Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJQ4

SALL4, Sal-like protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,053 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SALL4Q9UJQ4 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
SALL4Q9UJQ4 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
SALL4Q9UJQ4 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
SALL4Q9UJQ4 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
SALL4Q9UJQ4 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
SALL4Q9UJQ4 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
SALL4Q9UJQ4 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
SALL4Q9UJQ4 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.61
SALL4Q9UJQ4 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.61
SALL4Q9UJQ4 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
SALL4Q9UJQ4 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
SALL4Q9UJQ4 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
SALL4Q9UJQ4 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
SALL4Q9UJQ4 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
SALL4Q9UJQ4 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
SALL4Q9UJQ4 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
SALL4Q9UJQ4 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC25.12■■□□□ 1.61
SALL4Q9UJQ4 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
SALL4Q9UJQ4 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
SALL4Q9UJQ4 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
SALL4Q9UJQ4 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
SALL4Q9UJQ4 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
SALL4Q9UJQ4 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
SALL4Q9UJQ4 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
SALL4Q9UJQ4 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
SALL4Q9UJQ4 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
SALL4Q9UJQ4 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
SALL4Q9UJQ4 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
SALL4Q9UJQ4 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC25.11■■□□□ 1.61
SALL4Q9UJQ4 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
SALL4Q9UJQ4 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
SALL4Q9UJQ4 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
SALL4Q9UJQ4 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
SALL4Q9UJQ4 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
SALL4Q9UJQ4 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
SALL4Q9UJQ4 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
SALL4Q9UJQ4 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
SALL4Q9UJQ4 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
SALL4Q9UJQ4 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
SALL4Q9UJQ4 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
SALL4Q9UJQ4 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
SALL4Q9UJQ4 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
SALL4Q9UJQ4 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
SALL4Q9UJQ4 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
SALL4Q9UJQ4 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
SALL4Q9UJQ4 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
SALL4Q9UJQ4 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
SALL4Q9UJQ4 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
SALL4Q9UJQ4 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
SALL4Q9UJQ4 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
SALL4Q9UJQ4 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
SALL4Q9UJQ4 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
SALL4Q9UJQ4 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
SALL4Q9UJQ4 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
SALL4Q9UJQ4 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
SALL4Q9UJQ4 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
SALL4Q9UJQ4 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
SALL4Q9UJQ4 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
SALL4Q9UJQ4 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC25.08■■□□□ 1.61
SALL4Q9UJQ4 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC25.08■■□□□ 1.61
SALL4Q9UJQ4 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.6
SALL4Q9UJQ4 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
SALL4Q9UJQ4 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
SALL4Q9UJQ4 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
SALL4Q9UJQ4 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
SALL4Q9UJQ4 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
SALL4Q9UJQ4 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
SALL4Q9UJQ4 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
SALL4Q9UJQ4 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
SALL4Q9UJQ4 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
SALL4Q9UJQ4 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
SALL4Q9UJQ4 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
SALL4Q9UJQ4 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
SALL4Q9UJQ4 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
SALL4Q9UJQ4 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
SALL4Q9UJQ4 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
SALL4Q9UJQ4 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
SALL4Q9UJQ4 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
SALL4Q9UJQ4 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
SALL4Q9UJQ4 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
SALL4Q9UJQ4 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
SALL4Q9UJQ4 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
SALL4Q9UJQ4 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
SALL4Q9UJQ4 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
SALL4Q9UJQ4 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
SALL4Q9UJQ4 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
SALL4Q9UJQ4 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
SALL4Q9UJQ4 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
SALL4Q9UJQ4 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
SALL4Q9UJQ4 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
SALL4Q9UJQ4 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
SALL4Q9UJQ4 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
SALL4Q9UJQ4 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
SALL4Q9UJQ4 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
SALL4Q9UJQ4 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
SALL4Q9UJQ4 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
SALL4Q9UJQ4 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
SALL4Q9UJQ4 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
SALL4Q9UJQ4 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
SALL4Q9UJQ4 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 86.4 ms