Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y6G9

DYNC1LI1, Cytoplasmic dynein 1 light intermediate chain 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 523 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DYNC1LI1Q9Y6G9 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
DYNC1LI1Q9Y6G9 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
DYNC1LI1Q9Y6G9 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
DYNC1LI1Q9Y6G9 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
DYNC1LI1Q9Y6G9 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
DYNC1LI1Q9Y6G9 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
DYNC1LI1Q9Y6G9 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
DYNC1LI1Q9Y6G9 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
DYNC1LI1Q9Y6G9 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
DYNC1LI1Q9Y6G9 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
DYNC1LI1Q9Y6G9 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
DYNC1LI1Q9Y6G9 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
DYNC1LI1Q9Y6G9 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
DYNC1LI1Q9Y6G9 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
DYNC1LI1Q9Y6G9 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
DYNC1LI1Q9Y6G9 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
DYNC1LI1Q9Y6G9 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
DYNC1LI1Q9Y6G9 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
DYNC1LI1Q9Y6G9 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
DYNC1LI1Q9Y6G9 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
DYNC1LI1Q9Y6G9 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
DYNC1LI1Q9Y6G9 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
DYNC1LI1Q9Y6G9 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
DYNC1LI1Q9Y6G9 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
DYNC1LI1Q9Y6G9 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
DYNC1LI1Q9Y6G9 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
DYNC1LI1Q9Y6G9 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
DYNC1LI1Q9Y6G9 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
DYNC1LI1Q9Y6G9 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
DYNC1LI1Q9Y6G9 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
DYNC1LI1Q9Y6G9 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
DYNC1LI1Q9Y6G9 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
DYNC1LI1Q9Y6G9 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
DYNC1LI1Q9Y6G9 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
DYNC1LI1Q9Y6G9 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
DYNC1LI1Q9Y6G9 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
DYNC1LI1Q9Y6G9 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
DYNC1LI1Q9Y6G9 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
DYNC1LI1Q9Y6G9 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
DYNC1LI1Q9Y6G9 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
DYNC1LI1Q9Y6G9 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
DYNC1LI1Q9Y6G9 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
DYNC1LI1Q9Y6G9 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
DYNC1LI1Q9Y6G9 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
DYNC1LI1Q9Y6G9 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.53
DYNC1LI1Q9Y6G9 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
DYNC1LI1Q9Y6G9 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
DYNC1LI1Q9Y6G9 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
DYNC1LI1Q9Y6G9 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
DYNC1LI1Q9Y6G9 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
DYNC1LI1Q9Y6G9 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
DYNC1LI1Q9Y6G9 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
DYNC1LI1Q9Y6G9 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
DYNC1LI1Q9Y6G9 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
DYNC1LI1Q9Y6G9 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
DYNC1LI1Q9Y6G9 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
DYNC1LI1Q9Y6G9 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
DYNC1LI1Q9Y6G9 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
DYNC1LI1Q9Y6G9 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
DYNC1LI1Q9Y6G9 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
DYNC1LI1Q9Y6G9 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
DYNC1LI1Q9Y6G9 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
DYNC1LI1Q9Y6G9 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
DYNC1LI1Q9Y6G9 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
DYNC1LI1Q9Y6G9 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
DYNC1LI1Q9Y6G9 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
DYNC1LI1Q9Y6G9 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
DYNC1LI1Q9Y6G9 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
DYNC1LI1Q9Y6G9 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
DYNC1LI1Q9Y6G9 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
DYNC1LI1Q9Y6G9 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
DYNC1LI1Q9Y6G9 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
DYNC1LI1Q9Y6G9 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
DYNC1LI1Q9Y6G9 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
DYNC1LI1Q9Y6G9 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
DYNC1LI1Q9Y6G9 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
DYNC1LI1Q9Y6G9 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
DYNC1LI1Q9Y6G9 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
DYNC1LI1Q9Y6G9 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
DYNC1LI1Q9Y6G9 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.52
DYNC1LI1Q9Y6G9 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
DYNC1LI1Q9Y6G9 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC24.57■■□□□ 1.52
DYNC1LI1Q9Y6G9 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
DYNC1LI1Q9Y6G9 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
DYNC1LI1Q9Y6G9 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
DYNC1LI1Q9Y6G9 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
DYNC1LI1Q9Y6G9 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
DYNC1LI1Q9Y6G9 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
DYNC1LI1Q9Y6G9 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
DYNC1LI1Q9Y6G9 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
DYNC1LI1Q9Y6G9 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
DYNC1LI1Q9Y6G9 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
DYNC1LI1Q9Y6G9 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
DYNC1LI1Q9Y6G9 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
DYNC1LI1Q9Y6G9 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
DYNC1LI1Q9Y6G9 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
DYNC1LI1Q9Y6G9 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC24.56■■□□□ 1.52
DYNC1LI1Q9Y6G9 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
DYNC1LI1Q9Y6G9 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
DYNC1LI1Q9Y6G9 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16 ms