Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3Q4

HCN4, Potassium/sodium hyperpolarization-activated cyclic nucleotide-gated channel 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,203 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HCN4Q9Y3Q4 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
HCN4Q9Y3Q4 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
HCN4Q9Y3Q4 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
HCN4Q9Y3Q4 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
HCN4Q9Y3Q4 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
HCN4Q9Y3Q4 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
HCN4Q9Y3Q4 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
HCN4Q9Y3Q4 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
HCN4Q9Y3Q4 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
HCN4Q9Y3Q4 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
HCN4Q9Y3Q4 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
HCN4Q9Y3Q4 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
HCN4Q9Y3Q4 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
HCN4Q9Y3Q4 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
HCN4Q9Y3Q4 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
HCN4Q9Y3Q4 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
HCN4Q9Y3Q4 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
HCN4Q9Y3Q4 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC24.32■■□□□ 1.48
HCN4Q9Y3Q4 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
HCN4Q9Y3Q4 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
HCN4Q9Y3Q4 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
HCN4Q9Y3Q4 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
HCN4Q9Y3Q4 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
HCN4Q9Y3Q4 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
HCN4Q9Y3Q4 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
HCN4Q9Y3Q4 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
HCN4Q9Y3Q4 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
HCN4Q9Y3Q4 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
HCN4Q9Y3Q4 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
HCN4Q9Y3Q4 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
HCN4Q9Y3Q4 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
HCN4Q9Y3Q4 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
HCN4Q9Y3Q4 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
HCN4Q9Y3Q4 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
HCN4Q9Y3Q4 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
HCN4Q9Y3Q4 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
HCN4Q9Y3Q4 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
HCN4Q9Y3Q4 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
HCN4Q9Y3Q4 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
HCN4Q9Y3Q4 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
HCN4Q9Y3Q4 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
HCN4Q9Y3Q4 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
HCN4Q9Y3Q4 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
HCN4Q9Y3Q4 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
HCN4Q9Y3Q4 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
HCN4Q9Y3Q4 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
HCN4Q9Y3Q4 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
HCN4Q9Y3Q4 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
HCN4Q9Y3Q4 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
HCN4Q9Y3Q4 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
HCN4Q9Y3Q4 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
HCN4Q9Y3Q4 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
HCN4Q9Y3Q4 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
HCN4Q9Y3Q4 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
HCN4Q9Y3Q4 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
HCN4Q9Y3Q4 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
HCN4Q9Y3Q4 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC24.27■■□□□ 1.48
HCN4Q9Y3Q4 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
HCN4Q9Y3Q4 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
HCN4Q9Y3Q4 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
HCN4Q9Y3Q4 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
HCN4Q9Y3Q4 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
HCN4Q9Y3Q4 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
HCN4Q9Y3Q4 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
HCN4Q9Y3Q4 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
HCN4Q9Y3Q4 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
HCN4Q9Y3Q4 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
HCN4Q9Y3Q4 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC24.26■■□□□ 1.47
HCN4Q9Y3Q4 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
HCN4Q9Y3Q4 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
HCN4Q9Y3Q4 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
HCN4Q9Y3Q4 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
HCN4Q9Y3Q4 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
HCN4Q9Y3Q4 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
HCN4Q9Y3Q4 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
HCN4Q9Y3Q4 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
HCN4Q9Y3Q4 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
HCN4Q9Y3Q4 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
HCN4Q9Y3Q4 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
HCN4Q9Y3Q4 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
HCN4Q9Y3Q4 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
HCN4Q9Y3Q4 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
HCN4Q9Y3Q4 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
HCN4Q9Y3Q4 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
HCN4Q9Y3Q4 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
HCN4Q9Y3Q4 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
HCN4Q9Y3Q4 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
HCN4Q9Y3Q4 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
HCN4Q9Y3Q4 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
HCN4Q9Y3Q4 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
HCN4Q9Y3Q4 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
HCN4Q9Y3Q4 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
HCN4Q9Y3Q4 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
HCN4Q9Y3Q4 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
HCN4Q9Y3Q4 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
HCN4Q9Y3Q4 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
HCN4Q9Y3Q4 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
HCN4Q9Y3Q4 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
HCN4Q9Y3Q4 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
HCN4Q9Y3Q4 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.7 ms