Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPT9

USP22, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 22, humanhuman

Predictions only

Length 525 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP22Q9UPT9 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
USP22Q9UPT9 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
USP22Q9UPT9 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
USP22Q9UPT9 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
USP22Q9UPT9 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
USP22Q9UPT9 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
USP22Q9UPT9 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
USP22Q9UPT9 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
USP22Q9UPT9 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
USP22Q9UPT9 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
USP22Q9UPT9 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
USP22Q9UPT9 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
USP22Q9UPT9 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
USP22Q9UPT9 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
USP22Q9UPT9 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
USP22Q9UPT9 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
USP22Q9UPT9 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
USP22Q9UPT9 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
USP22Q9UPT9 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
USP22Q9UPT9 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
USP22Q9UPT9 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
USP22Q9UPT9 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
USP22Q9UPT9 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
USP22Q9UPT9 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
USP22Q9UPT9 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
USP22Q9UPT9 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.15
USP22Q9UPT9 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
USP22Q9UPT9 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
USP22Q9UPT9 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
USP22Q9UPT9 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
USP22Q9UPT9 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
USP22Q9UPT9 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
USP22Q9UPT9 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
USP22Q9UPT9 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
USP22Q9UPT9 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC22.26■■□□□ 1.15
USP22Q9UPT9 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
USP22Q9UPT9 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
USP22Q9UPT9 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
USP22Q9UPT9 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
USP22Q9UPT9 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
USP22Q9UPT9 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
USP22Q9UPT9 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
USP22Q9UPT9 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
USP22Q9UPT9 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
USP22Q9UPT9 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
USP22Q9UPT9 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
USP22Q9UPT9 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
USP22Q9UPT9 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
USP22Q9UPT9 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
USP22Q9UPT9 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
USP22Q9UPT9 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
USP22Q9UPT9 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
USP22Q9UPT9 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
USP22Q9UPT9 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
USP22Q9UPT9 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
USP22Q9UPT9 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
USP22Q9UPT9 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
USP22Q9UPT9 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
USP22Q9UPT9 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
USP22Q9UPT9 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
USP22Q9UPT9 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
USP22Q9UPT9 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
USP22Q9UPT9 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
USP22Q9UPT9 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
USP22Q9UPT9 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
USP22Q9UPT9 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
USP22Q9UPT9 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
USP22Q9UPT9 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
USP22Q9UPT9 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
USP22Q9UPT9 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
USP22Q9UPT9 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
USP22Q9UPT9 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
USP22Q9UPT9 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
USP22Q9UPT9 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
USP22Q9UPT9 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
USP22Q9UPT9 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
USP22Q9UPT9 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
USP22Q9UPT9 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
USP22Q9UPT9 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
USP22Q9UPT9 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
USP22Q9UPT9 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
USP22Q9UPT9 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
USP22Q9UPT9 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
USP22Q9UPT9 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
USP22Q9UPT9 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
USP22Q9UPT9 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
USP22Q9UPT9 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
USP22Q9UPT9 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
USP22Q9UPT9 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
USP22Q9UPT9 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
USP22Q9UPT9 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
USP22Q9UPT9 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
USP22Q9UPT9 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
USP22Q9UPT9 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
USP22Q9UPT9 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
USP22Q9UPT9 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
USP22Q9UPT9 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
USP22Q9UPT9 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
USP22Q9UPT9 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
USP22Q9UPT9 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.5 ms