Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKI3

VPREB3, Pre-B lymphocyte protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 123 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VPREB3Q9UKI3 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
VPREB3Q9UKI3 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
VPREB3Q9UKI3 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
VPREB3Q9UKI3 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
VPREB3Q9UKI3 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC18.85■□□□□ 0.61
VPREB3Q9UKI3 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
VPREB3Q9UKI3 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
VPREB3Q9UKI3 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
VPREB3Q9UKI3 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
VPREB3Q9UKI3 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
VPREB3Q9UKI3 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC18.84■□□□□ 0.61
VPREB3Q9UKI3 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
VPREB3Q9UKI3 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
VPREB3Q9UKI3 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.61
VPREB3Q9UKI3 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC18.83■□□□□ 0.6
VPREB3Q9UKI3 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
VPREB3Q9UKI3 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
VPREB3Q9UKI3 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC18.83■□□□□ 0.6
VPREB3Q9UKI3 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
VPREB3Q9UKI3 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
VPREB3Q9UKI3 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
VPREB3Q9UKI3 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
VPREB3Q9UKI3 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
VPREB3Q9UKI3 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
VPREB3Q9UKI3 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
VPREB3Q9UKI3 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
VPREB3Q9UKI3 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
VPREB3Q9UKI3 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
VPREB3Q9UKI3 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
VPREB3Q9UKI3 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
VPREB3Q9UKI3 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
VPREB3Q9UKI3 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC18.82■□□□□ 0.6
VPREB3Q9UKI3 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
VPREB3Q9UKI3 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
VPREB3Q9UKI3 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
VPREB3Q9UKI3 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
VPREB3Q9UKI3 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
VPREB3Q9UKI3 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
VPREB3Q9UKI3 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
VPREB3Q9UKI3 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
VPREB3Q9UKI3 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
VPREB3Q9UKI3 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
VPREB3Q9UKI3 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
VPREB3Q9UKI3 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
VPREB3Q9UKI3 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
VPREB3Q9UKI3 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
VPREB3Q9UKI3 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
VPREB3Q9UKI3 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
VPREB3Q9UKI3 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
VPREB3Q9UKI3 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
VPREB3Q9UKI3 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
VPREB3Q9UKI3 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
VPREB3Q9UKI3 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
VPREB3Q9UKI3 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
VPREB3Q9UKI3 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
VPREB3Q9UKI3 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC18.8■□□□□ 0.6
VPREB3Q9UKI3 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
VPREB3Q9UKI3 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
VPREB3Q9UKI3 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
VPREB3Q9UKI3 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC18.79■□□□□ 0.6
VPREB3Q9UKI3 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
VPREB3Q9UKI3 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
VPREB3Q9UKI3 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
VPREB3Q9UKI3 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
VPREB3Q9UKI3 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
VPREB3Q9UKI3 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
VPREB3Q9UKI3 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
VPREB3Q9UKI3 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
VPREB3Q9UKI3 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
VPREB3Q9UKI3 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
VPREB3Q9UKI3 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
VPREB3Q9UKI3 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
VPREB3Q9UKI3 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
VPREB3Q9UKI3 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
VPREB3Q9UKI3 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
VPREB3Q9UKI3 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
VPREB3Q9UKI3 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.6
VPREB3Q9UKI3 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.6
VPREB3Q9UKI3 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
VPREB3Q9UKI3 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
VPREB3Q9UKI3 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
VPREB3Q9UKI3 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
VPREB3Q9UKI3 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
VPREB3Q9UKI3 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.59
VPREB3Q9UKI3 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.59
VPREB3Q9UKI3 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
VPREB3Q9UKI3 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.59
VPREB3Q9UKI3 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
VPREB3Q9UKI3 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
VPREB3Q9UKI3 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
VPREB3Q9UKI3 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
VPREB3Q9UKI3 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
VPREB3Q9UKI3 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
VPREB3Q9UKI3 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
VPREB3Q9UKI3 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
VPREB3Q9UKI3 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
VPREB3Q9UKI3 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
VPREB3Q9UKI3 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
VPREB3Q9UKI3 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
VPREB3Q9UKI3 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 73.8 ms