Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPQ3

AGAP1, Arf-GAP with GTPase, ANK repeat and PH domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 857 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AGAP1Q9UPQ3 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
AGAP1Q9UPQ3 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
AGAP1Q9UPQ3 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
AGAP1Q9UPQ3 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
AGAP1Q9UPQ3 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
AGAP1Q9UPQ3 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
AGAP1Q9UPQ3 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
AGAP1Q9UPQ3 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
AGAP1Q9UPQ3 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
AGAP1Q9UPQ3 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
AGAP1Q9UPQ3 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
AGAP1Q9UPQ3 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
AGAP1Q9UPQ3 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
AGAP1Q9UPQ3 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.68
AGAP1Q9UPQ3 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC25.51■■□□□ 1.67
AGAP1Q9UPQ3 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
AGAP1Q9UPQ3 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
AGAP1Q9UPQ3 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
AGAP1Q9UPQ3 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
AGAP1Q9UPQ3 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
AGAP1Q9UPQ3 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
AGAP1Q9UPQ3 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
AGAP1Q9UPQ3 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
AGAP1Q9UPQ3 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
AGAP1Q9UPQ3 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
AGAP1Q9UPQ3 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
AGAP1Q9UPQ3 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
AGAP1Q9UPQ3 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
AGAP1Q9UPQ3 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
AGAP1Q9UPQ3 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
AGAP1Q9UPQ3 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC25.49■■□□□ 1.67
AGAP1Q9UPQ3 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
AGAP1Q9UPQ3 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
AGAP1Q9UPQ3 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
AGAP1Q9UPQ3 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
AGAP1Q9UPQ3 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
AGAP1Q9UPQ3 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC25.48■■□□□ 1.67
AGAP1Q9UPQ3 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC25.48■■□□□ 1.67
AGAP1Q9UPQ3 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
AGAP1Q9UPQ3 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
AGAP1Q9UPQ3 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
AGAP1Q9UPQ3 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
AGAP1Q9UPQ3 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
AGAP1Q9UPQ3 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
AGAP1Q9UPQ3 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
AGAP1Q9UPQ3 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
AGAP1Q9UPQ3 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
AGAP1Q9UPQ3 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
AGAP1Q9UPQ3 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
AGAP1Q9UPQ3 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
AGAP1Q9UPQ3 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
AGAP1Q9UPQ3 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
AGAP1Q9UPQ3 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
AGAP1Q9UPQ3 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
AGAP1Q9UPQ3 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
AGAP1Q9UPQ3 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
AGAP1Q9UPQ3 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC25.45■■□□□ 1.66
AGAP1Q9UPQ3 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
AGAP1Q9UPQ3 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
AGAP1Q9UPQ3 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
AGAP1Q9UPQ3 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
AGAP1Q9UPQ3 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC25.44■■□□□ 1.66
AGAP1Q9UPQ3 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
AGAP1Q9UPQ3 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
AGAP1Q9UPQ3 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
AGAP1Q9UPQ3 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
AGAP1Q9UPQ3 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
AGAP1Q9UPQ3 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
AGAP1Q9UPQ3 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC25.44■■□□□ 1.66
AGAP1Q9UPQ3 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
AGAP1Q9UPQ3 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
AGAP1Q9UPQ3 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
AGAP1Q9UPQ3 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
AGAP1Q9UPQ3 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
AGAP1Q9UPQ3 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
AGAP1Q9UPQ3 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
AGAP1Q9UPQ3 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
AGAP1Q9UPQ3 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
AGAP1Q9UPQ3 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
AGAP1Q9UPQ3 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
AGAP1Q9UPQ3 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
AGAP1Q9UPQ3 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
AGAP1Q9UPQ3 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
AGAP1Q9UPQ3 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
AGAP1Q9UPQ3 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
AGAP1Q9UPQ3 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
AGAP1Q9UPQ3 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
AGAP1Q9UPQ3 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
AGAP1Q9UPQ3 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
AGAP1Q9UPQ3 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
AGAP1Q9UPQ3 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
AGAP1Q9UPQ3 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
AGAP1Q9UPQ3 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
AGAP1Q9UPQ3 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
AGAP1Q9UPQ3 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
AGAP1Q9UPQ3 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
AGAP1Q9UPQ3 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
AGAP1Q9UPQ3 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
AGAP1Q9UPQ3 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
AGAP1Q9UPQ3 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.7 ms