Protein–RNA interactions for Protein: Q9UL01

DSE, Dermatan-sulfate epimerase, humanhuman

Predictions only

Length 958 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DSEQ9UL01 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
DSEQ9UL01 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
DSEQ9UL01 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
DSEQ9UL01 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
DSEQ9UL01 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
DSEQ9UL01 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
DSEQ9UL01 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
DSEQ9UL01 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
DSEQ9UL01 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
DSEQ9UL01 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
DSEQ9UL01 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
DSEQ9UL01 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
DSEQ9UL01 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
DSEQ9UL01 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
DSEQ9UL01 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
DSEQ9UL01 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
DSEQ9UL01 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
DSEQ9UL01 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
DSEQ9UL01 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
DSEQ9UL01 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
DSEQ9UL01 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
DSEQ9UL01 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
DSEQ9UL01 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
DSEQ9UL01 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
DSEQ9UL01 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
DSEQ9UL01 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
DSEQ9UL01 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
DSEQ9UL01 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
DSEQ9UL01 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
DSEQ9UL01 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
DSEQ9UL01 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
DSEQ9UL01 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
DSEQ9UL01 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
DSEQ9UL01 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
DSEQ9UL01 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC25.18■■□□□ 1.62
DSEQ9UL01 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
DSEQ9UL01 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
DSEQ9UL01 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
DSEQ9UL01 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
DSEQ9UL01 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
DSEQ9UL01 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
DSEQ9UL01 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
DSEQ9UL01 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
DSEQ9UL01 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
DSEQ9UL01 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
DSEQ9UL01 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
DSEQ9UL01 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
DSEQ9UL01 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
DSEQ9UL01 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
DSEQ9UL01 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
DSEQ9UL01 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
DSEQ9UL01 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
DSEQ9UL01 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
DSEQ9UL01 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
DSEQ9UL01 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
DSEQ9UL01 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.61
DSEQ9UL01 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
DSEQ9UL01 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
DSEQ9UL01 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
DSEQ9UL01 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
DSEQ9UL01 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC25.13■■□□□ 1.61
DSEQ9UL01 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
DSEQ9UL01 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
DSEQ9UL01 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
DSEQ9UL01 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
DSEQ9UL01 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
DSEQ9UL01 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
DSEQ9UL01 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
DSEQ9UL01 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
DSEQ9UL01 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
DSEQ9UL01 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
DSEQ9UL01 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
DSEQ9UL01 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
DSEQ9UL01 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
DSEQ9UL01 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
DSEQ9UL01 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
DSEQ9UL01 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
DSEQ9UL01 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
DSEQ9UL01 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
DSEQ9UL01 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC25.1■■□□□ 1.61
DSEQ9UL01 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
DSEQ9UL01 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
DSEQ9UL01 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
DSEQ9UL01 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
DSEQ9UL01 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC25.09■■□□□ 1.61
DSEQ9UL01 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC25.09■■□□□ 1.61
DSEQ9UL01 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
DSEQ9UL01 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
DSEQ9UL01 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
DSEQ9UL01 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
DSEQ9UL01 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
DSEQ9UL01 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
DSEQ9UL01 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
DSEQ9UL01 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
DSEQ9UL01 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
DSEQ9UL01 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
DSEQ9UL01 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
DSEQ9UL01 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC25.08■■□□□ 1.61
DSEQ9UL01 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
DSEQ9UL01 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 131.9 ms