Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y646

CPQ, Carboxypeptidase Q, humanhuman

Predictions only

Length 472 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CPQQ9Y646 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CPQQ9Y646 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
CPQQ9Y646 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
CPQQ9Y646 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
CPQQ9Y646 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CPQQ9Y646 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
CPQQ9Y646 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CPQQ9Y646 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CPQQ9Y646 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CPQQ9Y646 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CPQQ9Y646 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CPQQ9Y646 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
CPQQ9Y646 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CPQQ9Y646 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CPQQ9Y646 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CPQQ9Y646 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CPQQ9Y646 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
CPQQ9Y646 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CPQQ9Y646 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CPQQ9Y646 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CPQQ9Y646 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CPQQ9Y646 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CPQQ9Y646 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CPQQ9Y646 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
CPQQ9Y646 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CPQQ9Y646 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CPQQ9Y646 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CPQQ9Y646 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CPQQ9Y646 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CPQQ9Y646 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CPQQ9Y646 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CPQQ9Y646 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CPQQ9Y646 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CPQQ9Y646 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
CPQQ9Y646 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CPQQ9Y646 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
CPQQ9Y646 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CPQQ9Y646 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CPQQ9Y646 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
CPQQ9Y646 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
CPQQ9Y646 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CPQQ9Y646 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CPQQ9Y646 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CPQQ9Y646 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
CPQQ9Y646 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CPQQ9Y646 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CPQQ9Y646 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CPQQ9Y646 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CPQQ9Y646 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CPQQ9Y646 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CPQQ9Y646 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CPQQ9Y646 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CPQQ9Y646 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CPQQ9Y646 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CPQQ9Y646 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CPQQ9Y646 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CPQQ9Y646 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
CPQQ9Y646 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CPQQ9Y646 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CPQQ9Y646 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CPQQ9Y646 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CPQQ9Y646 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CPQQ9Y646 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CPQQ9Y646 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
CPQQ9Y646 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
CPQQ9Y646 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CPQQ9Y646 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CPQQ9Y646 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CPQQ9Y646 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CPQQ9Y646 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CPQQ9Y646 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CPQQ9Y646 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CPQQ9Y646 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CPQQ9Y646 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CPQQ9Y646 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CPQQ9Y646 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CPQQ9Y646 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CPQQ9Y646 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CPQQ9Y646 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CPQQ9Y646 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CPQQ9Y646 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CPQQ9Y646 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CPQQ9Y646 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CPQQ9Y646 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CPQQ9Y646 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CPQQ9Y646 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CPQQ9Y646 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CPQQ9Y646 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CPQQ9Y646 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CPQQ9Y646 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CPQQ9Y646 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CPQQ9Y646 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CPQQ9Y646 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CPQQ9Y646 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
CPQQ9Y646 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CPQQ9Y646 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CPQQ9Y646 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CPQQ9Y646 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CPQQ9Y646 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CPQQ9Y646 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.4 ms