Protein–RNA interactions for Protein: B4DU55

ZNF879, Zinc finger protein 879, humanhuman

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Length 563 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF879B4DU55 SRPX-201ENST00000378533 1874 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
ZNF879B4DU55 CLEC18A-203ENST00000449317 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
ZNF879B4DU55 NAGK-208ENST00000455662 1778 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
ZNF879B4DU55 ZNF114-204ENST00000595607 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
ZNF879B4DU55 WDR1-205ENST00000502702 1691 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
ZNF879B4DU55 PLVAP-201ENST00000252590 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
ZNF879B4DU55 MYEF2-201ENST00000267836 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
ZNF879B4DU55 KMT2E-202ENST00000311117 6874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
ZNF879B4DU55 SPERT-201ENST00000310521 1613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
ZNF879B4DU55 CA9-201ENST00000378357 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
ZNF879B4DU55 AC007728.2-201ENST00000563315 2296 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
ZNF879B4DU55 AC092718.8-201ENST00000640345 2892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
ZNF879B4DU55 CCZ1-207ENST00000628813 2218 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
ZNF879B4DU55 HPS1-202ENST00000338546 1580 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
ZNF879B4DU55 HYAL2-208ENST00000447092 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
ZNF879B4DU55 AC007182.1-201ENST00000455232 2159 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
ZNF879B4DU55 C3-201ENST00000245907 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
ZNF879B4DU55 DBN1-202ENST00000309007 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
ZNF879B4DU55 TNS2-201ENST00000314250 5010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
ZNF879B4DU55 COX10-201ENST00000261643 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
ZNF879B4DU55 PRDM16-203ENST00000378391 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
ZNF879B4DU55 GOSR2-201ENST00000225567 1245 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
ZNF879B4DU55 IGLL1-202ENST00000330377 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
ZNF879B4DU55 MRPL52-202ENST00000355151 1118 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
ZNF879B4DU55 MRPL52-203ENST00000397496 1111 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
ZNF879B4DU55 YDJC-202ENST00000398873 1066 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
ZNF879B4DU55 IGF2-206ENST00000418738 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
ZNF879B4DU55 AL356056.2-201ENST00000506914 669 ntTSL 4 BASIC14.51□□□□□ -0.09
ZNF879B4DU55 AC073648.2-201ENST00000510116 352 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
ZNF879B4DU55 AL162171.1-201ENST00000556328 718 ntTSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
ZNF879B4DU55 SPINT1-AS1-202ENST00000564302 643 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
ZNF879B4DU55 AC068594.1-202ENST00000581657 749 ntTSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
ZNF879B4DU55 SLC25A6P4-201ENST00000586535 553 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
ZNF879B4DU55 UBR2-201ENST00000372899 7857 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
ZNF879B4DU55 UBR2-202ENST00000372901 7857 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
ZNF879B4DU55 PTPRO-201ENST00000281171 5301 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
ZNF879B4DU55 PRAL-201ENST00000624952 3286 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
ZNF879B4DU55 KRAS-202ENST00000311936 5765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
ZNF879B4DU55 AJ239322.1-201ENST00000419362 2209 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
ZNF879B4DU55 CYP4F11-203ENST00000402119 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
ZNF879B4DU55 GINS2-201ENST00000253462 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
ZNF879B4DU55 SLC41A1-201ENST00000367137 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
ZNF879B4DU55 DACT3-203ENST00000410105 3085 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
ZNF879B4DU55 TET2-207ENST00000513237 10166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
ZNF879B4DU55 TET2-209ENST00000540549 10166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
ZNF879B4DU55 NDUFV1-201ENST00000322776 1596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
ZNF879B4DU55 AC119396.1-201ENST00000576789 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
ZNF879B4DU55 AC010642.2-201ENST00000634676 2413 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
ZNF879B4DU55 ELFN1-202ENST00000561626 3742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
ZNF879B4DU55 PLAGL1-206ENST00000416623 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
ZNF879B4DU55 MPL-201ENST00000372470 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
ZNF879B4DU55 RPRD1A-209ENST00000590898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
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ZNF879B4DU55 STAP2-201ENST00000594605 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
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ZNF879B4DU55 TSPAN5-201ENST00000305798 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
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ZNF879B4DU55 CXCL14-202ENST00000512158 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
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ZNF879B4DU55 SYT13-201ENST00000020926 5144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
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ZNF879B4DU55 AK2-210ENST00000548033 936 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
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ZNF879B4DU55 AL773604.1-201ENST00000617417 272 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
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ZNF879B4DU55 TCF25-201ENST00000263346 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
ZNF879B4DU55 SLIT1-201ENST00000266058 7925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
ZNF879B4DU55 SNX19-201ENST00000265909 6535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
ZNF879B4DU55 SLC29A1-206ENST00000371755 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
ZNF879B4DU55 MMP2-201ENST00000219070 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
ZNF879B4DU55 GAS2L2-201ENST00000604063 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
ZNF879B4DU55 AC069224.1-201ENST00000566372 1715 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
ZNF879B4DU55 PDGFA-203ENST00000402802 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
ZNF879B4DU55 CTDSP1-201ENST00000273062 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
ZNF879B4DU55 TAP2-201ENST00000374897 5684 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
ZNF879B4DU55 LETM2-201ENST00000297720 1693 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
ZNF879B4DU55 ARHGEF7-204ENST00000375736 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
ZNF879B4DU55 PHF23-202ENST00000454255 1662 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
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