Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y4E8

USP15, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 15, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 981 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP15Q9Y4E8 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
USP15Q9Y4E8 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
USP15Q9Y4E8 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
USP15Q9Y4E8 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
USP15Q9Y4E8 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
USP15Q9Y4E8 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
USP15Q9Y4E8 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
USP15Q9Y4E8 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
USP15Q9Y4E8 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
USP15Q9Y4E8 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
USP15Q9Y4E8 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
USP15Q9Y4E8 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.65
USP15Q9Y4E8 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
USP15Q9Y4E8 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
USP15Q9Y4E8 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
USP15Q9Y4E8 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
USP15Q9Y4E8 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
USP15Q9Y4E8 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
USP15Q9Y4E8 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
USP15Q9Y4E8 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
USP15Q9Y4E8 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
USP15Q9Y4E8 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
USP15Q9Y4E8 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC25.37■■□□□ 1.65
USP15Q9Y4E8 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
USP15Q9Y4E8 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
USP15Q9Y4E8 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
USP15Q9Y4E8 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC25.36■■□□□ 1.65
USP15Q9Y4E8 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
USP15Q9Y4E8 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC25.36■■□□□ 1.65
USP15Q9Y4E8 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
USP15Q9Y4E8 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
USP15Q9Y4E8 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
USP15Q9Y4E8 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
USP15Q9Y4E8 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
USP15Q9Y4E8 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
USP15Q9Y4E8 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC25.35■■□□□ 1.65
USP15Q9Y4E8 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC25.35■■□□□ 1.65
USP15Q9Y4E8 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
USP15Q9Y4E8 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
USP15Q9Y4E8 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC25.34■■□□□ 1.65
USP15Q9Y4E8 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
USP15Q9Y4E8 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
USP15Q9Y4E8 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
USP15Q9Y4E8 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC25.34■■□□□ 1.65
USP15Q9Y4E8 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
USP15Q9Y4E8 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC25.33■■□□□ 1.65
USP15Q9Y4E8 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
USP15Q9Y4E8 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.64
USP15Q9Y4E8 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
USP15Q9Y4E8 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
USP15Q9Y4E8 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
USP15Q9Y4E8 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
USP15Q9Y4E8 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
USP15Q9Y4E8 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
USP15Q9Y4E8 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
USP15Q9Y4E8 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC25.31■■□□□ 1.64
USP15Q9Y4E8 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
USP15Q9Y4E8 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
USP15Q9Y4E8 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
USP15Q9Y4E8 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
USP15Q9Y4E8 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
USP15Q9Y4E8 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
USP15Q9Y4E8 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
USP15Q9Y4E8 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
USP15Q9Y4E8 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
USP15Q9Y4E8 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
USP15Q9Y4E8 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
USP15Q9Y4E8 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
USP15Q9Y4E8 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
USP15Q9Y4E8 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
USP15Q9Y4E8 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
USP15Q9Y4E8 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
USP15Q9Y4E8 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
USP15Q9Y4E8 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
USP15Q9Y4E8 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
USP15Q9Y4E8 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
USP15Q9Y4E8 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC25.28■■□□□ 1.64
USP15Q9Y4E8 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
USP15Q9Y4E8 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
USP15Q9Y4E8 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
USP15Q9Y4E8 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
USP15Q9Y4E8 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
USP15Q9Y4E8 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
USP15Q9Y4E8 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
USP15Q9Y4E8 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
USP15Q9Y4E8 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
USP15Q9Y4E8 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
USP15Q9Y4E8 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
USP15Q9Y4E8 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
USP15Q9Y4E8 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
USP15Q9Y4E8 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
USP15Q9Y4E8 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
USP15Q9Y4E8 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
USP15Q9Y4E8 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
USP15Q9Y4E8 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
USP15Q9Y4E8 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
USP15Q9Y4E8 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
USP15Q9Y4E8 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
USP15Q9Y4E8 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
USP15Q9Y4E8 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
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