Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3L3

SH3BP1, SH3 domain-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 701 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP1Q9Y3L3 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
SH3BP1Q9Y3L3 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
SH3BP1Q9Y3L3 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
SH3BP1Q9Y3L3 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
SH3BP1Q9Y3L3 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
SH3BP1Q9Y3L3 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
SH3BP1Q9Y3L3 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
SH3BP1Q9Y3L3 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
SH3BP1Q9Y3L3 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SH3BP1Q9Y3L3 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC24.56■■□□□ 1.52
SH3BP1Q9Y3L3 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SH3BP1Q9Y3L3 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SH3BP1Q9Y3L3 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
SH3BP1Q9Y3L3 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
SH3BP1Q9Y3L3 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
SH3BP1Q9Y3L3 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
SH3BP1Q9Y3L3 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
SH3BP1Q9Y3L3 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
SH3BP1Q9Y3L3 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
SH3BP1Q9Y3L3 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
SH3BP1Q9Y3L3 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
SH3BP1Q9Y3L3 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SH3BP1Q9Y3L3 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
SH3BP1Q9Y3L3 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC24.54■■□□□ 1.52
SH3BP1Q9Y3L3 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
SH3BP1Q9Y3L3 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SH3BP1Q9Y3L3 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
SH3BP1Q9Y3L3 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SH3BP1Q9Y3L3 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
SH3BP1Q9Y3L3 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SH3BP1Q9Y3L3 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SH3BP1Q9Y3L3 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SH3BP1Q9Y3L3 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SH3BP1Q9Y3L3 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
SH3BP1Q9Y3L3 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SH3BP1Q9Y3L3 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SH3BP1Q9Y3L3 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SH3BP1Q9Y3L3 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
SH3BP1Q9Y3L3 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
SH3BP1Q9Y3L3 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
SH3BP1Q9Y3L3 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SH3BP1Q9Y3L3 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SH3BP1Q9Y3L3 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SH3BP1Q9Y3L3 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
SH3BP1Q9Y3L3 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
SH3BP1Q9Y3L3 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
SH3BP1Q9Y3L3 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
SH3BP1Q9Y3L3 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
SH3BP1Q9Y3L3 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
SH3BP1Q9Y3L3 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SH3BP1Q9Y3L3 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SH3BP1Q9Y3L3 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
SH3BP1Q9Y3L3 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SH3BP1Q9Y3L3 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SH3BP1Q9Y3L3 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
SH3BP1Q9Y3L3 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SH3BP1Q9Y3L3 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
SH3BP1Q9Y3L3 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SH3BP1Q9Y3L3 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SH3BP1Q9Y3L3 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
SH3BP1Q9Y3L3 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SH3BP1Q9Y3L3 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SH3BP1Q9Y3L3 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
SH3BP1Q9Y3L3 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
SH3BP1Q9Y3L3 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
SH3BP1Q9Y3L3 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
SH3BP1Q9Y3L3 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
SH3BP1Q9Y3L3 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SH3BP1Q9Y3L3 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
SH3BP1Q9Y3L3 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SH3BP1Q9Y3L3 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SH3BP1Q9Y3L3 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SH3BP1Q9Y3L3 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
SH3BP1Q9Y3L3 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
SH3BP1Q9Y3L3 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SH3BP1Q9Y3L3 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
SH3BP1Q9Y3L3 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
SH3BP1Q9Y3L3 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
SH3BP1Q9Y3L3 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
SH3BP1Q9Y3L3 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
SH3BP1Q9Y3L3 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
SH3BP1Q9Y3L3 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC24.48■■□□□ 1.51
SH3BP1Q9Y3L3 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
SH3BP1Q9Y3L3 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
SH3BP1Q9Y3L3 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SH3BP1Q9Y3L3 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SH3BP1Q9Y3L3 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SH3BP1Q9Y3L3 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
SH3BP1Q9Y3L3 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SH3BP1Q9Y3L3 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SH3BP1Q9Y3L3 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SH3BP1Q9Y3L3 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SH3BP1Q9Y3L3 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
SH3BP1Q9Y3L3 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
SH3BP1Q9Y3L3 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC24.46■■□□□ 1.51
SH3BP1Q9Y3L3 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
SH3BP1Q9Y3L3 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
SH3BP1Q9Y3L3 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.51
SH3BP1Q9Y3L3 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
SH3BP1Q9Y3L3 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.9 ms