENPT-215ENST00000564817 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
J3QRK9 AC079447.1-201ENST00000424491 1947 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
J3QRK9 RPRD1A-209ENST00000590898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
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