Protein–RNA interactions for Protein: Q9UL63

MKLN1, Muskelin, humanhuman

Predictions only

Length 735 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MKLN1Q9UL63 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
MKLN1Q9UL63 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
MKLN1Q9UL63 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
MKLN1Q9UL63 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
MKLN1Q9UL63 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
MKLN1Q9UL63 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
MKLN1Q9UL63 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
MKLN1Q9UL63 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
MKLN1Q9UL63 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
MKLN1Q9UL63 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
MKLN1Q9UL63 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
MKLN1Q9UL63 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
MKLN1Q9UL63 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
MKLN1Q9UL63 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
MKLN1Q9UL63 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
MKLN1Q9UL63 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
MKLN1Q9UL63 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
MKLN1Q9UL63 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
MKLN1Q9UL63 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
MKLN1Q9UL63 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
MKLN1Q9UL63 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
MKLN1Q9UL63 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
MKLN1Q9UL63 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
MKLN1Q9UL63 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
MKLN1Q9UL63 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
MKLN1Q9UL63 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
MKLN1Q9UL63 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
MKLN1Q9UL63 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
MKLN1Q9UL63 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
MKLN1Q9UL63 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
MKLN1Q9UL63 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
MKLN1Q9UL63 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
MKLN1Q9UL63 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
MKLN1Q9UL63 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
MKLN1Q9UL63 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
MKLN1Q9UL63 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
MKLN1Q9UL63 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
MKLN1Q9UL63 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
MKLN1Q9UL63 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
MKLN1Q9UL63 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
MKLN1Q9UL63 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
MKLN1Q9UL63 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
MKLN1Q9UL63 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
MKLN1Q9UL63 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
MKLN1Q9UL63 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
MKLN1Q9UL63 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
MKLN1Q9UL63 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
MKLN1Q9UL63 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
MKLN1Q9UL63 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
MKLN1Q9UL63 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
MKLN1Q9UL63 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
MKLN1Q9UL63 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
MKLN1Q9UL63 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
MKLN1Q9UL63 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
MKLN1Q9UL63 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
MKLN1Q9UL63 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
MKLN1Q9UL63 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
MKLN1Q9UL63 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
MKLN1Q9UL63 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
MKLN1Q9UL63 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
MKLN1Q9UL63 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
MKLN1Q9UL63 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
MKLN1Q9UL63 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
MKLN1Q9UL63 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
MKLN1Q9UL63 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
MKLN1Q9UL63 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
MKLN1Q9UL63 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
MKLN1Q9UL63 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
MKLN1Q9UL63 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
MKLN1Q9UL63 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
MKLN1Q9UL63 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
MKLN1Q9UL63 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
MKLN1Q9UL63 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
MKLN1Q9UL63 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
MKLN1Q9UL63 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
MKLN1Q9UL63 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
MKLN1Q9UL63 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
MKLN1Q9UL63 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
MKLN1Q9UL63 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC21.91■■□□□ 1.1
MKLN1Q9UL63 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
MKLN1Q9UL63 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
MKLN1Q9UL63 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
MKLN1Q9UL63 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
MKLN1Q9UL63 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
MKLN1Q9UL63 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
MKLN1Q9UL63 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
MKLN1Q9UL63 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
MKLN1Q9UL63 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
MKLN1Q9UL63 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
MKLN1Q9UL63 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
MKLN1Q9UL63 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
MKLN1Q9UL63 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
MKLN1Q9UL63 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
MKLN1Q9UL63 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
MKLN1Q9UL63 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
MKLN1Q9UL63 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
MKLN1Q9UL63 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
MKLN1Q9UL63 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
MKLN1Q9UL63 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
MKLN1Q9UL63 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.2 ms