Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y4R7

TTLL3, Tubulin monoglycylase TTLL3, humanhuman

Predictions only

Length 772 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTLL3Q9Y4R7 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
TTLL3Q9Y4R7 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
TTLL3Q9Y4R7 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
TTLL3Q9Y4R7 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
TTLL3Q9Y4R7 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
TTLL3Q9Y4R7 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
TTLL3Q9Y4R7 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
TTLL3Q9Y4R7 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
TTLL3Q9Y4R7 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
TTLL3Q9Y4R7 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
TTLL3Q9Y4R7 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
TTLL3Q9Y4R7 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
TTLL3Q9Y4R7 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
TTLL3Q9Y4R7 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
TTLL3Q9Y4R7 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
TTLL3Q9Y4R7 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
TTLL3Q9Y4R7 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
TTLL3Q9Y4R7 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
TTLL3Q9Y4R7 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
TTLL3Q9Y4R7 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
TTLL3Q9Y4R7 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
TTLL3Q9Y4R7 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
TTLL3Q9Y4R7 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
TTLL3Q9Y4R7 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
TTLL3Q9Y4R7 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
TTLL3Q9Y4R7 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
TTLL3Q9Y4R7 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
TTLL3Q9Y4R7 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
TTLL3Q9Y4R7 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
TTLL3Q9Y4R7 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
TTLL3Q9Y4R7 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
TTLL3Q9Y4R7 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
TTLL3Q9Y4R7 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
TTLL3Q9Y4R7 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
TTLL3Q9Y4R7 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
TTLL3Q9Y4R7 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
TTLL3Q9Y4R7 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
TTLL3Q9Y4R7 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
TTLL3Q9Y4R7 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
TTLL3Q9Y4R7 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
TTLL3Q9Y4R7 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
TTLL3Q9Y4R7 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
TTLL3Q9Y4R7 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
TTLL3Q9Y4R7 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
TTLL3Q9Y4R7 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
TTLL3Q9Y4R7 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
TTLL3Q9Y4R7 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
TTLL3Q9Y4R7 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
TTLL3Q9Y4R7 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
TTLL3Q9Y4R7 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
TTLL3Q9Y4R7 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
TTLL3Q9Y4R7 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
TTLL3Q9Y4R7 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
TTLL3Q9Y4R7 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
TTLL3Q9Y4R7 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
TTLL3Q9Y4R7 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
TTLL3Q9Y4R7 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
TTLL3Q9Y4R7 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
TTLL3Q9Y4R7 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
TTLL3Q9Y4R7 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
TTLL3Q9Y4R7 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
TTLL3Q9Y4R7 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
TTLL3Q9Y4R7 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.47
TTLL3Q9Y4R7 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
TTLL3Q9Y4R7 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
TTLL3Q9Y4R7 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
TTLL3Q9Y4R7 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
TTLL3Q9Y4R7 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
TTLL3Q9Y4R7 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
TTLL3Q9Y4R7 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
TTLL3Q9Y4R7 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
TTLL3Q9Y4R7 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
TTLL3Q9Y4R7 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
TTLL3Q9Y4R7 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC24.18■■□□□ 1.46
TTLL3Q9Y4R7 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
TTLL3Q9Y4R7 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
TTLL3Q9Y4R7 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
TTLL3Q9Y4R7 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
TTLL3Q9Y4R7 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
TTLL3Q9Y4R7 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
TTLL3Q9Y4R7 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
TTLL3Q9Y4R7 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
TTLL3Q9Y4R7 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
TTLL3Q9Y4R7 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
TTLL3Q9Y4R7 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
TTLL3Q9Y4R7 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
TTLL3Q9Y4R7 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
TTLL3Q9Y4R7 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
TTLL3Q9Y4R7 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
TTLL3Q9Y4R7 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
TTLL3Q9Y4R7 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
TTLL3Q9Y4R7 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
TTLL3Q9Y4R7 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
TTLL3Q9Y4R7 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
TTLL3Q9Y4R7 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
TTLL3Q9Y4R7 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
TTLL3Q9Y4R7 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
TTLL3Q9Y4R7 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
TTLL3Q9Y4R7 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
TTLL3Q9Y4R7 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.7 ms