Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPE1

SRPK3, SRSF protein kinase 3, humanhuman

Predictions only

Length 567 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRPK3Q9UPE1 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SRPK3Q9UPE1 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
SRPK3Q9UPE1 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
SRPK3Q9UPE1 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
SRPK3Q9UPE1 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SRPK3Q9UPE1 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SRPK3Q9UPE1 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SRPK3Q9UPE1 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SRPK3Q9UPE1 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SRPK3Q9UPE1 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SRPK3Q9UPE1 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SRPK3Q9UPE1 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SRPK3Q9UPE1 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SRPK3Q9UPE1 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SRPK3Q9UPE1 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SRPK3Q9UPE1 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SRPK3Q9UPE1 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SRPK3Q9UPE1 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SRPK3Q9UPE1 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SRPK3Q9UPE1 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SRPK3Q9UPE1 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SRPK3Q9UPE1 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SRPK3Q9UPE1 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SRPK3Q9UPE1 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SRPK3Q9UPE1 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SRPK3Q9UPE1 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SRPK3Q9UPE1 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SRPK3Q9UPE1 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SRPK3Q9UPE1 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SRPK3Q9UPE1 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SRPK3Q9UPE1 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SRPK3Q9UPE1 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SRPK3Q9UPE1 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SRPK3Q9UPE1 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
SRPK3Q9UPE1 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SRPK3Q9UPE1 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SRPK3Q9UPE1 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SRPK3Q9UPE1 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SRPK3Q9UPE1 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SRPK3Q9UPE1 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SRPK3Q9UPE1 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SRPK3Q9UPE1 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SRPK3Q9UPE1 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SRPK3Q9UPE1 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SRPK3Q9UPE1 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SRPK3Q9UPE1 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SRPK3Q9UPE1 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SRPK3Q9UPE1 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SRPK3Q9UPE1 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SRPK3Q9UPE1 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SRPK3Q9UPE1 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SRPK3Q9UPE1 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SRPK3Q9UPE1 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SRPK3Q9UPE1 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SRPK3Q9UPE1 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SRPK3Q9UPE1 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SRPK3Q9UPE1 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SRPK3Q9UPE1 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SRPK3Q9UPE1 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
SRPK3Q9UPE1 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
SRPK3Q9UPE1 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
SRPK3Q9UPE1 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SRPK3Q9UPE1 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SRPK3Q9UPE1 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SRPK3Q9UPE1 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SRPK3Q9UPE1 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SRPK3Q9UPE1 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SRPK3Q9UPE1 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SRPK3Q9UPE1 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SRPK3Q9UPE1 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SRPK3Q9UPE1 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SRPK3Q9UPE1 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SRPK3Q9UPE1 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SRPK3Q9UPE1 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SRPK3Q9UPE1 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SRPK3Q9UPE1 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SRPK3Q9UPE1 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
SRPK3Q9UPE1 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SRPK3Q9UPE1 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SRPK3Q9UPE1 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SRPK3Q9UPE1 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SRPK3Q9UPE1 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SRPK3Q9UPE1 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SRPK3Q9UPE1 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SRPK3Q9UPE1 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SRPK3Q9UPE1 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SRPK3Q9UPE1 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SRPK3Q9UPE1 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SRPK3Q9UPE1 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SRPK3Q9UPE1 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
SRPK3Q9UPE1 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SRPK3Q9UPE1 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SRPK3Q9UPE1 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SRPK3Q9UPE1 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SRPK3Q9UPE1 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SRPK3Q9UPE1 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SRPK3Q9UPE1 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SRPK3Q9UPE1 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SRPK3Q9UPE1 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
SRPK3Q9UPE1 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.1 ms