Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y6J3

SMAD5-AS1, SMAD5 antisense gene protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 95 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMAD5-AS1Q9Y6J3 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SMAD5-AS1Q9Y6J3 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SMAD5-AS1Q9Y6J3 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SMAD5-AS1Q9Y6J3 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SMAD5-AS1Q9Y6J3 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SMAD5-AS1Q9Y6J3 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SMAD5-AS1Q9Y6J3 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SMAD5-AS1Q9Y6J3 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SMAD5-AS1Q9Y6J3 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SMAD5-AS1Q9Y6J3 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SMAD5-AS1Q9Y6J3 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SMAD5-AS1Q9Y6J3 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SMAD5-AS1Q9Y6J3 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SMAD5-AS1Q9Y6J3 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SMAD5-AS1Q9Y6J3 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SMAD5-AS1Q9Y6J3 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SMAD5-AS1Q9Y6J3 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SMAD5-AS1Q9Y6J3 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SMAD5-AS1Q9Y6J3 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SMAD5-AS1Q9Y6J3 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SMAD5-AS1Q9Y6J3 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SMAD5-AS1Q9Y6J3 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SMAD5-AS1Q9Y6J3 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SMAD5-AS1Q9Y6J3 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SMAD5-AS1Q9Y6J3 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SMAD5-AS1Q9Y6J3 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SMAD5-AS1Q9Y6J3 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SMAD5-AS1Q9Y6J3 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SMAD5-AS1Q9Y6J3 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SMAD5-AS1Q9Y6J3 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SMAD5-AS1Q9Y6J3 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SMAD5-AS1Q9Y6J3 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SMAD5-AS1Q9Y6J3 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SMAD5-AS1Q9Y6J3 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SMAD5-AS1Q9Y6J3 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SMAD5-AS1Q9Y6J3 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SMAD5-AS1Q9Y6J3 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
SMAD5-AS1Q9Y6J3 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SMAD5-AS1Q9Y6J3 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SMAD5-AS1Q9Y6J3 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SMAD5-AS1Q9Y6J3 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SMAD5-AS1Q9Y6J3 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SMAD5-AS1Q9Y6J3 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SMAD5-AS1Q9Y6J3 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SMAD5-AS1Q9Y6J3 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SMAD5-AS1Q9Y6J3 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SMAD5-AS1Q9Y6J3 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SMAD5-AS1Q9Y6J3 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SMAD5-AS1Q9Y6J3 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SMAD5-AS1Q9Y6J3 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SMAD5-AS1Q9Y6J3 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SMAD5-AS1Q9Y6J3 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SMAD5-AS1Q9Y6J3 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SMAD5-AS1Q9Y6J3 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SMAD5-AS1Q9Y6J3 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
SMAD5-AS1Q9Y6J3 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SMAD5-AS1Q9Y6J3 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SMAD5-AS1Q9Y6J3 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SMAD5-AS1Q9Y6J3 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SMAD5-AS1Q9Y6J3 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SMAD5-AS1Q9Y6J3 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SMAD5-AS1Q9Y6J3 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SMAD5-AS1Q9Y6J3 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SMAD5-AS1Q9Y6J3 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SMAD5-AS1Q9Y6J3 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
SMAD5-AS1Q9Y6J3 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SMAD5-AS1Q9Y6J3 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SMAD5-AS1Q9Y6J3 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SMAD5-AS1Q9Y6J3 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SMAD5-AS1Q9Y6J3 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SMAD5-AS1Q9Y6J3 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SMAD5-AS1Q9Y6J3 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SMAD5-AS1Q9Y6J3 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SMAD5-AS1Q9Y6J3 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SMAD5-AS1Q9Y6J3 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SMAD5-AS1Q9Y6J3 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SMAD5-AS1Q9Y6J3 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SMAD5-AS1Q9Y6J3 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SMAD5-AS1Q9Y6J3 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SMAD5-AS1Q9Y6J3 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
SMAD5-AS1Q9Y6J3 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SMAD5-AS1Q9Y6J3 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SMAD5-AS1Q9Y6J3 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SMAD5-AS1Q9Y6J3 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SMAD5-AS1Q9Y6J3 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
SMAD5-AS1Q9Y6J3 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SMAD5-AS1Q9Y6J3 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SMAD5-AS1Q9Y6J3 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
SMAD5-AS1Q9Y6J3 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
SMAD5-AS1Q9Y6J3 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
SMAD5-AS1Q9Y6J3 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
SMAD5-AS1Q9Y6J3 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SMAD5-AS1Q9Y6J3 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
SMAD5-AS1Q9Y6J3 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SMAD5-AS1Q9Y6J3 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SMAD5-AS1Q9Y6J3 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SMAD5-AS1Q9Y6J3 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
SMAD5-AS1Q9Y6J3 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC18.14■□□□□ 0.49
SMAD5-AS1Q9Y6J3 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
SMAD5-AS1Q9Y6J3 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.1 ms