Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPU5

USP24, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 24, humanhuman

Predictions only

Length 2,620 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP24Q9UPU5 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
USP24Q9UPU5 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
USP24Q9UPU5 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
USP24Q9UPU5 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
USP24Q9UPU5 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
USP24Q9UPU5 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
USP24Q9UPU5 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
USP24Q9UPU5 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
USP24Q9UPU5 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
USP24Q9UPU5 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
USP24Q9UPU5 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
USP24Q9UPU5 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
USP24Q9UPU5 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
USP24Q9UPU5 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
USP24Q9UPU5 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
USP24Q9UPU5 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
USP24Q9UPU5 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
USP24Q9UPU5 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
USP24Q9UPU5 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
USP24Q9UPU5 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
USP24Q9UPU5 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
USP24Q9UPU5 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
USP24Q9UPU5 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC22.28■■□□□ 1.16
USP24Q9UPU5 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
USP24Q9UPU5 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
USP24Q9UPU5 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
USP24Q9UPU5 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
USP24Q9UPU5 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
USP24Q9UPU5 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
USP24Q9UPU5 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC22.28■■□□□ 1.16
USP24Q9UPU5 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
USP24Q9UPU5 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
USP24Q9UPU5 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
USP24Q9UPU5 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.16
USP24Q9UPU5 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
USP24Q9UPU5 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
USP24Q9UPU5 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
USP24Q9UPU5 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
USP24Q9UPU5 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
USP24Q9UPU5 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC22.27■■□□□ 1.15
USP24Q9UPU5 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
USP24Q9UPU5 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
USP24Q9UPU5 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
USP24Q9UPU5 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
USP24Q9UPU5 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
USP24Q9UPU5 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
USP24Q9UPU5 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
USP24Q9UPU5 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
USP24Q9UPU5 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
USP24Q9UPU5 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
USP24Q9UPU5 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
USP24Q9UPU5 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
USP24Q9UPU5 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
USP24Q9UPU5 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
USP24Q9UPU5 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
USP24Q9UPU5 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
USP24Q9UPU5 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
USP24Q9UPU5 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
USP24Q9UPU5 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
USP24Q9UPU5 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
USP24Q9UPU5 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
USP24Q9UPU5 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
USP24Q9UPU5 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC22.23■■□□□ 1.15
USP24Q9UPU5 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC22.23■■□□□ 1.15
USP24Q9UPU5 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
USP24Q9UPU5 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
USP24Q9UPU5 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
USP24Q9UPU5 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC22.22■■□□□ 1.15
USP24Q9UPU5 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
USP24Q9UPU5 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
USP24Q9UPU5 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
USP24Q9UPU5 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
USP24Q9UPU5 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
USP24Q9UPU5 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
USP24Q9UPU5 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
USP24Q9UPU5 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
USP24Q9UPU5 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
USP24Q9UPU5 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
USP24Q9UPU5 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
USP24Q9UPU5 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
USP24Q9UPU5 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
USP24Q9UPU5 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
USP24Q9UPU5 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
USP24Q9UPU5 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
USP24Q9UPU5 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
USP24Q9UPU5 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
USP24Q9UPU5 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
USP24Q9UPU5 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
USP24Q9UPU5 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
USP24Q9UPU5 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
USP24Q9UPU5 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
USP24Q9UPU5 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
USP24Q9UPU5 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
USP24Q9UPU5 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
USP24Q9UPU5 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
USP24Q9UPU5 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
USP24Q9UPU5 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
USP24Q9UPU5 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
USP24Q9UPU5 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
USP24Q9UPU5 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.5 ms