Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5E7

PCDHB2, Protocadherin beta-2, humanhuman

Predictions only

Length 798 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCDHB2Q9Y5E7 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC25.93■■□□□ 1.74
PCDHB2Q9Y5E7 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
PCDHB2Q9Y5E7 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
PCDHB2Q9Y5E7 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC25.92■■□□□ 1.74
PCDHB2Q9Y5E7 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
PCDHB2Q9Y5E7 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
PCDHB2Q9Y5E7 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
PCDHB2Q9Y5E7 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
PCDHB2Q9Y5E7 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC25.92■■□□□ 1.74
PCDHB2Q9Y5E7 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
PCDHB2Q9Y5E7 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
PCDHB2Q9Y5E7 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
PCDHB2Q9Y5E7 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
PCDHB2Q9Y5E7 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
PCDHB2Q9Y5E7 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
PCDHB2Q9Y5E7 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
PCDHB2Q9Y5E7 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
PCDHB2Q9Y5E7 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC25.9■■□□□ 1.74
PCDHB2Q9Y5E7 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.9■■□□□ 1.74
PCDHB2Q9Y5E7 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
PCDHB2Q9Y5E7 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
PCDHB2Q9Y5E7 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC25.89■■□□□ 1.74
PCDHB2Q9Y5E7 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
PCDHB2Q9Y5E7 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
PCDHB2Q9Y5E7 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
PCDHB2Q9Y5E7 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
PCDHB2Q9Y5E7 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
PCDHB2Q9Y5E7 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
PCDHB2Q9Y5E7 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
PCDHB2Q9Y5E7 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
PCDHB2Q9Y5E7 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
PCDHB2Q9Y5E7 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
PCDHB2Q9Y5E7 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
PCDHB2Q9Y5E7 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
PCDHB2Q9Y5E7 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
PCDHB2Q9Y5E7 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
PCDHB2Q9Y5E7 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
PCDHB2Q9Y5E7 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
PCDHB2Q9Y5E7 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
PCDHB2Q9Y5E7 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
PCDHB2Q9Y5E7 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
PCDHB2Q9Y5E7 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
PCDHB2Q9Y5E7 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
PCDHB2Q9Y5E7 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
PCDHB2Q9Y5E7 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
PCDHB2Q9Y5E7 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
PCDHB2Q9Y5E7 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
PCDHB2Q9Y5E7 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
PCDHB2Q9Y5E7 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
PCDHB2Q9Y5E7 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
PCDHB2Q9Y5E7 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
PCDHB2Q9Y5E7 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
PCDHB2Q9Y5E7 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
PCDHB2Q9Y5E7 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
PCDHB2Q9Y5E7 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
PCDHB2Q9Y5E7 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
PCDHB2Q9Y5E7 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
PCDHB2Q9Y5E7 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
PCDHB2Q9Y5E7 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
PCDHB2Q9Y5E7 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
PCDHB2Q9Y5E7 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
PCDHB2Q9Y5E7 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
PCDHB2Q9Y5E7 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
PCDHB2Q9Y5E7 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
PCDHB2Q9Y5E7 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
PCDHB2Q9Y5E7 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
PCDHB2Q9Y5E7 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
PCDHB2Q9Y5E7 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
PCDHB2Q9Y5E7 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC25.83■■□□□ 1.73
PCDHB2Q9Y5E7 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
PCDHB2Q9Y5E7 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
PCDHB2Q9Y5E7 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
PCDHB2Q9Y5E7 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
PCDHB2Q9Y5E7 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
PCDHB2Q9Y5E7 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
PCDHB2Q9Y5E7 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
PCDHB2Q9Y5E7 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
PCDHB2Q9Y5E7 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
PCDHB2Q9Y5E7 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
PCDHB2Q9Y5E7 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
PCDHB2Q9Y5E7 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
PCDHB2Q9Y5E7 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
PCDHB2Q9Y5E7 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
PCDHB2Q9Y5E7 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
PCDHB2Q9Y5E7 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
PCDHB2Q9Y5E7 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
PCDHB2Q9Y5E7 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
PCDHB2Q9Y5E7 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
PCDHB2Q9Y5E7 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
PCDHB2Q9Y5E7 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
PCDHB2Q9Y5E7 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
PCDHB2Q9Y5E7 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
PCDHB2Q9Y5E7 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
PCDHB2Q9Y5E7 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
PCDHB2Q9Y5E7 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
PCDHB2Q9Y5E7 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
PCDHB2Q9Y5E7 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
PCDHB2Q9Y5E7 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
PCDHB2Q9Y5E7 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC25.78■■□□□ 1.72
PCDHB2Q9Y5E7 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.9 ms