Protein–RNA interactions for Protein: A2VCL2

CCDC162P, Coiled-coil domain-containing protein 162, humanhuman

Predictions only

Length 907 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC162PA2VCL2 AP000894.3-201ENST00000582554 351 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CCDC162PA2VCL2 FXYD1-208ENST00000589209 428 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CCDC162PA2VCL2 RPL27-206ENST00000589913 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CCDC162PA2VCL2 NKG7-205ENST00000600427 520 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CCDC162PA2VCL2 AL365330.1-201ENST00000607459 531 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
CCDC162PA2VCL2 AC004832.1-201ENST00000610936 1005 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CCDC162PA2VCL2 FXYD1-211ENST00000612146 690 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CCDC162PA2VCL2 GUCD1-203ENST00000404664 1606 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CCDC162PA2VCL2 WDR45-201ENST00000322995 1444 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CCDC162PA2VCL2 COQ10A-202ENST00000433805 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CCDC162PA2VCL2 ZMYND12-201ENST00000372565 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CCDC162PA2VCL2 TSPEAR-202ENST00000397916 2114 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CCDC162PA2VCL2 TRPC3-202ENST00000379645 3548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CCDC162PA2VCL2 LTBR-201ENST00000228918 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CCDC162PA2VCL2 MARK3-204ENST00000416682 2969 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CCDC162PA2VCL2 FGD4-212ENST00000534526 2977 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CCDC162PA2VCL2 COL26A1-203ENST00000613501 2970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CCDC162PA2VCL2 AC012485.3-201ENST00000637634 2424 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CCDC162PA2VCL2 NDRG2-211ENST00000397858 2054 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CCDC162PA2VCL2 IKZF4-206ENST00000547791 1712 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CCDC162PA2VCL2 MEX3C-204ENST00000616921 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CCDC162PA2VCL2 ZNF574-202ENST00000359044 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CCDC162PA2VCL2 CD300LG-204ENST00000539718 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CCDC162PA2VCL2 MAP4K1-203ENST00000586296 1363 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CCDC162PA2VCL2 SLC34A1-201ENST00000324417 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CCDC162PA2VCL2 CDKN2AIP-203ENST00000504169 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CCDC162PA2VCL2 FDX1-201ENST00000260270 3206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CCDC162PA2VCL2 FBLIM1-201ENST00000332305 1530 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CCDC162PA2VCL2 SIRT6-203ENST00000594279 1507 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CCDC162PA2VCL2 HDAC11-214ENST00000446613 2875 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CCDC162PA2VCL2 PDE4C-202ENST00000355502 5979 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CCDC162PA2VCL2 GTF2H2C-201ENST00000380729 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CCDC162PA2VCL2 AC112504.1-201ENST00000623415 1841 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
CCDC162PA2VCL2 AL121845.3-201ENST00000490623 3119 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CCDC162PA2VCL2 RTN1-209ENST00000611068 2647 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CCDC162PA2VCL2 PDLIM1-201ENST00000329399 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CCDC162PA2VCL2 IGSF11-209ENST00000491903 1487 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CCDC162PA2VCL2 TMEM86B-201ENST00000327042 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CCDC162PA2VCL2 COQ8B-202ENST00000324464 2443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CCDC162PA2VCL2 SERAC1-201ENST00000367101 1907 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CCDC162PA2VCL2 SNAP47-213ENST00000617596 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CCDC162PA2VCL2 KIFC1-211ENST00000428849 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CCDC162PA2VCL2 QRICH1-202ENST00000395443 3549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CCDC162PA2VCL2 ZC3H7B-201ENST00000352645 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CCDC162PA2VCL2 PPP1R27-201ENST00000330261 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CCDC162PA2VCL2 ROMO1-201ENST00000336695 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CCDC162PA2VCL2 GPRC5C-201ENST00000342648 1273 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CCDC162PA2VCL2 HIST1H4J-201ENST00000355057 373 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CCDC162PA2VCL2 HRAS-204ENST00000417302 1233 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CCDC162PA2VCL2 COX10-202ENST00000429152 875 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CCDC162PA2VCL2 HRAS-205ENST00000451590 1151 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CCDC162PA2VCL2 AP001471.1-201ENST00000454245 672 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CCDC162PA2VCL2 AC098859.1-201ENST00000502915 1238 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
CCDC162PA2VCL2 AC027117.2-201ENST00000522768 510 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CCDC162PA2VCL2 AP000275.2-202ENST00000553001 929 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CCDC162PA2VCL2 RNF34-208ENST00000555076 593 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CCDC162PA2VCL2 LINC01225-203ENST00000563550 1244 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
CCDC162PA2VCL2 TWSG1-202ENST00000581641 1119 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CCDC162PA2VCL2 AC008761.1-201ENST00000595363 217 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CCDC162PA2VCL2 SPTSSB-204ENST00000617024 1292 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
CCDC162PA2VCL2 HOTTIP_1.1-201ENST00000620415 57 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
CCDC162PA2VCL2 AC254562.3-201ENST00000626627 631 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CCDC162PA2VCL2 MAPK14-201ENST00000229794 3779 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CCDC162PA2VCL2 RAI1-207ENST00000640861 5172 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CCDC162PA2VCL2 CAAP1-201ENST00000333916 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CCDC162PA2VCL2 SURF4-209ENST00000618229 3200 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CCDC162PA2VCL2 PDE8B-201ENST00000264917 5956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CCDC162PA2VCL2 LINC02381-201ENST00000508564 1369 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CCDC162PA2VCL2 PHKG2-201ENST00000328273 1536 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CCDC162PA2VCL2 WDR70-202ENST00000504564 1526 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CCDC162PA2VCL2 TNFSF8-203ENST00000618336 1523 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CCDC162PA2VCL2 CLDND1-222ENST00000510545 2124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CCDC162PA2VCL2 CNP-201ENST00000393888 2583 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CCDC162PA2VCL2 EFEMP1-202ENST00000394555 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CCDC162PA2VCL2 PRICKLE1-211ENST00000639566 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CCDC162PA2VCL2 TTBK2-208ENST00000622375 6891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CCDC162PA2VCL2 F11R-206ENST00000621309 4770 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CCDC162PA2VCL2 NSMF-205ENST00000371474 3571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CCDC162PA2VCL2 NSMF-208ENST00000437259 3577 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CCDC162PA2VCL2 POR-218ENST00000461988 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CCDC162PA2VCL2 UNG-201ENST00000242576 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CCDC162PA2VCL2 ELL2P1-201ENST00000413990 1906 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
CCDC162PA2VCL2 C1QTNF1-208ENST00000580474 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CCDC162PA2VCL2 PRR19-204ENST00000598490 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CCDC162PA2VCL2 UAP1L1-202ENST00000409858 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CCDC162PA2VCL2 PRKD2-216ENST00000601806 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CCDC162PA2VCL2 EPS8-201ENST00000281172 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CCDC162PA2VCL2 GPS1-208ENST00000578552 1874 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CCDC162PA2VCL2 IL1RN-202ENST00000354115 1747 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CCDC162PA2VCL2 NFIC-203ENST00000443272 1716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CCDC162PA2VCL2 FEN1-201ENST00000305885 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CCDC162PA2VCL2 GALNT16-202ENST00000448469 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CCDC162PA2VCL2 GPX7-201ENST00000361314 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CCDC162PA2VCL2 JMJD7-203ENST00000408047 1192 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CCDC162PA2VCL2 AC142381.1-201ENST00000426099 345 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
CCDC162PA2VCL2 TTC28-AS1-213ENST00000434221 972 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CCDC162PA2VCL2 DNAJB3-201ENST00000446806 729 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
CCDC162PA2VCL2 MRPL20-203ENST00000482352 1049 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CCDC162PA2VCL2 SEC24B-AS1-203ENST00000505895 800 ntTSL 4 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CCDC162PA2VCL2 ASXL1-206ENST00000542461 1068 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45 ms