Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULP0

NDRG4, Protein NDRG4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 352 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NDRG4Q9ULP0 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC21.66■■□□□ 1.06
NDRG4Q9ULP0 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
NDRG4Q9ULP0 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
NDRG4Q9ULP0 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
NDRG4Q9ULP0 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
NDRG4Q9ULP0 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
NDRG4Q9ULP0 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
NDRG4Q9ULP0 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
NDRG4Q9ULP0 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
NDRG4Q9ULP0 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
NDRG4Q9ULP0 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
NDRG4Q9ULP0 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
NDRG4Q9ULP0 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
NDRG4Q9ULP0 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
NDRG4Q9ULP0 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
NDRG4Q9ULP0 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
NDRG4Q9ULP0 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
NDRG4Q9ULP0 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
NDRG4Q9ULP0 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
NDRG4Q9ULP0 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
NDRG4Q9ULP0 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
NDRG4Q9ULP0 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
NDRG4Q9ULP0 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
NDRG4Q9ULP0 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
NDRG4Q9ULP0 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
NDRG4Q9ULP0 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
NDRG4Q9ULP0 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
NDRG4Q9ULP0 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
NDRG4Q9ULP0 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
NDRG4Q9ULP0 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
NDRG4Q9ULP0 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
NDRG4Q9ULP0 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
NDRG4Q9ULP0 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
NDRG4Q9ULP0 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
NDRG4Q9ULP0 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
NDRG4Q9ULP0 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
NDRG4Q9ULP0 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
NDRG4Q9ULP0 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
NDRG4Q9ULP0 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
NDRG4Q9ULP0 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
NDRG4Q9ULP0 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
NDRG4Q9ULP0 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
NDRG4Q9ULP0 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
NDRG4Q9ULP0 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
NDRG4Q9ULP0 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
NDRG4Q9ULP0 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
NDRG4Q9ULP0 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
NDRG4Q9ULP0 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
NDRG4Q9ULP0 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
NDRG4Q9ULP0 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
NDRG4Q9ULP0 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
NDRG4Q9ULP0 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
NDRG4Q9ULP0 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC21.6■■□□□ 1.05
NDRG4Q9ULP0 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
NDRG4Q9ULP0 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
NDRG4Q9ULP0 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
NDRG4Q9ULP0 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
NDRG4Q9ULP0 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
NDRG4Q9ULP0 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
NDRG4Q9ULP0 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
NDRG4Q9ULP0 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
NDRG4Q9ULP0 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
NDRG4Q9ULP0 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
NDRG4Q9ULP0 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
NDRG4Q9ULP0 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
NDRG4Q9ULP0 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
NDRG4Q9ULP0 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
NDRG4Q9ULP0 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
NDRG4Q9ULP0 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
NDRG4Q9ULP0 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
NDRG4Q9ULP0 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
NDRG4Q9ULP0 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
NDRG4Q9ULP0 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
NDRG4Q9ULP0 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
NDRG4Q9ULP0 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
NDRG4Q9ULP0 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
NDRG4Q9ULP0 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
NDRG4Q9ULP0 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
NDRG4Q9ULP0 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
NDRG4Q9ULP0 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
NDRG4Q9ULP0 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
NDRG4Q9ULP0 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
NDRG4Q9ULP0 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
NDRG4Q9ULP0 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
NDRG4Q9ULP0 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
NDRG4Q9ULP0 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
NDRG4Q9ULP0 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
NDRG4Q9ULP0 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
NDRG4Q9ULP0 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
NDRG4Q9ULP0 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
NDRG4Q9ULP0 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
NDRG4Q9ULP0 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
NDRG4Q9ULP0 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
NDRG4Q9ULP0 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
NDRG4Q9ULP0 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
NDRG4Q9ULP0 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
NDRG4Q9ULP0 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
NDRG4Q9ULP0 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
NDRG4Q9ULP0 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
NDRG4Q9ULP0 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.8 ms