Protein–RNA interactions for Protein: B6SEH8

ERVV-1, Endogenous retrovirus group V member 1 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 477 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVV-1B6SEH8 VCX3B-204ENST00000453306 868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
ERVV-1B6SEH8 AC022494.1-201ENST00000466044 728 ntBASIC20■□□□□ 0.79
ERVV-1B6SEH8 ROPN1-207ENST00000484329 566 ntTSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
ERVV-1B6SEH8 AC136475.2-201ENST00000526612 392 ntTSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
ERVV-1B6SEH8 AP001360.1-202ENST00000526934 479 ntTSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
ERVV-1B6SEH8 TDH-203ENST00000531764 1110 ntBASIC20■□□□□ 0.79
ERVV-1B6SEH8 GCHFR-206ENST00000561160 572 ntTSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
ERVV-1B6SEH8 SHBG-212ENST00000575314 1146 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
ERVV-1B6SEH8 SNAP25-AS1-208ENST00000605592 556 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
ERVV-1B6SEH8 AC006449.3-201ENST00000620144 563 ntTSL 4 BASIC20■□□□□ 0.79
ERVV-1B6SEH8 TMEM222-211ENST00000611517 1613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
ERVV-1B6SEH8 NSD3-201ENST00000316985 3995 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
ERVV-1B6SEH8 CNOT6-202ENST00000393356 6303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
ERVV-1B6SEH8 STXBP3-201ENST00000370008 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
ERVV-1B6SEH8 FLJ38576-201ENST00000623820 2459 ntBASIC20■□□□□ 0.79
ERVV-1B6SEH8 SPATS2L-202ENST00000360760 2119 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
ERVV-1B6SEH8 SNRPD3-201ENST00000215829 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
ERVV-1B6SEH8 RNF167-214ENST00000576229 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
ERVV-1B6SEH8 SENP1-204ENST00000549518 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
ERVV-1B6SEH8 SLC4A4-201ENST00000264485 5852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
ERVV-1B6SEH8 RBM33-205ENST00000392759 1580 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
ERVV-1B6SEH8 ZC3H12A-201ENST00000373087 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
ERVV-1B6SEH8 AC092171.3-201ENST00000610122 2651 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
ERVV-1B6SEH8 CMTM3-202ENST00000424011 2330 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
ERVV-1B6SEH8 RAB38-201ENST00000243662 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
ERVV-1B6SEH8 ZDHHC4-203ENST00000396707 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
ERVV-1B6SEH8 AL355987.4-201ENST00000415992 4244 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
ERVV-1B6SEH8 NHEG1-202ENST00000432330 1357 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
ERVV-1B6SEH8 ETFA-203ENST00000557943 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
ERVV-1B6SEH8 SP140L-204ENST00000444636 1781 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
ERVV-1B6SEH8 CDPF1-204ENST00000404744 1541 ntTSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.79
ERVV-1B6SEH8 WNT2-201ENST00000265441 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
ERVV-1B6SEH8 UBE2QL1-201ENST00000399816 4317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
ERVV-1B6SEH8 MIOX-201ENST00000216075 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
ERVV-1B6SEH8 GPR148-201ENST00000309926 1267 ntAPPRIS P1 BASIC19.99■□□□□ 0.79
ERVV-1B6SEH8 KRTAP19-3-201ENST00000334063 522 ntAPPRIS P1 BASIC19.99■□□□□ 0.79
ERVV-1B6SEH8 AC005229.1-201ENST00000392885 409 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
ERVV-1B6SEH8 Z94721.1-201ENST00000444102 385 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
ERVV-1B6SEH8 AC021491.2-201ENST00000513017 607 ntTSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.79
ERVV-1B6SEH8 AC004803.1-204ENST00000543290 512 ntTSL 4 BASIC19.99■□□□□ 0.79
ERVV-1B6SEH8 AC027601.2-201ENST00000571085 805 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
ERVV-1B6SEH8 RPL23AP53-203ENST00000606975 736 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
ERVV-1B6SEH8 AL022328.1-201ENST00000610050 478 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
ERVV-1B6SEH8 IFI27-206ENST00000612813 725 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.79
ERVV-1B6SEH8 ARHGEF28-204ENST00000437974 5792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
ERVV-1B6SEH8 MAGEA2-207ENST00000620710 1947 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
ERVV-1B6SEH8 MYO15B-232ENST00000610510 9195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
ERVV-1B6SEH8 SNAI3-AS1-202ENST00000563475 2081 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
ERVV-1B6SEH8 ATP2A2-201ENST00000308664 4453 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
ERVV-1B6SEH8 ENTPD6-202ENST00000360031 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
ERVV-1B6SEH8 ODF3-201ENST00000325113 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
ERVV-1B6SEH8 TTC13-202ENST00000366662 3112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
ERVV-1B6SEH8 MFSD2A-201ENST00000372809 2173 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
ERVV-1B6SEH8 PLCB2-202ENST00000456256 4242 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
ERVV-1B6SEH8 ZC3H12D-201ENST00000409806 5791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
ERVV-1B6SEH8 AGBL5-202ENST00000360131 3177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
ERVV-1B6SEH8 U73166.1-201ENST00000439898 2625 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
ERVV-1B6SEH8 TUBA3E-201ENST00000312988 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
ERVV-1B6SEH8 PDIA3P1-201ENST00000471856 1510 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
ERVV-1B6SEH8 KLK3-202ENST00000360617 1664 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
ERVV-1B6SEH8 ATP6V1B1-202ENST00000412314 1805 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
ERVV-1B6SEH8 TSFM-201ENST00000323833 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
ERVV-1B6SEH8 APOA1-204ENST00000375323 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
ERVV-1B6SEH8 ADAMTSL1-208ENST00000380570 931 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
ERVV-1B6SEH8 SOCS2P1-201ENST00000417727 557 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
ERVV-1B6SEH8 ZNF815P-202ENST00000422825 805 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
ERVV-1B6SEH8 SGK2-207ENST00000426287 1182 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
ERVV-1B6SEH8 GNB3-202ENST00000435982 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
ERVV-1B6SEH8 AC097717.1-202ENST00000457577 740 ntTSL 3 BASIC19.98■□□□□ 0.79
ERVV-1B6SEH8 AL121845.2-201ENST00000467211 252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.98■□□□□ 0.79
ERVV-1B6SEH8 SPDYE16-201ENST00000515340 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
ERVV-1B6SEH8 APRT-204ENST00000563655 709 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
ERVV-1B6SEH8 AC120045.2-201ENST00000567334 178 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
ERVV-1B6SEH8 AP001005.4-201ENST00000572530 387 ntTSL 3 BASIC19.98■□□□□ 0.79
ERVV-1B6SEH8 AL049840.4-201ENST00000602422 811 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
ERVV-1B6SEH8 DIABLO-206ENST00000443649 2250 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
ERVV-1B6SEH8 DDX55-203ENST00000421670 1574 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
ERVV-1B6SEH8 TBP-206ENST00000540980 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
ERVV-1B6SEH8 NUP50-202ENST00000396096 1895 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
ERVV-1B6SEH8 MYH7B-201ENST00000262873 6293 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
ERVV-1B6SEH8 PACS2-202ENST00000430725 2944 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
ERVV-1B6SEH8 STRN4-201ENST00000263280 3210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
ERVV-1B6SEH8 AC006504.5-203ENST00000590628 1335 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
ERVV-1B6SEH8 KRT27-201ENST00000301656 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
ERVV-1B6SEH8 CFLAR-205ENST00000342795 1613 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
ERVV-1B6SEH8 EPHX2-202ENST00000517536 1600 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
ERVV-1B6SEH8 UNKL-204ENST00000389221 5116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
ERVV-1B6SEH8 TLE2-202ENST00000426948 2406 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
ERVV-1B6SEH8 CCDC112-205ENST00000506442 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
ERVV-1B6SEH8 UEVLD-203ENST00000379387 1848 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
ERVV-1B6SEH8 LTBP4-203ENST00000308370 4948 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
ERVV-1B6SEH8 NTRK1-203ENST00000392302 2609 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
ERVV-1B6SEH8 SLC39A1-211ENST00000621013 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
ERVV-1B6SEH8 PCTP-201ENST00000268896 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
ERVV-1B6SEH8 CCL25-201ENST00000253451 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
ERVV-1B6SEH8 CREG2-201ENST00000324768 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
ERVV-1B6SEH8 KIF9-205ENST00000432493 633 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
ERVV-1B6SEH8 RPS24-203ENST00000435275 656 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
ERVV-1B6SEH8 FAM162A-202ENST00000469967 1015 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
ERVV-1B6SEH8 AC092658.1-201ENST00000505836 891 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.3 ms