Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y259

CHKB, Choline/ethanolamine kinase, humanhuman

Predictions only

Length 395 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHKBQ9Y259 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
CHKBQ9Y259 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
CHKBQ9Y259 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CHKBQ9Y259 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CHKBQ9Y259 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CHKBQ9Y259 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CHKBQ9Y259 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
CHKBQ9Y259 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CHKBQ9Y259 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
CHKBQ9Y259 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
CHKBQ9Y259 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
CHKBQ9Y259 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
CHKBQ9Y259 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
CHKBQ9Y259 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
CHKBQ9Y259 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
CHKBQ9Y259 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
CHKBQ9Y259 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
CHKBQ9Y259 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CHKBQ9Y259 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CHKBQ9Y259 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CHKBQ9Y259 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CHKBQ9Y259 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CHKBQ9Y259 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CHKBQ9Y259 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
CHKBQ9Y259 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CHKBQ9Y259 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
CHKBQ9Y259 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CHKBQ9Y259 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CHKBQ9Y259 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CHKBQ9Y259 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CHKBQ9Y259 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CHKBQ9Y259 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CHKBQ9Y259 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CHKBQ9Y259 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CHKBQ9Y259 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CHKBQ9Y259 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CHKBQ9Y259 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CHKBQ9Y259 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CHKBQ9Y259 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CHKBQ9Y259 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CHKBQ9Y259 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CHKBQ9Y259 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CHKBQ9Y259 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CHKBQ9Y259 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CHKBQ9Y259 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CHKBQ9Y259 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CHKBQ9Y259 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CHKBQ9Y259 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CHKBQ9Y259 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
CHKBQ9Y259 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CHKBQ9Y259 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CHKBQ9Y259 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CHKBQ9Y259 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CHKBQ9Y259 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CHKBQ9Y259 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CHKBQ9Y259 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
CHKBQ9Y259 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CHKBQ9Y259 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CHKBQ9Y259 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CHKBQ9Y259 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CHKBQ9Y259 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
CHKBQ9Y259 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CHKBQ9Y259 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CHKBQ9Y259 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
CHKBQ9Y259 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CHKBQ9Y259 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
CHKBQ9Y259 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.44
CHKBQ9Y259 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
CHKBQ9Y259 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CHKBQ9Y259 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CHKBQ9Y259 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
CHKBQ9Y259 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CHKBQ9Y259 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CHKBQ9Y259 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CHKBQ9Y259 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CHKBQ9Y259 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CHKBQ9Y259 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CHKBQ9Y259 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CHKBQ9Y259 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CHKBQ9Y259 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CHKBQ9Y259 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CHKBQ9Y259 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CHKBQ9Y259 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CHKBQ9Y259 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CHKBQ9Y259 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CHKBQ9Y259 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
CHKBQ9Y259 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CHKBQ9Y259 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CHKBQ9Y259 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CHKBQ9Y259 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CHKBQ9Y259 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CHKBQ9Y259 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CHKBQ9Y259 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CHKBQ9Y259 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CHKBQ9Y259 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CHKBQ9Y259 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CHKBQ9Y259 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CHKBQ9Y259 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CHKBQ9Y259 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CHKBQ9Y259 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.2 ms